DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment HERC1 and herc1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_016878188.1 Gene:HERC1 / 8925 HGNCID:4867 Length:4909 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_009301513.1 Gene:herc1 / 336598 ZFINID:ZDB-GENE-030131-8542 Length:4867 Species:Danio rerio


Alignment Length:4966 Identity:3952/4966 - (79%)
Similarity:4363/4966 - (87%) Gaps:156/4966 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MATMIPPVKLKWLEHLNSSWITEDSESIATREGVAVLYSKLVSNKEVVPLPQQVLCLKGPQLPDF 65
            ||.||||||||||||||||||:||||||:||||||:||.||::|||||.||||||||||||||||
Zfish     1 MAAMIPPVKLKWLEHLNSSWISEDSESISTREGVALLYGKLLTNKEVVVLPQQVLCLKGPQLPDF 65

Human    66 ERESLSSDEQDHYLDALLSSQLALAKMVCSDSPFAGALRKRLLVLQRVFYALSNKYHDKGKVKQQ 130
            |||.||||||:|||||||:|||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 ERECLSSDEQEHYLDALLASQLALAKTVCSDSPFATALRKRLLVLQRVFYALSNKYHDKGKVKQQ 130

Human   131 QHSPESSSGSADVHSVSERPRSSTDALIEMGVRTGLSLLFALLRQSWMMPVSGPGLSLCNDVIHT 195
            |||.|::.||||:.:||||||||||||||||||||||||||||||||.:|.:|||::||||||.|
Zfish   131 QHSTENTMGSADLQAVSERPRSSTDALIEMGVRTGLSLLFALLRQSWTLPPAGPGINLCNDVITT 195

Human   196 AIEVVSSLPPLSLANESKIPPMGLDCLSQVTTFLKGVTIPNSGADTLGRRLASELLLGLAAQRGS 260
            |||||.|||||||||||||||||||||:|||:||||||:.|||||.:|||||.||||||||||||
Zfish   196 AIEVVGSLPPLSLANESKIPPMGLDCLAQVTSFLKGVTMRNSGADVVGRRLACELLLGLAAQRGS 260

Human   261 LRYLLEWIEMALGASAVVHTMEKGKLLSSQEGMISFDCFMTILMQMRRSLGSSADRSQWREPTRT 325
            |||||||:||||.|||.|.::|:     ||||::.:||||.||||||||||||||||||||||||
Zfish   261 LRYLLEWVEMALAASAGVSSLEQ-----SQEGLMGYDCFMNILMQMRRSLGSSADRSQWREPTRT 320

Human   326 SDGLCSLYEAALCLFEEVCRMASDYSRTCASPDSIQTGDAPIVSETCEVYVWGSNSSHQLVEGTQ 390
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:|.:|||||||||||||||||||||||
Zfish   321 ADGLCSLYEAALCLFEEVCRMASDYSRTCASPDSIQAGEAAMVSETCEVYVWGSNSSHQLVEGTQ 385

Human   391 EKILQPKLAPSFSDAQTIEAGQYCTFVISTDGSVRACGKGSYGRLGLGDSNNQSTLKKLTFEPHR 455
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   386 EKILQPKLAPSFSDAQTIEAGQYCTFVISSDGSVRACGKGSYGRLGLGDSNNQSTLKKLTFEPHR 450

Human   456 SIKKVSSSKGSDGHTLAFTTEGEVFSWGDGDYGKLGHGNSSTQKYPKLIQGPLQGKVVVCVSAGY 520
            :||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   451 AIKKVSSSKGSDGHTLAFTSEGEVFSWGDGDYGKLGHGNSSTQKYPKLIQGPLQGKVVVCVSAGY 515

Human   521 RHSAAVTEDGELYTWGEGDFGRLGHGDSNSRNIPTLVKDISNVGEVSCGSSHTIALSKDGRTVWS 585
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   516 RHSAAVSEDGELYTWGEGDFGRLGHGDSNSRNIPTLVKDISNVGEVSCGSSHTIALSKDGRTVWS 580

Human   586 FGGGDNGKLGHGDTNRVYKPKVIEALQGMFIRKVCAGSQSSLALTSTGQVYAWGCGACLGCGSSE 650
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   581 FGGGDNGKLGHGDTNRVYKPKVVEALQGMFIRKVCAGSQSSLALTSTGQVYAWGCGACLGCGSSE 645

