DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH13 and Myh6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003793.2 Gene:MYH13 / 8735 HGNCID:7571 Length:1938 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_058935.2 Gene:Myh6 / 29556 RGDID:62029 Length:1939 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1937 Identity:1506/1937 - (77%)
Similarity:1713/1937 - (88%) Gaps:2/1937 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     3 SDAEMAIFGEAAPYLRKPEKERIEAQNRPFDSKKACFVADNKEMYVKGMIQTRENDKVIVKTLDD 67
            :||:||.||.|||||||.||||:|||.||||.:..|||.|:||.|||..|.:||..||..:|.:.
  Rat     2 TDAQMADFGAAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDIRTECFVPDDKEEYVKAKIVSREGGKVTAETENG 66

Human    68 RMLTLNNDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWL 132
            :.:|:..|||...|||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    67 KTVTVKEDQVMQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYKWL 131

Human   133 PVYKPEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRDNQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 197
            |||..|||||||||||.|||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   132 PVYNAEVVAAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFA 196

Human   198 TIAVTGDKKKETQPGKMQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLAS 262
            :||..||:.|:..|...:||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   197 SIAAIGDRSKKDNPNANKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLAS 261

Human   263 ADIETYLLEKSRVTFQLSSERSYHIFYQIMSNKKPELIDLLLISTNPFDFPFVSQGEVTVASIDD 327
            |||||||||||||.|||.:||:|||||||:|||||||:|:||::.||:|:.|||||||:||||||
  Rat   262 ADIETYLLEKSRVIFQLKAERNYHIFYQILSNKKPELLDMLLVTNNPYDYAFVSQGEVSVASIDD 326

Human   328 SEELLATDNAIDILGFSSEEKVGIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAGYLMGL 392
            ||||||||:|.|:|||::|||.|:||||||:|||||||||||||||||||||||.|||:.|||||
  Rat   327 SEELLATDSAFDVLGFTAEEKAGVYKLTGAIMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEDADKSAYLMGL 391

Human   393 NSAEMLKGLCCPRVKVGNEYVTKGQNVQQVTNSVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQPRQY 457
            |||::|||||.||||||||||||||:||||..|:|||||:||||||.|||||||..|:|||||||
  Rat   392 NSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQSVQQVYYSIGALAKSVYEKMFNWMVTRINATLETKQPRQY 456

Human   458 FIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLAAC 522
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   457 FIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMDLQAC 521

Human   523 IELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPAKGKAEAHFSLVHYAGT 587
            |:||||||||.||||||||||||||.:||.||||.|||||||||||:..|||.||||||||||||
  Rat   522 IDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLYDNHLGKSNNFQKPRNVKGKQEAHFSLVHYAGT 586

Human   588 VDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSFLFSNYAGAETGDSGGSKKGGKKKGSSFQTVS 652
            |||||.|||:|||||||||||||||||||||::.|||.||.|:|||| |..||||||||||||||
  Rat   587 VDYNILGWLEKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLMATLFSTYASADTGDS-GKGKGGKKKGSSFQTVS 650

Human   653 AVFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCLIPNETKTPGVMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPSRI 717
            |:.||||||||||||:||||||||:||||.|.|||||:.|||||||||||||||||||||||:||
  Rat   651 ALHRENLNKLMTNLRTTHPHFVRCIIPNERKAPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRI 715

Human   718 LYADFKQRYRILNASAIPEGQFIDSKNASEKLLNSIDVDREQFRFGNTKVFFKAGLLGLLEEMRD 782
            ||.||:|||||||.:||||||||||:..:||||.|:|:|..|::||:||||||||||||||||||
  Rat   716 LYGDFRQRYRILNPAAIPEGQFIDSRKGAEKLLGSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRD 780

Human   783 EKLVTLMTSTQAVCRGYLMRVEFKKMMERRDSIFCIQYNIRSFMNVKHWPWMNLFFKIKPLLKSA 847
            |:|..::|..||..||.|||:|||||:||||::..||:|||:||.||:||||.|:||||||||||
  Rat   781 ERLSRIITRIQAQARGQLMRIEFKKMVERRDALLVIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSA 845

Human   848 EAEKEMATMKEDFERTKEELARSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQSETENLMDAEERCEGL 912
            |.|||||.|||:|.|.|:.|.:|||||||||||||||||||||||||||:|.:||.||||||:.|
  Rat   846 ETEKEMANMKEEFGRVKDALEKSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQAEQDNLADAEERCDQL 910

Human   913 IKSKILLEAKVKELTERLEEEEEMNSELVAKKRNLEDKCSSLKRDIDDLELTLTKVEKEKHATEN 977
            ||:||.|||||||:|||||:|||||:||.||||.|||:||.||:|||||||||.|||||||||||
  Rat   911 IKNKIQLEAKVKEMTERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKHATEN 975

Human   978 KVKNLSEEMTALEENISKLTKEKKSLQEAHQQTLDDLQVEEDKVNGLIKINAKLEQQTDDLEGSL 1042
            |||||:|||..|:|.|:|||||||:|||||||.|||||.||||||.|||...|||||.|||||||
  Rat   976 KVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQAEEDKVNTLIKSKVKLEQQVDDLEGSL 1040

Human  1043 EQEKKLRADLERAKRKLEGDLKMSQESIMDLENDKQQIEEKLKKKEFELSQLQAKIDDEQVHSLQ 1107
            |||||:|.||||||||||||||::|||||||||||.|:|||||||||::||..:||:|||..:||
  Rat  1041 EQEKKVRMDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKLQLEEKLKKKEFDISQQNSKIEDEQALALQ 1105

