DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYH13 and Myh3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003793.2 Gene:MYH13 / 8735 HGNCID:7571 Length:1938 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_036736.1 Gene:Myh3 / 24583 RGDID:3138 Length:1940 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1938 Identity:1540/1938 - (79%)
Similarity:1752/1938 - (90%) Gaps:7/1938 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSDAEMAIFGEAAPYLRKPEKERIEAQNRPFDSKKACFVADNKEMYVKGMIQTRENDKVIVKTL 65
            ||||.||.:||.|||:|||.|||||||||:|||:|..|||.|:||.|.||.|::.::.||.|:|.
  Rat     1 MSSDTEMEVFGIAAPFLRKSEKERIEAQNQPFDAKTYCFVVDSKEEYAKGKIKSSQDGKVTVETE 65

Human    66 DDRMLTLNNDQVFPMNPPKFDKIEDMAMMTHLHEPAVLYNLKERYAAWMIYTYSGLFCVTVNPYK 130
            |:|.|.:..:.|:.||||||||||||||:|||:|||||||||:||.:||||||||||||||||||
  Rat    66 DNRTLVVKPEDVYAMNPPKFDKIEDMAMLTHLNEPAVLYNLKDRYTSWMIYTYSGLFCVTVNPYK 130

Human   131 WLPVYKPEVVAAYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRDNQSILITGESGAGKTVNTKRVIQY 195
            |||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 WLPVYTPEVVDGYRGKKRQEAPPHIFSISDNAYQFMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQY 195

Human   196 FATIAVTGD--KKKETQPGKMQGTLEDQIIQANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATG 258
            |||||.|||  |||::   ||:||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||
  Rat   196 FATIAATGDLAKKKDS---KMKGTLEDQIISANPLLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGTTG 257

Human   259 KLASADIETYLLEKSRVTFQLSSERSYHIFYQIMSNKKPELIDLLLISTNPFDFPFVSQGEVTVA 323
            |||||||||||||||||||||.:||||||||||:||||||||:||||:|||:|:||:||||:.||
  Rat   258 KLASADIETYLLEKSRVTFQLKAERSYHIFYQILSNKKPELIELLLITTNPYDYPFISQGEILVA 322

Human   324 SIDDSEELLATDNAIDILGFSSEEKVGIYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKAGY 388
            ||||.|||||||:|||||||:.|||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
  Rat   323 SIDDREELLATDSAIDILGFTPEEKSGLYKLTGAVMHYGNMKFKQKQREEQAEPDGTEVADKTAY 387

Human   389 LMGLNSAEMLKGLCCPRVKVGNEYVTKGQNVQQVTNSVGALAKAVYEKMFLWMVTRINQQLDTKQ 453
            ||||||:::||.||.||||||||||||||.|.||.::|.||:|:||||:|||||||||||||||.
  Rat   388 LMGLNSSDLLKALCFPRVKVGNEYVTKGQTVDQVHHAVNALSKSVYEKLFLWMVTRINQQLDTKL 452

Human   454 PRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWEFIDFGMD 518
            |||:|||||||||||||::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
  Rat   453 PRQHFIGVLDIAGFEIFEYNSLEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMD 517

Human   519 LAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKPAKGKAEAHFSLVH 583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||:|
  Rat   518 LAACIELIEKPMGIFSILEEECMFPKATDTSFKNKLYDQHLGKSNNFQKPKVVKGKAEAHFSLIH 582

Human   584 YAGTVDYNIAGWLDKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSFLFSNYAGAETGDSGGSKKGGKKKGSSF 648
            |||||||:::|||:||||||||||||||||||.:||:.|::.:  |.|...||.||..|||||||
  Rat   583 YAGTVDYSVSGWLEKNKDPLNETVVGLYQKSSNRLLAHLYATF--ATTDADGGKKKVAKKKGSSF 645

Human   649 QTVSAVFRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCLIPNETKTPGVMDHYLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGF 713
            |||||:|||||||||:|||:||||||||:|||||||||.|:|.||:|||||||||||||||||||
  Rat   646 QTVSALFRENLNKLMSNLRTTHPHFVRCIIPNETKTPGAMEHSLVLHQLRCNGVLEGIRICRKGF 710