Human   651 ATALRPKLIEELAATRIVDVSIGDSHCLALSHDNEVYAWGNNSMGQCGQGNSTGPITKPKKVSGL 715
            |||||||||||||.||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Zfish   646 ATALRPKLIEELATTRVVDISIGDSHCLALSHDNEVYAWGNNSMGQCGQGNSTGPITKPKKVIGL 710

Human   716 DGIAIQQISAGTSHSLAWTALPRDRQVVAWHRPYCVDLEESTFSHLRSFLERYCDKINSEIPPLP 780
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:||||||
Zfish   711 DGVAIQQISAGTSHSLAWTALPRDRQVVAWHRPYCVDLEESTFSHLRSFLERYCDGINNEIPPLP 775

Human   781 FPSSREHHSFLKLCLKLLSNHLALALAGGVATSILGRQAGPLRNLLFRLMDSTVPDEIQEVVIET 845
            ||||:|||:||||||:|||||||||||||||||||||||.|||||||||||::|||||||.||||
Zfish   776 FPSSKEHHNFLKLCLRLLSNHLALALAGGVATSILGRQARPLRNLLFRLMDASVPDEIQEAVIET 840

Human   846 LSVGATMLLPPLRERMELLHSLLPQGPDRWESLSKGQRMQLDIILTSLQDHTHVASLLGYSSPSD 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|
Zfish   841 LSVGATMLLPPLRERMELLHSLLPQGPDRWESLSKGQRMQLDIILTSLQDHTHVASLLGYSCPPD 905

Human   911 AADLSSVCTGYGNLSDQPY--GTQS-CHPDTHLAEILMKTLLRNLGFYTDQAFGELEKNSDKFLL 972
            |::..:      ..||..:  ||.| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Zfish   906 ASEPPA------QPSDSTHVPGTHSDTHPDTHLAEILMKTLLRNLGFYTDQAFGELEKNSDKILQ 964

Human   973 GTSSSENSQPAHLHELLCSLQKQLLAFCHINNISENSSSVALLHKHLQLLLPHATDIYSRSANLL 1037
            |||||::|||||||||||||||||||:||||:::|.|||||||||||||||||||||::|||.||
Zfish   965 GTSSSDSSQPAHLHELLCSLQKQLLAYCHINSVTEGSSSVALLHKHLQLLLPHATDIFNRSATLL 1029

Human  1038 KESPWNGSVGEKLRDVIYVSAAGSMLCQIVNSLLLLPVSVARPLLSYLLDLLPPLDCLNRLLPAA 1102
            :||..||||.||||||||:|||||||||||.|||||||.|||||||:|||||||||.||:|||||
Zfish  1030 RESSGNGSVREKLRDVIYMSAAGSMLCQIVTSLLLLPVWVARPLLSFLLDLLPPLDRLNKLLPAA 1094

Human  1103 DLLEDQELQWPLHGGPELIDPAGLPLPQPAQSWVWLVDLERTIALLIGRCLGGMLQGSPVSPEEQ 1167
            ..||:|||||||||.|:|:||  :.:..||||||||||||||.|||:||||||||||:..|.|||
Zfish  1095 TPLEEQELQWPLHGSPDLVDP--VCVSGPAQSWVWLVDLERTAALLVGRCLGGMLQGAAPSAEEQ 1157

Human  1168 DTAYWMKTPLFSDGVEMDTPQLDKCMSCLLEVALSGNEEQKPFDYKLRPEIAVYVDLALGCSKEP 1232
            .|.:|:||||||:|:|.:.||||.|:|.||||||.|||||:|||.:||.:::|.||||||.:|||
Zfish  1158 HTTHWLKTPLFSNGLETEIPQLDACISSLLEVALCGNEEQRPFDCQLRADMSVLVDLALGSTKEP 1222

Human  1233 ARSLWISMQDYAVSKDWDSATLSNESLLDTVSRFVLAALLKHTNLLSQACGESRYQPGKHLSEVY 1297
            ..|||.:|||||:|||||||:|.||:|||||||||||.|||||.||.|||||.||||.|.|:|||
Zfish  1223 THSLWSNMQDYAISKDWDSASLPNEALLDTVSRFVLAVLLKHTGLLGQACGEGRYQPCKLLAEVY 1287

