Protein Alignment SYNJ1 and Synj1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_003886.3
• Gene: SYNJ1 / 8867
• HGNCID: 11503
• Length: 1612
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_011244377.1
• Gene: Synj1 / 104015
• MGIID: 1354961
• Length: 1714
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1621
• Identity: 1448/1621 - (89%)
• Similarity: 1506/1621 - (92%)
• Gaps: 20/1621 - (1%)

Human     1 MRKRWACWSGSDAPGGC-GGGCGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVETR 64
            |||.|.|||||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   105 MRKSWTCWSGSDASGGCSGGGCGRRRRRSRRKRAASEERRMAFSKGFRIYHKLDPPPFSLIVETR 169

Human    65 HKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYSKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKI 129
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   170 HKEECLMFESGAVAVLSSAEKEAIKGTYAKVLDAYGLLGVLRLNLGDTMLHYLVLVTGCMSVGKI 234

Human   130 QESEVFRVTSTEFISLRIDSSDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGISLDLSLNAHRSMQEQTTD 194
            |||||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||.|||
Mouse   235 QESEVFRVTSTEFISLRVDASDEDRISEVRKVLNSGNFYFAWSASGVSLDLSLNAHRSMQEHTTD 299

Human   195 NRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRG 259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   300 NRFFWNQSLHLHLKHYGVNCDDWLLRLMCGGVEIRTIYAAHKQAKACLISRLSCERAGTRFNVRG 364

Human   260 TNDDGHVANFVETEQVVYLDDSVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRH 324
            ||||||||||||||||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   365 TNDDGHVANFVETEQVIYLDDCVSSFIQIRGSVPLFWEQPGLQVGSHRVRMSRGFEANAPAFDRH 429

Human   325 FRTLKNLYGKQIIVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHAADIQMVNFDYHQMVKGGKAEKLHSV 389
            |||||:||||||:|||||||||||||||||||||||||||:||.||:|||||||||||||||||:
Mouse   430 FRTLKDLYGKQIVVNLLGSKEGEHMLSKAFQSHLKASEHASDIHMVSFDYHQMVKGGKAEKLHSI 494

Human   390 LKPQVQKFLDYGFFYFNGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKP 454
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   495 LKPQVQKFLDYGFFYFDGSEVQRCQSGTVRTNCLDCLDRTNSVQAFLGLEMLAKQLEALGLAEKP 559

Human   455 QLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKA---KLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAID 516
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
Mouse   560 QLVTRFQEVFRSMWSVNGDSISKIYAGTGALEGKAKAGKLKDGARSVTRTIQNNFFDSSKQEAID 624

Human   517 VLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKSMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNV 581
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||
Mouse   625 VLLLGNTLNSDLADKARALLTTGSLRVSEQTLQSASSKVLKNMCENFYKYSKPKKIRVCVGTWNV 689

Human   582 NGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVSASTTN 646
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
Mouse   690 NGGKQFRSIAFKNQTLTDWLLDAPKLAGIQEFQDKRSKPTDIFAIGFEEMVELNAGNIVNASTTN 754

Human   647 QKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAV 711
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   755 QKLWAVELQKTISRDNKYVLLASEQLVGVCLFVFIRPQHAPFIRDVAVDTVKTGMGGATGNKGAV 819

Human   712 AIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFIEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDL 776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   820 AIRMLFHTTSLCFVCSHFAAGQSQVKERNEDFVEIARKLSFPMGRMLFSHDYVFWCGDFNYRIDL 884

Human   777 PNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQVFRGFLEGKVTFAPTYKYDLFSDDYDTSEKCRTP 841
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse   885 PNEEVKELIRQQNWDSLIAGDQLINQKNAGQIFRGFLEGKVTFAPTYKYDLFSEDYDTSEKCRTP 949

Human   842 AWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALID 906
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   950 AWTDRVLWRRRKWPFDRSAEDLDLLNASFQDESKILYTWTPGTLLHYGRAELKTSDHRPVVALID 1014

Human   907 IDIFEVEAEERQNIYKEVIAVQGPPDGTVLVSIKSSLPENNFFDDALIDELLQQFASFGEVILIR 971
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|:.|||||||||||:|||.||||||||
Mouse  1015 IDIFEVEAEERQKIYKEVIAVQGPPDGTVLVSIKSSAQESTFFDDALIDELLRQFAHFGEVILIR 1079

Human   972 FVEDKMWVTFLEGSSALNVLSLNGKELLNRTITIALKSPDWIKNLEEEMSLEKISIALPSSTSST 1036
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||:|||||||||||:.||||.|||
Mouse  1080 FVEDKMWVTFLEGSSALNALSLNGKELLNRTITITLKSPDWIKHLEEEMSLEKISVTLPSSASST 1144