Human   714 PSRILYADFKQRYRILNASAIPEGQFIDSKNASEKLLNSIDVDREQFRFGNTKVFFKAGLLGLLE 778
            |:||||.|||||||:|||||||||||||||.|.||||.|||:|..|::||:|||||||||||.||
  Rat   711 PNRILYGDFKQRYRVLNASAIPEGQFIDSKKACEKLLASIDIDHTQYKFGHTKVFFKAGLLGTLE 775

Human   779 EMRDEKLVTLMTSTQAVCRGYLMRVEFKKMMERRDSIFCIQYNIRSFMNVKHWPWMNLFFKIKPL 843
            |||||:|..|:|.|||||||:||||||:|||:||:||||||||||:||||||||||.||||||||
  Rat   776 EMRDERLAKLITRTQAVCRGFLMRVEFQKMMQRRESIFCIQYNIRAFMNVKHWPWMKLFFKIKPL 840

Human   844 LKSAEAEKEMATMKEDFERTKEELARSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQSETENLMDAEER 908
            |||||.|||||||||:|::||:|||:|||:|||||||:|:|:|||||||||||:|:|||:|||||
  Rat   841 LKSAETEKEMATMKEEFQKTKDELAKSEAKRKELEEKLVTLVQEKNDLQLQVQAESENLLDAEER 905

Human   909 CEGLIKSKILLEAKVKELTERLEEEEEMNSELVAKKRNLEDKCSSLKRDIDDLELTLTKVEKEKH 973
            |:.|||:|..||||:||:|||.|:|||:|:||.||||.|||:||.||:|||||||||.|||||||
  Rat   906 CDQLIKAKFQLEAKIKEVTERAEDEEEINAELTAKKRKLEDECSELKKDIDDLELTLAKVEKEKH 970

Human   974 ATENKVKNLSEEMTALEENISKLTKEKKSLQEAHQQTLDDLQVEEDKVNGLIKINAKLEQQTDDL 1038
            |||||||||:||:..|:|.|:|||:|||:|||||||||||||.||||||.|.|:.:|||||.|||
  Rat   971 ATENKVKNLTEELAGLDETIAKLTREKKALQEAHQQTLDDLQAEEDKVNSLSKLKSKLEQQVDDL 1035

Human  1039 EGSLEQEKKLRADLERAKRKLEGDLKMSQESIMDLENDKQQIEEKLKKKEFELSQLQAKIDDEQV 1103
            |.|||||||||.||||.|||||||||::||||:||||||||::|:||||:||.||||:|::|||.
  Rat  1036 ESSLEQEKKLRVDLERNKRKLEGDLKLAQESILDLENDKQQLDERLKKKDFEYSQLQSKVEDEQT 1100

Human  1104 HSLQFQKKIKELQARIEELEEEIEAEHTLRAKIEKQRSDLARELEEISERLEEASGATSAQIEMN 1168
            .|||.|||||||||||||||||||||...|||.||||||.||||||:|||||||.|.||.|||:|
  Rat  1101 LSLQLQKKIKELQARIEELEEEIEAERATRAKTEKQRSDYARELEELSERLEEAGGVTSTQIELN 1165

Human  1169 KKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAATLRKKQADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSELKMEID 1233
            |||||||.|:||||||||||||||.||||||.|||.|||.|||||||||||||||||||.|:|||
  Rat  1166 KKREAEFLKLRRDLEEATLQHEATVATLRKKHADSAAELAEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLEID 1230

Human  1234 DMASNIEALSKSKSNIERTCRTVEDQFSEIKAKDEQQTQLIHDLNMQKARLQTQNGELSHRVEEK 1298
            |::|::|::||||:|:|:.|||:|||.||.:.|:|:..:.:.:|..||:||||:.||||.::|||
  Rat  1231 DLSSSVESVSKSKANLEKICRTLEDQLSEARGKNEETQRSLSELTTQKSRLQTEAGELSRQLEEK 1295

Human  1299 ESLISQLTKSKQALTQQLEELKRQMEEETKAKNAMAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEAKAELQR 1363
            ||::|||::||||.|||:||||||:|||.|||||:|||||||||||||||||||||||.||||||
  Rat  1296 ESIVSQLSRSKQAFTQQIEELKRQLEEENKAKNALAHALQSSRHDCDLLREQYEEEQEGKAELQR 1360