Human  1298 RCVYKVRSRLLACKNLELIQTRSSSRDRWISENQDSADVDPQEHSFTRTIDEEAEMEEQ-AERDR 1361
            |.|||||:|||||||:||||||||||:|.||:|.||.::||||||||||||||||:||: .||:|
Zfish  1288 RSVYKVRNRLLACKNMELIQTRSSSRERRISDNVDSVEMDPQEHSFTRTIDEEAELEERDRERER 1352

Human  1362 EEGHPEPEDEEEEREHEVMTAGNLVFVLHVTEIFQCFLSAREVARSRDRDRMNSGAGSGARADDP 1426
            ||||.|.|||||||||||||||         :||||||||||.||.|||||..|     ....:.
Zfish  1353 EEGHQEQEDEEEEREHEVMTAG---------KIFQCFLSAREAARGRDRDRTGS-----MSVQEE 1403

Human  1427 PPQSQQERRVSTDLPEGQDVYTAACNSVIHRCALLILGVS-PVIDELQKRREEGQLQQPSTSA-- 1488
            |||...|||.|:...||||:||.:||:||||||:|:|.:| |:...:.        |||.|..  
Zfish  1404 PPQPGPERRNSSTPQEGQDLYTTSCNAVIHRCAMLLLALSTPLAQHIN--------QQPLTGGVN 1460

Human  1489 SEGGGLMTRSESLTAESRLVHTSPNYRLIKSRSESDLSQPESDEEGYALSGRRNVDLDLAASHRK 1553
            .:|.|.|||||||:||||.:|:||:.||.||||||||||||||||||:|:.|||||||||.:.:|
Zfish  1461 QDGVGFMTRSESLSAESRSIHSSPSCRLTKSRSESDLSQPESDEEGYSLNARRNVDLDLAFTPKK 1525

Human  1554 RVYLLLFGQLSPRKKKSFKQVHDGPMHSQLESLSDSWARLKHSRDWLCNSSYSF-ESDFDLTKSL 1617
            |                      |.::|..:|.:| |...:.:|:...:|..|: |||.||.:||
Zfish  1526 R----------------------GFLYSSPDSSAD-WFGGRLARECFYSSQQSYDESDLDLNQSL 1567

Human  1618 GVHTLIENVVSFVSGDVGNAPGFKEPEESMSTSPQASIIAMEQQQLRAELRLEALHQILVLLSGM 1682
            .:|.||||:|:|:||||||||.|||||||:||||||.||||||||.||||||||||||:||:|||
Zfish  1568 RLHALIENIVNFISGDVGNAPAFKEPEESVSTSPQAIIIAMEQQQSRAELRLEALHQIVVLISGM 1632

Human  1683 EEKGSISLAGS-RLSSGFQSSTLLTSVRLQFLAGCFGLGTVGHTGGKGESGRLHHYQDGIRAAKR 1746
            |||.|.:.:|: |....|.|::||||||||||:||||||.|.:.|.|||:.:|||||||:||||:
Zfish  1633 EEKSSQAGSGAGRTGLSFHSASLLTSVRLQFLSGCFGLGAVSYGGPKGENVQLHHYQDGVRAAKK 1697

Human  1747 NIQIEIQVAVHKIYQQLSATLERALQANKHHIEAQQRLLLVTVFALSVHYQPVDVSLAISTGLLN 1811
            ::|:|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||:
Zfish  1698 SLQMEIQTAVHKIYQQLSVTLERALQANKHHIEAQQRLLLVTVFALSVRYQPVDVSLAISSGLLD 1762

Human  1812 VLSQLCGTDTMLGQPLQLLPKTGVSQLSTALKVASTRLLQILAITTGTYADKLSPKVVQSLLDLL 1876
            ||||||||:|:|||.||||.|...||||||||||||||||||||:||||||:|||||||:|||||
Zfish  1763 VLSQLCGTETLLGQTLQLLQKPAGSQLSTALKVASTRLLQILAISTGTYADRLSPKVVQALLDLL 1827

Human  1877 CSQLKNLLSQ-TGVLHMASFGEGEQEDGEEEEKKVDSSGETEKKDFRAALRKQHAAELHLGDFLV 1940
            |||||.||:| .|...:||         .:.::|.|...:.:||||||.|||:|.||||||||||
Zfish  1828 CSQLKTLLAQAAGNSLIAS---------TDLQEKTDDCADAQKKDFRALLRKRHTAELHLGDFLV 1883

