DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MPDZ and Mpdz

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001362342.1 Gene:MPDZ / 8777 HGNCID:7208 Length:2103 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006238402.1 Gene:Mpdz / 29365 RGDID:3105 Length:2068 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2118 Identity:1759/2118 - (83%)
Similarity:1896/2118 - (89%) Gaps:65/2118 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MLEAIDKNRALHAAERLQTKLRERGDVANEDKLSLLKSVLQSPLFSQILSLQTSVQQLKDQVNIA 65
            |||.|||||||.||||||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|
  Rat     1 MLETIDKNRALQAAERLQSKLKERGDVANEDKLSLLKSVLQSPLFSQILSLQTSLQQLKDQVNVA 65

Human    66 TSATSNIEYAHVPHLSPAVIPTLQNESFLLSPNNGNLEALTGPGI-PHINGKPACDEFDQLIKNM 129
            |.||:|.::||.|..|.|:|..||:||.||||:||||||::|||. |.::|||||:|.|||||:|
  Rat    66 TLATANADHAHTPQFSSAIISNLQSESLLLSPSNGNLEAISGPGAPPAMDGKPACEELDQLIKSM 130

Human   130 AQGRHVEVFELLKPPSGGLGFSVVGLRSENRGELGIFVQEIQEGSVAHRDGRLKETDQILAINGQ 194
            |||||||:|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 AQGRHVEIFELLKPPCGGLGFSVVGLRSENRGELGIFVQEIQEGSVAHRDGRLKETDQILAINGQ 195

Human   195 ALDQTITHQQAISILQKAKDTVQLVIARGSLPQLVSPIVSRSPSAASTISAHSNPVHWQHMETIE 259
            .||||||||||||||||||||:||||||||||.:.||.:|||||||||:||||||.||||:||||
  Rat   196 VLDQTITHQQAISILQKAKDTIQLVIARGSLPHISSPRISRSPSAASTVSAHSNPTHWQHVETIE 260

Human   260 LVNDGSGLGFGIIGGKATGVIVKTILPGGVADQHGRLCSGDHILKIGDTDLAGMSSEQVAQVLRQ 324
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 LVNDGSGLGFGIIGGKATGVIVKTILPGGVADQHGRLCSGDHILKIGDTDLAGMSSEQVAQVLRQ 325

Human   325 CGNRVKLMIARGAIEERTAPTALGITLSSSPTSTPELRVDASTQKGEESETFDVELTKNVQGLGI 389
            |||||||||||||:||..||::|||||||| |||.|:||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   326 CGNRVKLMIARGAVEETPAPSSLGITLSSS-TSTSEMRVDASTQKNEESETFDVELTKNVQGLGI 389

Human   390 TIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVEHDGRIQIGDQIIAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQT 454
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   390 TIAGYIGDKKLEPSGIFVKSITKSSAVELDGRIQIGDQIVAVDGTNLQGFTNQQAVEVLRHTGQT 454

Human   455 VLLTLMRRGMKQEAELMSREDVTKDADLSPVNASIIKENYEKDEDFLSSTRNTNILPTEEEGYPL 519
            |.|||||:|..||||:.||||..||.||.       .|||||||:.||..|:|:|||.|||||||
  Rat   455 VRLTLMRKGASQEAEITSREDTAKDVDLP-------AENYEKDEESLSLKRSTSILPIEEEGYPL 512

Human   520 LSAEIEEIEDAQKQEAALLTKWQRIMGINYEIVVAHVSKFSENSGLGISLEATVGHHFIRSVLPE 584
            ||.|:||.||.| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   513 LSTELEETEDVQ-QEAALLTKWQRIMGINYEIVVAHVSKFSENSGLGISLEATVGHHFIRSVLPE 576

Human   585 GPVGHSGKLFSGDELLEVNGITLLGENHQDVVNILKELPIEVTMVCCRRTVPPTTQSELDSLDLC 649
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:|||||||||||||..||:||||:.
  Rat   577 GPVGHSGKLFSGDELLEVNGINLLGENHQDVVNILKELPIDVTMVCCRRTVPPTALSEVDSLDIH 641

Human   650 DIELTEKPHVDLGEFIGSSETEDPVLAMTDAGQSTEEVQAPLAMWEAGIQHIELEKGSKGLGFSI 714
            |:|||||||:||||||||||||||:|||:|..|:.||:|.||||||||||.|||||||:||||||
  Rat   642 DLELTEKPHIDLGEFIGSSETEDPMLAMSDVDQNAEEIQTPLAMWEAGIQAIELEKGSRGLGFSI 706

Human   715 LDYQDPIDPASTVIIIRSLVPGGIAEKDGRLLPGDRLMFVNDVNLENSSLEEAVEALKGAPSGTV 779
            ||||||||||:|||:||||||||||||||||.||||||||||:|||||:||||||||||||||.|
  Rat   707 LDYQDPIDPANTVIVIRSLVPGGIAEKDGRLFPGDRLMFVNDINLENSTLEEAVEALKGAPSGMV 771