Human  1037 LLGEDAEVAADFDMEGDVDDYSAEVEELLPQHLQPSSSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTISEGPVP 1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|...|
Mouse  1145 LLGEDAEVAADFDMEGDVDDYSAEVEELLPQHLQPSSSSGLGTSPSSSPRTSPCQSPTVPEYSAP 1209

Human  1102 SLPIRPSRAPSRTPGPPSAQSSPIDAQPATPLPQKDPAQPLEPKRPPPPRPVAPPTRPAPPQRPP 1166
            ||||||||||||||||||:|.||:|.|||.   |||.:|.|||||||||||||||.|||||||||
Mouse  1210 SLPIRPSRAPSRTPGPPSSQGSPVDTQPAA---QKDSSQTLEPKRPPPPRPVAPPARPAPPQRPP 1271

Human  1167 PPSGARSPAPTRKEFGGIGAPPSPGVARREMEAPKSPGTTRKDNIGRSQPSPQAGLAGPGPAGYS 1231
            ||||||||||.||||||:||||||||||||:||||||||.|||||||:||||||||||||||||.
Mouse  1272 PPSGARSPAPARKEFGGVGAPPSPGVARREIEAPKSPGTARKDNIGRNQPSPQAGLAGPGPAGYG 1336

Human  1232 TARPTIPPRAGVISAPQSHARASAGRLTPESQSKTSETSKGSTFLPEPLKPQAAFPPQSSLPPPA 1296
            .||||||.||||||||||.||..|||.||:||||.|||.||...||||||||||||.|.|||.||
Mouse  1337 AARPTIPARAGVISAPQSQARVCAGRPTPDSQSKPSETLKGPAVLPEPLKPQAAFPQQPSLPTPA 1401

Human  1297 QRLQEPLVPVAAP-MPQSGPQPNLETPPQPPPRSRSSHSLPSEASSQPQVKTNGISDGKRESPLK 1360
            |:||:||||:||| ||.||||||||||||||||||||.||||::|.|.|||.||||..|:|..||
Mouse  1402 QKLQDPLVPIAAPTMPPSGPQPNLETPPQPPPRSRSSQSLPSDSSPQLQVKINGISGVKQEPTLK 1466

Human  1361 IDPFEDLSFNLLAVSKAQLSVQTSPVPTPDPKRLIQLPSATQS--NVLSSVSCMPTMPPIPARSQ 1423
            .|||||||.::|||||||.|||.|||.|||||.|||||||:||  |.|||||||||.||.|..|:
Mouse  1467 SDPFEDLSLSVLAVSKAQPSVQISPVLTPDPKMLIQLPSASQSQVNPLSSVSCMPTRPPGPEESK 1531

Human  1424 SQENMRSSPNPFITGLTRTNPFSDRTAAPGNPFRAKSEESEATSWFSKEEPVTISPFPSLQPLGH 1488
            |||:|.||.||| ..|...|||:|||||||||||.:|:|||||||.||||||..||||.|.||.|
Mouse  1532 SQESMGSSANPF-PSLPCRNPFTDRTAAPGNPFRVQSQESEATSWLSKEEPVPNSPFPPLMPLSH 1595

Human  1489 NKSRASSSLDGFKDSFDLQGQSTLKISNPKGWVTFEEEEDFGVKGKSKSACSDLLGNQPSSFSGS 1553
            :.|:|||||.||:|:||||.|||:|.|||||||||:|:::|...|||||.|.||:||.|:||
Mouse  1596 DTSKASSSLGGFEDNFDLQSQSTVKTSNPKGWVTFDEDDNFPTTGKSKSVCPDLVGNAPASF--- 1657

Human  1554 NLTLNDDWNKGTNVSFCVLPSRR--PPPPPVPLLPPGTSPPVDPFTTLASKASPTLDFTER 1612
                :|||:||.:|||||||:||  |||||||||||||:....|.|||.|||..|||||||
Mouse  1658 ----DDDWSKGASVSFCVLPARRPPPPPPPVPLLPPGTTSSAGPSTTLPSKAPSTLDFTER 1714

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SYNJ1	NP_003886.3	COG5329	73..519	CDD:227637	431/448 (96%)
		INPP5c_Synj1	572..907	CDD:197332	330/334 (99%)
		DUF1866	906..1047	CDD:286093	127/140 (91%)
		Atrophin-1	1049..>1426	CDD:460830	308/379 (81%)
Synj1	XP_011244377.1	COG5329	204..627	CDD:227637	406/422 (96%)
		INPP5c_Synj1	680..1015	CDD:197332	330/334 (99%)
		RRM_SF	1014..1155	CDD:473069	127/140 (91%)
		PHA03247	<1207..1609	CDD:223021	314/405 (78%)