Human  1941 FLRRVVSSKAIQSKMASPKWTEVLLNIASQKCSSGIPLVGNLRTRLLALHVLEAVLPACESGVED 2005
            ||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Zfish  1884 FLRRVVSSKAIQSKMASPKWTEVLLNIAAQKCCSGIPLVGNLRTRLLALHVLEAVLPACESSVED 1948

Human  2006 DQMAQIVERLFSLLSDCMWETPIAQAKHAIQIKEKEQEIKLQKQGELEEEDENLPIQEVSFDPEK 2070
            .||.|:||||||||||||||.|:|||||.||:||:|||:||  |||.:||:||||||||:|||||
Zfish  1949 HQMTQVVERLFSLLSDCMWEAPVAQAKHTIQLKEREQELKL--QGETDEEEENLPIQEVTFDPEK 2011

Human  2071 AQCCLVENGQILTHGSGGKGYGLASTGVTSGCYQWKFYIVKENRGNEGTCVGVSRWPVHDFNHRT 2135
            ||||:||:||.||||||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  2012 AQCCVVESGQGLTHGSGGKGYGLASTGISSGCYQWKFYIVKENRGNEGTCVGVSRWPVHDFNHRT 2076

Human  2136 TSDMWLYRAYSGNLYHNGEQTLTLSSFTQGDFITCVLDMEARTISFGKNGEEPKLAFEDVDAAEL 2200
            |:||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||:||||||||||||||||||.||
Zfish  2077 TADMWLYRAYSGNLYHNGEQTLTLSSYTQGDYITCVLDMEARTVSFGKNGEEPKLAFEDVDATEL 2141

Human  2201 YPCVMFYSSNPGEKVKICDMQMRGTPRDLLPGDPICSPVAAVLAEATIQLIRILHRTDRWTYCIN 2265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||::|||..||
Zfish  2142 YPCVMFYSSNPGEKVKICDMQMRGTPRDLLPGDPICSPVATVLAEATTQLIRILHRSERWTQTIN 2206

Human  2266 KKMMERLHKIKICIKE-----SGQKLKKSRSVQSREENEMREEKESKEEEKGKHTRHGLADLSEL 2325
            ..:::||.:|:.|:::     ...:|:||||.|||||.:  |::|.:|||:|:..||..|:|.|.
Zfish  2207 HSILQRLQQIRSCLRDGAPPAGSTRLRKSRSAQSREEQD--EKEEEREEERGRSGRHAAAELPEA 2269

Human  2326 QLRTLCIEVWPVLAVIGGVDAGLRVGGRCVHKQTGRHATLLGVVKEGSTSAKVQWDEAEITISFP 2390
            .|||||.:||||||||||||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  2270 HLRTLCHQVWPVLAVIGGVDGGLRMGGRCVHKQTGRHATLLGVVKEGSTSAKVQWDEAEITISFP 2334

Human  2391 TFWSPSDTPLYNLEPCEPLPFDVARFRGLTASVLLDLTYLTGVHEDMGKQ-STKRHEKKHRHESE 2454
            |||||||||||||||.|||||||:|||||||::|||||.|..:.:|..|. |::|||::||||.:
Zfish  2335 TFWSPSDTPLYNLEPIEPLPFDVSRFRGLTAALLLDLTALASLQDDGTKSASSRRHERRHRHEQQ 2399

Human  2455 EKGDVEQ--KPESESALDMRTGLTSDDVKSQSTTSSKSENEIASFSLDPTLPSVESQHQITEGKR 2517
            |:.::|.  ||: |...|:|...:.|:|::::..:|:||:|:|:::.|.|      |....||:|
Zfish  2400 EEREIEPRGKPK-EGTGDLRVSHSLDEVRARAPPNSRSESELAAYTQDAT------QQTPAEGRR 2457

Human  2518 KNHEHM----SKNHDVAQSEIRAVQLSYLYLGAMKSLSALLGCSKYAELLLIPKVLAENGHNSDC 2578
            :..|.:    |....|||:|:.|||||||||||||:||.||.|||||||||||||..::|||:||
Zfish  2458 RLQEMVGSRGSSQEAVAQAEVHAVQLSYLYLGAMKTLSVLLSCSKYAELLLIPKVTPDSGHNADC 2522