Human   780 RIGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDSFLYPPHSCEEAGLADKPLFRADLALVGTNDADLVDESTFESP 844
            ||||||||||||||||||||||:||..||:|:|.||:||.||||||||:.|.||:.|.||.|||.
  Rat   772 RIGVAKPLPLSPEEGYVSAKEDTFLCSPHTCKEMGLSDKALFRADLALIDTPDAESVAESRFESQ 836

Human   845 YSPENDSIYSTQASILSLHGSSCGDGLNYGSSLPSSPPKDVIENSCDPVLDLHMSLEELYTQNLL 909
            :||:|||:||||||:||||..:|.||:|||.|||||||||| .||.|.||.||:|||||||||||
  Rat   837 FSPDNDSVYSTQASVLSLHDGACSDGMNYGPSLPSSPPKDV-TNSSDLVLGLHLSLEELYTQNLL 900

Human   910 QRQDENTPSVDISMGPASGFTINDYTPANAIEQQYECENTIVWTESHLPSEVISSAELPSVLPDS 974
            |||...:|..|:|....||||::|||||||:||:|||.||:.||.|.|||. :|:.||...||..
  Rat   901 QRQHAGSPPTDMSPAATSGFTVSDYTPANAVEQKYECANTVAWTPSQLPSG-LSTTELAPALPAV 964

Human   975 AGKGSEYLLEQSSLACNAECVMLQNVSKESFERTINIAKGNSSLGMTVSANKDGLGMIVRSIIHG 1039
            |.|   ||.|||||..:||.|.||::|:|:||||:.||||:|||||||||||||||:||||||||
  Rat   965 APK---YLTEQSSLVSDAESVTLQSMSQEAFERTVTIAKGSSSLGMTVSANKDGLGVIVRSIIHG 1026

Human  1040 GAISRDGRIAIGDCILSINEESTISVTNAQARAMLRRHSLIGPDIK--------------ITYVP 1090
            ||||||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||              |||||
  Rat  1027 GAISRDGRIAVGDCILSINEESTISLTNAQARAMLRRHSLIGPDIKFSAAPADDRAPFYVITYVP 1091

Human  1091 AEHLEEFKISLGQQSGRVMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQNTAYSNWNQPRRVELW 1155
            |||||||::|.|||:|.:||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:|:||||||||
  Rat  1092 AEHLEEFRVSFGQQAGGIMALDIFSSYTGRDIPELPEREEGEGEESELQNAAYSSWSQPRRVELW 1156

Human  1156 REPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNGTLKPGDRIVEVDGMDLRDAS 1220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1157 REPSKSLGISIVGGRGMGSRLSNGEVMRGIFIKHVLEDSPAGKNGTLKPGDRIVEVDGMDLRDAS 1221

Human  1221 HEQAVEAIRKAGNPVVFMVQSIINRPRKSPLPSLLHNLYPKYNFSSTNPFADSLQINADKAPSQS 1285
            ||||||||||||:|||||||||:|||||||||||.|:||||.:||||||||:|||:.:|||||||
  Rat  1222 HEQAVEAIRKAGSPVVFMVQSIVNRPRKSPLPSLPHSLYPKCSFSSTNPFAESLQLTSDKAPSQS 1286

Human  1286 ESEPEKAPLCSVPPPPPSAFAEMGSDHTQSSASKISQDVDKEDEFGYSWKNIRERYGTLTGELHM 1350
            |||.|||.|||||...||.|:||.||:.|.||:.:::|.|||||||||||||:||||||||:|||
  Rat  1287 ESESEKATLCSVPSSSPSVFSEMSSDYAQPSATTVAEDEDKEDEFGYSWKNIQERYGTLTGQLHM 1351

Human  1351 IELEKGHSGLGLSLAGNKDRSRMSVFIVGIDPNGAAGKDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNAS 1415
            ||||||||||||||||||||:|||||||||||.||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1352 IELEKGHSGLGLSLAGNKDRTRMSVFIVGIDPTGAAGRDGRLQIADELLEINGQILYGRSHQNAS 1416

Human  1416 SIIKCAPSKVKIIFIRNKDAVNQMAVCPGNAVEPLPSNSENLQNKELGYHRFSLYSKPRQSSSHL 1480
            |||||||||||||||||.|||||||||||:|.:||||.||:.||||:                  
  Rat  1417 SIIKCAPSKVKIIFIRNADAVNQMAVCPGSAADPLPSTSESPQNKEV------------------ 1463

Human  1481 VYLCSQLIAVQLHLTEPTVTTSDAAVDLSSFKNVQHLELPKDQGGLGIAISEEDTLSGVIIKSLT 1545
                           ||::|||.:||||||..||.|||||||||||||||.|||||:||.|||||
  Rat  1464 ---------------EPSITTSASAVDLSSLTNVYHLELPKDQGGLGIAICEEDTLNGVTIKSLT 1513