Human  1108 FQKKIKELQARIEELEEEIEAEHTLRAKIEKQRSDLARELEEISERLEEASGATSAQIEMNKKRE 1172
            .|||:||.||||||||||:|||.|.|||:||.||||.|||||||||||||.||||.|||||||||
  Rat  1106 LQKKLKENQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLTRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNKKRE 1170

Human  1173 AEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEIDDMAS 1237
            ||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|:|:||:.|
  Rat  1171 AEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDDVTS 1235

Human  1238 NIEALSKSKSNIERTCRTVEDQFSEIKAKDEQQTQLIHDLNMQKARLQTQNGELSHRVEEKESLI 1302
            |:|.:.|:|:|:|:..||:|||.:|.:.|.|:..:.::|...|:|:|||:||||:.::||||:||
  Rat  1236 NMEQIIKAKANLEKVSRTLEDQANEYRVKLEEAQRSLNDFTTQRAKLQTENGELARQLEEKEALI 1300

Human  1303 SQLTKSKQALTQQLEELKRQMEEETKAKNAMAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQRALSK 1367
            ||||:.|.:.|||:|:||||:|||.|||||:||||||:||||||||||||||.||||||||.|||
  Rat  1301 SQLTRGKLSYTQQMEDLKRQLEEEGKAKNALAHALQSARHDCDLLREQYEEEMEAKAELQRVLSK 1365

Human  1368 ANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEENTETANSKCASLEKTKQRLQGEVEDL 1432
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||..|..|:||:||||||.|||.|:|||
  Rat  1366 ANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDL 1430

Human  1433 MRDLERSHTACATLDKKQRNFDKVLAEWKQKLDESQAELEAAQKESRSLSTELFKMRNAYEEVVD 1497
            |.|:|||:.|.|.||||||||||:|||||||.:|||:|||::|||:|||||||||::|||||.::
  Rat  1431 MVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEESLE 1495

Human  1498 QLETLRRENKNLQEEISDLTEQIAETGKNLQEAEKTKKLVEQEKSDLQVALEEVEGSLEHEESKI 1562
            .|||.:||||||||||||||||:.|.|||:.|.||.:|.:|.||.:||.||||.|.||||||.||
  Rat  1496 HLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGEGGKNVHELEKIRKQLEVEKLELQSALEEAEASLEHEEGKI 1560

Human  1563 LRVQLELSQVKSELDRKVIEKDEEIEQLKRNSQRAAEALQSVLDAEIRSRNDALRLKKKMEGDLN 1627
            ||.|||.:|:|:|::||:.|||||:||.|||..|..::||:.||||.||||:|||:|||||||||
  Rat  1561 LRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHLRVVDSLQTSLDAETRSRNEALRVKKKMEGDLN 1625

Human  1628 EMEIQLGHSNRQMAETQKHLRTVQGQLKDSQLHLDDALRSNEDLKEQLAIVERRNGLLLEELEEM 1692
            ||||||..:||..:|.||||:..|..|||:||.||||:|:|:||||.:|||||||.||..||||:
  Rat  1626 EMEIQLSQANRIASEAQKHLKNAQAHLKDTQLQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNTLLQAELEEL 1690

Human  1693 KVALEQTERTRRLSEQELLDASDRVQLLHSQNTSLINTKKKLEADIAQCQAEVENSIQESRNAEE 1757
            :..:|||||:|:|:||||::.|:||||||||||||||.|||::||::|.|.|||.::||.|||||
  Rat  1691 RAVVEQTERSRKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMDADLSQLQTEVEEAVQECRNAEE 1755

Human  1758 KAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQKLENR 1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||:||||||||:||||.|
  Rat  1756 KAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEAR 1820

Human  1823 VRELENELDVEQKRGAEALKGAHKYERKVKEMTYQAEEDHKNILRLQDLVDKLQAKVKSYKRQAE 1887
            ||||||||:.||||.||::||..|.||::||:|||.|||.||::||||||||||.|||:||||||
  Rat  1821 VRELENELEAEQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDKKNLVRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAE 1885

Human  1888 EAEEQANTQLSRCRRVQHELEEAAERADIAESQVNKLRAKSRDVGS-QKMEE 1938
            ||||||||.||:.|:|||||:||.|||||||||||||||||||:|: |||.:
  Rat  1886 EAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRDIGAKQKMHD 1937

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH13NP_003793.2 Myosin_N 33..77 CDD:460670 18/43 (42%)
MYSc_Myh13 100..770 CDD:276887 566/669 (85%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 659..681 19/21 (90%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 761..775 11/13 (85%)
Myosin_tail_1 850..1927 CDD:460256 813/1076 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1917..1938 18/21 (86%)
Myh6NP_058935.2 Myosin_N 32..76 CDD:460670 18/43 (42%)
MYSc_class_II 99..768 CDD:276951 566/669 (85%)
Actin-binding 657..679 19/21 (90%)
Actin-binding 759..773 11/13 (85%)
Calmodulin-binding. /evidence=ECO:0000250 790..807 11/16 (69%)
Calmodulin-binding. /evidence=ECO:0000250 816..833 12/16 (75%)
Myosin_tail_1 848..1925 CDD:460256 813/1076 (76%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1908..1939 24/30 (80%)

Return to query results.
Submit another query.