Human  2579 ASS--PVVHEDVEMRAALQFLMRHMVKRAVMRSPIKRALGLADLERAQAMIYKLVVHGLLEDQFG 2641
            ||.  .|..|:.|:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||:| .
Zfish  2523 ASPGVSVCQEEAELRSALQFLMRHMVKRAVMRSPIKRALGLADLERAQAMIYKLVVNSLLEEQ-E 2586

Human  2642 GKIKQEIDQQAEESDPAQQAQTPVTTSPSASSTTSFMSSSLEDTTTATTPVTDTETVPASESPGV 2706
            |:..:.:|.:.||.:..||.||||||||||||:||||||||||||||||||||.||.||||||||
Zfish  2587 GQSSKPVDTECEELEGEQQFQTPVTTSPSASSSTSFMSSSLEDTTTATTPVTDAETAPASESPGV 2651

Human  2707 MPLSLLRQMFSSYPTTTVLPTRRAQTPPISSLPTSPSDEVGRRQSLTSPDSQSARPANRTALSDP 2771
            |||||||||||||||||:||.|||||||:||||||||||.|||||||||:||.||..:|||||||
Zfish  2652 MPLSLLRQMFSSYPTTTLLPARRAQTPPVSSLPTSPSDEHGRRQSLTSPESQPARTTSRTALSDP 2716

Human  2772 SSRLSTSPPPPAIAVPLLEMGFSLRQIAKAMEATGARGEADAQNITVLAMWMIEHPGHEDEEEPQ 2836
            |||||||||||||||||||||||||||.||:||||||||||||||||||||||:|||..|.||  
Zfish  2717 SSRLSTSPPPPAIAVPLLEMGFSLRQIMKALEATGARGEADAQNITVLAMWMIDHPGTADSEE-- 2779

Human  2837 SGSTADSRPGAAVLGSGGKSNDPCYLQSPGDIPSADAAEMEEGFSESPDNLDHTENAASGSGPSA 2901
               .:|...|||   .||||.:..:|:||||||:|||.||||||||||:.||  :::|| :||:.
Zfish  2780 ---ASDPCSGAA---GGGKSTERSFLRSPGDIPNADATEMEEGFSESPEGLD--QDSAS-AGPTP 2835

Human  2902 RGRSAVTRRHKFDLAARTLLARAAGLYRSVQAHRNQSRREGISLQQDP---GALYDFNLDEELEI 2963
            |||||.:|:|:|||||||||||||||||||||||.|:||||..|||:.   |||||||||||||:
Zfish  2836 RGRSAASRKHRFDLAARTLLARAAGLYRSVQAHRTQARREGSGLQQESGPLGALYDFNLDEELEL 2900

Human  2964 DLDDEAMEAMFGQDLTSDNDILGMWIPEVLDWPTWHVCESEDREEVVVCELCECSVVSFNQHMKR 3028
            :||.|||||||.|:|.||:||||||||||||||||||||||||:||||||||..||.|||||||:
Zfish  2901 ELDQEAMEAMFTQELASDSDILGMWIPEVLDWPTWHVCESEDRDEVVVCELCGVSVSSFNQHMKK 2965

Human  3029 NHPGCGRSANRQGYRSNGSYVDGWFGGECGSGNPYYLLCGTCREKYLAMKTKSKSTSSERYKGQA 3093
            :|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.||:|.|....|||||||
Zfish  2966 SHPGCGRSANRQGYRSNGSYVDGWFGGECGSGNPYYLLCGSCREKYLNMKSKIKGPMPERYKGQA 3030

Human  3094 PDLIGKQDSVYEEDWDMLDVDEDEKLTGEEEFELLAGPLGLNDRRIVPEPVQFPDSDPLGASVAM 3158
            |||:|||||||||||||||||:.|:||||||||||:.||||::||.|||.|.|.|:|||||||||
Zfish  3031 PDLLGKQDSVYEEDWDMLDVDDAERLTGEEEFELLSAPLGLSERRPVPEAVHFSDTDPLGASVAM 3095