Human  1546 EHGVAATDGRLKVGDQILAVDDEIVVGYPIEKFISLLKTAKMTVKLTIHAENPDSQAVPSAAGAA 1610
            |.|.||.|||||.||:|||||||:|.|.|||||||||||||.|||||:.||||..|||||||..|
  Rat  1514 ERGGAAKDGRLKPGDRILAVDDELVAGCPIEKFISLLKTAKTTVKLTVGAENPGCQAVPSAAVTA 1578

Human  1611 SGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCETTIEISKGRTGLGLS 1675
            |||:|:|||:..||   :|:.|.|.:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat  1579 SGERKDSSQTPAVP---APDLEPIPSTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCETTIEISKGQTGLGLS 1640

Human  1676 IVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLT 1740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1641 IVGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKATHDEAINVLRQTPQRVRLT 1705

Human  1741 LYRDEAPYKEEEVCDTLTIELQKKPGKGLGLSIVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQI 1805
            |||||||||||:||||.|:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1706 LYRDEAPYKEEDVCDTFTVELQKRPGKGLGLSIVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQI 1770

Human  1806 LMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTVTLEVGRIKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSG 1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||:.|.||
  Rat  1771 LMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTVTLEVGRIKAAPFHSERRPSQSSQVSESSLSSFSLPRSG 1835

Human  1871 SSTSESLESSSKKNALASEIQGLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAA 1935
            ..||||.|||:||||||||||||||||:||||.|:||:||||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1836 IHTSESSESSAKKNALASEIQGLRTVEIKKGPADALGLSIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPNGVAA 1900

Human  1936 QTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSF 2000
            |||||||||||||||||||:||||||||||:||||||||:|||||||||||||||||.|:..|:|
  Rat  1901 QTQKLRVGDRIVTICGTSTDGMTHTQAVNLMKNASGSIEVQVVAGGDVSVVTGHQQELANPCLAF 1965

Human  2001 TGLTSSSIFQDDLGPPQCKSITLERGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLK 2065
            ||||||:||.|||||||.|:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat  1966 TGLTSSTIFPDDLGPPQSKTITLDRGPDGLGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAAAEDGRLK 2030

Human  2066 RGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS 2103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2031 RGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS 2068

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MPDZNP_001362342.1 PDZ_signaling 2019..2102 CDD:238492 79/82 (96%)
L27_2 6..63 CDD:312549 52/56 (93%)
PDZ_signaling 139..221 CDD:238492 78/81 (96%)
PDZ_signaling 257..334 CDD:238492 76/76 (100%)
PDZ 374..463 CDD:214570 85/88 (97%)
PDZ_signaling 560..629 CDD:238492 66/68 (97%)
PDZ_signaling 698..784 CDD:238492 77/85 (91%)
PDZ_signaling 1006..1076 CDD:238492 63/69 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1121..1140 18/18 (100%)
PDZ_signaling 1149..1240 CDD:238492 89/90 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1278..1324 28/45 (62%)
PDZ 1347..1433 CDD:214570 81/85 (95%)
PDZ_signaling 1514..1593 CDD:238492 65/78 (83%)
MPDZ_u10 1595..1659 CDD:374710 45/63 (71%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1600..1645 27/44 (61%)
PDZ 1660..1744 CDD:214570 82/83 (99%)
PDZ_signaling 1758..1836 CDD:238492 75/77 (97%)
PDZ_signaling 1893..1978 CDD:238492 76/84 (90%)
MpdzXP_006238402.1 L27_2 6..63 CDD:117611 52/56 (93%)
PDZ_signaling 140..222 CDD:238492 78/81 (96%)
PDZ_signaling 256..335 CDD:238492 77/78 (99%)
PDZ 374..463 CDD:214570 85/88 (97%)
PDZ_signaling 552..621 CDD:238492 66/68 (97%)
PDZ_signaling 693..776 CDD:238492 75/82 (91%)
PDZ_signaling 993..1063 CDD:238492 63/69 (91%)
PDZ_signaling 1150..1241 CDD:238492 89/90 (99%)
PDZ 1348..1433 CDD:214570 80/84 (95%)
PDZ_signaling 1482..1561 CDD:238492 65/78 (83%)
MPDZ_u10 1563..1624 CDD:293272 45/63 (71%)
PDZ 1625..1709 CDD:214570 82/83 (99%)
PDZ_signaling 1721..1801 CDD:238492 76/79 (96%)
PDZ_signaling 1858..1943 CDD:238492 76/84 (90%)
PDZ_signaling 1984..2067 CDD:238492 79/82 (96%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83687275
Domainoid 1 1.000 289 1.000 Domainoid score I16120
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG3528
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H2841
Inparanoid 1 1.050 3429 1.000 Inparanoid score I362
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG51355
OrthoDB 1 1.010 - - D12016at7742
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0003499
OrthoInspector 1 1.000 - - oto142770
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103252
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR19964
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1763
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1717.310

Return to query results.
Submit another query.