Human  1364 ALSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEENTETANSKCASLEKTKQRLQGE 1428
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::||..|..|:|||||||||||||||
  Rat  1361 ALSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQDSEEQVEAVNAKCASLEKTKQRLQGE 1425

Human  1429 VEDLMRDLERSHTACATLDKKQRNFDKVLAEWKQKLDESQAELEAAQKESRSLSTELFKMRNAYE 1493
            |||||.|:||:::..|.||||||||||||||||.|.:|||||||||.||||||||||||::||||
  Rat  1426 VEDLMVDVERANSLAAALDKKQRNFDKVLAEWKTKCEESQAELEAALKESRSLSTELFKLKNAYE 1490

Human  1494 EVVDQLETLRRENKNLQEEISDLTEQIAETGKNLQEAEKTKKLVEQEKSDLQVALEEVEGSLEHE 1558
            |.:|||||::||||||::||:||||||||.||::.|.||::|.:|.||:|:|:||||.|.:||||
  Rat  1491 EALDQLETVKRENKNLEQEIADLTEQIAENGKSIHELEKSRKQMELEKADIQMALEEAEAALEHE 1555

Human  1559 ESKILRVQLELSQVKSELDRKVIEKDEEIEQLKRNSQRAAEALQSVLDAEIRSRNDALRLKKKME 1623
            |:||||:||||:|||||:|||:.||||||||||||.||..|.:|..||||:||||:|:|||||||
  Rat  1556 EAKILRIQLELTQVKSEIDRKIAEKDEEIEQLKRNYQRTVETMQGALDAEVRSRNEAIRLKKKME 1620

Human  1624 GDLNEMEIQLGHSNRQMAETQKHLRTVQGQLKDSQLHLDDALRSNEDLKEQLAIVERRNGLLLEE 1688
            |||||:||||.|:|||.|||.||||:|||||||:|||||||||..|||||||||||||..||..|
  Rat  1621 GDLNEIEIQLSHANRQAAETIKHLRSVQGQLKDTQLHLDDALRGQEDLKEQLAIVERRANLLQAE 1685

Human  1689 LEEMKVALEQTERTRRLSEQELLDASDRVQLLHSQNTSLINTKKKLEADIAQCQAEVENSIQESR 1753
            :||::..||||||.|:|:||||||:::||||||:||||||:||||||.|:.|.|:|||::.:::|
  Rat  1686 VEELRATLEQTERARKLAEQELLDSNERVQLLHTQNTSLIHTKKKLETDLTQLQSEVEDASRDAR 1750

Human  1754 NAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQK 1818
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1751 NAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNLEQTVKDLQHRLDEAEQLALKGGKKQIQK 1815

Human  1819 LENRVRELENELDVEQKRGAEALKGAHKYERKVKEMTYQAEEDHKNILRLQDLVDKLQAKVKSYK 1883
            ||.|:||||.||:.||||..|::||..||||:|||:|||:|||.||:|||||||||||.||||||
  Rat  1816 LETRIRELEFELEGEQKRNTESVKGLRKYERRVKELTYQSEEDRKNVLRLQDLVDKLQVKVKSYK 1880

Human  1884 RQAEEAEEQANTQLSRCRRVQHELEEAAERADIAESQVNKLRAKSRDVGSQKM 1936
            ||||||:||||..|::.|:.|||||||.||||||||||||||||:||..|.:|
  Rat  1881 RQAEEADEQANVHLTKFRKAQHELEEAEERADIAESQVNKLRAKTRDFTSSRM 1933

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYH13NP_003793.2 Myosin_N 33..77 CDD:460670 19/43 (44%)
MYSc_Myh13 100..770 CDD:276887 572/671 (85%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 659..681 18/21 (86%)
Actin-binding. /evidence=ECO:0000250 761..775 11/13 (85%)
Myosin_tail_1 850..1927 CDD:460256 831/1076 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1917..1938 15/20 (75%)
Myh3NP_036736.1 Myosin_N 33..77 CDD:460670 19/43 (44%)
MYSc_Myh3 100..767 CDD:276878 572/671 (85%)
Actin-binding 656..678 18/21 (86%)
Actin-binding 758..772 11/13 (85%)
Myosin_tail_1 847..1924 CDD:460256 831/1076 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1260..1289 11/28 (39%)

Return to query results.
Submit another query.