Human  3159 VTATNSMEETLMQIGCHGSVEKSSSGRITLGEQAAALANPHDRVVALRRVTAAAQVLLARTMVMR 3223
            :||||||||||:||||..||:||||||::||||||.|....||:|||:|||||||||||||||||
Zfish  3096 ITATNSMEETLLQIGCQSSVDKSSSGRLSLGEQAAGLQTSADRLVALKRVTAAAQVLLARTMVMR 3160

Human  3224 ALSLLSVSGSSCSLAAGLESLGLTDIRTLVRLMCLAAAGRAGLSTSPSAMASTSERSRGGHSKAN 3288
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..:....:|||.||. :|..
Zfish  3161 ALSLLSVSGSSCSLAAGLESLGLTDIRTLVRLMCLAAAGRAGLSTGLALGPGSSERPRGA-NKPT 3224

Human  3289 KPISCLAYLSTAVGCLASNAPSAAKLLVQLCTQNLISAATGVNLTTVDDSIQRKFLPSFLRGIAE 3353
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||.||||||||||||:||
Zfish  3225 KPISCLAYLSTAVGCLASNSPSAAKLLVQLCTQNLISAATGMNLTTVDDPIQRKFLPSFLRGVAE 3289

Human  3354 ENKLVTSPNFVVTQALVALLADKGAKLRPNYDKSEVEKK---GLIAQLYAHPSYDPSAVGPLELA 3415
            |||||||||||||||||||||||||:||..|:|:|:||:   |||:.||||.|. ..||||||||
Zfish  3290 ENKLVTSPNFVVTQALVALLADKGARLRHGYEKAELEKRAVAGLISPLYAHLSC-ALAVGPLELA 3353

Human  3416 NALAACCLSSRLSSQHRQWAAQQLVRTLAAHDRDNQTTLQTLADMGGDLRKCSFIKLEAHQNRVM 3480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||.||:.|||||.|..:|||||:||:
Zfish  3354 NALAACCLSSRLSSQHRQWAAQQLVRTLAAHDRDNQNHPQTFADVAGDLRKWSTFRLEAHQSRVI 3418

Human  3481 TCVWCNKKGLLATSGNDGTIRVWNVTKKQYSLQQTCVFNRLEGDAEE---SLGSPSDPSFSPVSW 3542
            ||.||:|||||||||||||:|||||||.||:||||||||:.:..:|:   :||||.|||.:||:|
Zfish  3419 TCGWCSKKGLLATSGNDGTVRVWNVTKSQYTLQQTCVFNKTDDSSEDCMSNLGSPGDPSLAPVAW 3483

Human  3543 SISGKYLAGALEKMVNIWQVNGGKGLVDIQPHWVSALAWPEEGPATAWSGESPELLLVGRMDGSL 3607
            |:||||||.|:||:||||||||||..:::||||||:||||||...:.|.||..||||||||||:|
Zfish  3484 SVSGKYLAAAMEKIVNIWQVNGGKVSLELQPHWVSSLAWPEEEAGSLWGGEPRELLLVGRMDGTL 3548

Human  3608 GLIEVVDVSTMHRRELEHCYRKDVSVTCIAWFSEDRPFAVGYFDGKLLLGTKEPLEKGGIVLIDA 3672
            ||:||:|.|.|.|.||:||:||||:|..|||:||||||||||.|||||:|.|||||.|.:|:|||
Zfish  3549 GLLEVLDDSDMQRTELQHCFRKDVAVMQIAWYSEDRPFAVGYADGKLLIGFKEPLENGSVVVIDA 3613

Human  3673 HKDTLISMKWDPTGHILMTCAKEDSVKLW-GS---ISGCWCCLHSLCHPSIVNGIAWCRLPGKGS 3733
            ||:::.|::|.|.|.:|::||||:.|:|| ||   :...|.||.|:.||::||.:|||.|||:|.
Zfish  3614 HKESISSLRWAPGGQVLLSCAKEEIVRLWTGSGTDLGQNWTCLQSIMHPAVVNAVAWCSLPGQGP 3678

Human  3734 KLQLLMATGCQSGLVCVWRIPQDT---TQTNVTSAEGWWEQESN---------CQDGYRKSSGAK 3786
            |...:.||.||:|||.||.:|||.   :|::....:.|||.||.         |:       ||.
Zfish  3679 KPLNMFATCCQNGLVSVWTVPQDPSSYSQSSTAYLDAWWESESRSRLMLKPQWCE-------GAV 3736

Human  3787 CVYQLRGHITPVRTVAFSSDGLALVSGGLGGLMNIWSLRDGSVLQTVVIGSGAIQTTVWIPEVGV 3851
            ||:|||||:|||||||||.|||||||||:|||:|||||||||||||||.|||||..|||||:|||
Zfish  3737 CVFQLRGHMTPVRTVAFSPDGLALVSGGVGGLLNIWSLRDGSVLQTVVAGSGAIHNTVWIPDVGV 3801

Human  3852 AACSNRSKDVLVVNCTAEWAAANHVLATCRTALKQQGVLGLNMAPCMRAFLERLPMMLQEQYAYE 3916
            |.||||||||||||.:.|:.|.||||||||||||:|||:||||||||||||||||:|||||||||
Zfish  3802 AVCSNRSKDVLVVNSSMEFMATNHVLATCRTALKKQGVVGLNMAPCMRAFLERLPIMLQEQYAYE 3866

Human  3917 KPHVVCGDQLVHSPYMQCLASLAVGLHLDQLLCNPPVPPHHQNCLPDP--------ASWNPNEWA 3973
            |||||||:||||||||||||||:|||.||.|||:||||||..:|.|:|        .||..:|||
Zfish  3867 KPHVVCGEQLVHSPYMQCLASLSVGLQLDVLLCHPPVPPHMAHCPPEPGSSSIPSHGSWASSEWA 3931

Human  3974 WLECFSTTIKAAEALTNGAQFPESFTVPDLEPVPEDELVFLMDNSKWINGMDEQIMSWATSRPED 4038
            ||.|||||||.||||..|..|||||.|||||||.:|:|..|||||||::|||||:||||||||||
Zfish  3932 WLHCFSTTIKTAEALARGHTFPESFIVPDLEPVAKDKLALLMDNSKWVSGMDEQVMSWATSRPED 3996

Human  4039 WHLGGKCDVYLWGAGRHGQLAEAGRNVMVPAAAPSFSQAQQVICGQNCTFVIQANGTVLACGEGS 4103
            |||||||||:||||||||||||||||::||..||||||||||:|||||||||||||||.||||||
Zfish  3997 WHLGGKCDVFLWGAGRHGQLAEAGRNILVPTLAPSFSQAQQVVCGQNCTFVIQANGTVSACGEGS 4061

Human  4104 YGRLGQGNSDDLHVLTVISALQGFVVTQLVTSCGSDGHSMALTESGEVFSWGDGDYGKLGHGNSD 4168
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  4062 YGRLGQGNSDDLHVLTVISALQGFVVTQMVTSCGSDGHSMALTESGEVFSWGDGDYGKLGHGNSD 4126

Human  4169 RQRRPRQIEALQGEEVVQMSCGFKHSAVVTSDGKLFTFGNGDYGRLGLGNTSNKKLPERVTALEG 4233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||:||||
Zfish  4127 RQRRPRQIEALQGEEVVQMSCGFKHSAVVTSDGKLFSFGNGDYGRLGLGNTSNKKLPERVSALEG 4191

Human  4234 YQIGQVACGLNHTLAVSADGSMVWAFGDGDYGKLGLGNSTAKSSPQKIDVLCGIGIKKVACGTQF 4298
            :|:|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
Zfish  4192 HQVGQVACGLNHTLAVSADGMTVWAFGDGDYGKLGLGNSTAKSSPQKVDVLCGIGIKKVACGTQF 4256

Human  4299 SVALTKDGHVYTFGQDRLIGLPEGRARNHNRPQQIPVLAGVIIEDVAVGAEHTLALASNGDVYAW 4363
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||:|.|.||.||||||||||||.|:|.||||||
Zfish  4257 SVALTKDGNVYTFGQDRLIGLPEGRARNHNRPQQVPALTGVFIEDVAVGAEHTLTLSSTGDVYAW 4321

Human  4364 GSNSEGQLGLGHTNHVREPTLVTGLQGKNVRQISAGRCHSAAWTAPPVPPRAPGVSVPLQLGLPD 4428
            |||||||||||||||||||||::.|||||::|||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Zfish  4322 GSNSEGQLGLGHTNHVREPTLISALQGKNIQQISAGRCHSAAWTAPPVPPRAPGSSVPLQLGLPV 4386

Human  4429 TVPPQYGALREVSIHTVRARLRLLYHFSDLMYSSWRLLNLSPNNQNSTSHYNAGTWGIVQGQLRP 4493
            .|||||.||||||:..:||||||||||||||||||||||||||||:.||.|||||||||||||||
Zfish  4387 CVPPQYSALREVSMEALRARLRLLYHFSDLMYSSWRLLNLSPNNQSCTSRYNAGTWGIVQGQLRP 4451

Human  4494 LLAPRVYTLPMVRSIGKTMVQGKNYGPQITVKRISTRGRKCKPIFVQIARQVVKLNASDLRLPSR 4558
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  4452 LLAPRVYTLPMVRSIGKTMVQGKNYGPQITVKRISTRGRKCKPIFVQIARQVVKLNASDLRLPSR 4516

Human  4559 AWKVKLVGEGADDAGGVFDDTITEMCQELETGIVDLLIPSPNATAEVGYNRDRFLFNPSACLDEH 4623
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||.||||||:||
Zfish  4517 AWKVKLVGEGADDAGGVFDDTITEMCQELETGVVDLLIPSPNAAAEVGYNRDRFLLNPSACLEEH 4581

Human  4624 LMQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPLVWKQLCCVPLTLEDLEEVDLLYVQTLNSILHIEDSGI 4688
            |:|||||||||||||||||||||||||:|||||||:||:||||||||||||||||||||:|||||
Zfish  4582 LLQFKFLGILMGVAIRTKKPLDLHLAPMVWKQLCCIPLSLEDLEEVDLLYVQTLNSILHLEDSGI 4646

Human  4689 TEESFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLTFSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREG 4753
            ||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  4647 TEQNFHEMIPLDSFVGQSADGKMVPIIPGGNSIPLTFSNRKEYVERAIEYRLHEMDRQVAAVREG 4711

Human  4754 MSWIVPVPLLSLLTAKQLEQMVCGMPEISVEVLKKVVRYREVDEQHQLVQWFWHTLEEFSNEERV 4818
            |||||||||||||||:||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||.||::|||||||
Zfish  4712 MSWIVPVPLLSLLTARQLEQMVCGLPEISVEVLKKVVRYREVDEQQQLVQWFWQTLDDFSNEERV 4776

Human  4819 LFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQLVMAERLRYAIN 4883
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Zfish  4777 LFMRFVSGRSRLPANTADISQRFQIMKVDRPYDSLPTSQTCFFQLRLPPYSSQSVMAERLRYAIN 4841

Human  4884 NCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY 4909
            ||||||||||||||||||||||||||
Zfish  4842 NCRSIDMDNYMLSRNVDNAEGSDTDY 4867

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
HERC1XP_016878188.1 None
herc1XP_009301513.1 RCC1 369..726 CDD:332518 346/356 (97%)
SPRY_HERC1 2004..2161 CDD:293939 145/156 (93%)
UBA_HERC1 2729..2772 CDD:270584 39/42 (93%)
WD40 3406..3773 CDD:330360 228/373 (61%)
WD40 repeat 3419..3452 CDD:293791 27/32 (84%)
WD40 repeat 3479..3514 CDD:293791 23/34 (68%)
WD40 repeat 3527..3569 CDD:293791 26/41 (63%)
WD40 repeat 3575..3611 CDD:293791 26/35 (74%)
WD40 repeat 3618..3660 CDD:293791 18/41 (44%)
WD40 repeat 3665..3710 CDD:293791 23/44 (52%)
WD40 3737..>3831 CDD:330360 77/93 (83%)
WD40 repeat 3749..3784 CDD:293791 31/34 (91%)
RCC1 4004..4351 CDD:332518 320/346 (92%)
HECTc 4479..4847 CDD:238033 349/367 (95%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C194327883
Domainoid 1 1.000 1931 1.000 Domainoid score I61
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5184
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 7693 1.000 Inparanoid score I8
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG47428
OrthoDB 1 1.010 - - D1062377at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0011692
OrthoInspector 1 1.000 - - oto45566
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102650
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR22870
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R7736
SonicParanoid 1 1.000 - - X9422
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
ZFIN 1 1.500 - -
1717.300

Return to query results.
Submit another query.