DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Gyc76C and gcy-4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001163473.1 Gene:Gyc76C / 8674026 FlyBaseID:FBgn0266136 Length:1525 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_496218.2 Gene:gcy-4 / 191642 WormBaseID:WBGene00001531 Length:1136 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1175 Identity:345/1175 - (29%)
Similarity:552/1175 - (46%) Gaps:205/1175 - (17%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    23 RTVLTVGYLTALTGDLKTRQG----LAISGALTMALDEVNKDPNLLPNVYLDLRWNDTKGDTVLA 83
            |.|:.||    :|..|||..|    ....||:.:||..: |....:.|...:.....|:.|....
 Worm    25 RPVIRVG----ITAALKTENGSIGWAYTGGAVPLALQYL-KSHGYMLNFDFEFHVEYTECDLANT 84

  Fly    84 TKA-ITEMICDGIATIFGPEGPC----------------------YV-EAIVSQSRNIPMISYKC 124
            .:| :..|..:....|.||  ||                      :| |:.:|.....|.:    
 Worm    85 VRAGLNFMKTNNYDVIIGP--PCAPALKMMGTLSTIYKKPVLGWGFVSESEISDMNRFPFV---- 143

  Fly   125 AEYRASAIPTFARTEPPDTQVVKSLLALLRYYAWNKFSILYEDVWSPVADLLKDQATKRNMTINH 189
                ||.:|: .:|    ..||.|  .||..|.|::.::||          .|::....:..:|.
 Worm   144 ----ASVLPS-TKT----LGVVTS--KLLEIYGWDRVALLY----------FKNELDYCSSVVND 187

  Fly   190 KQSFIDNRVKCCEQM----LDCCRSGYWYQLVQNTMNRTRIYVFLGAANSLVDFMSSMETAGLFA 250
            .:..:.|..|..:.:    :|...|......:|....|.|:.:|...|.....|.  :..|||..
 Worm   188 VEKSLYNESKSVQIVMKAEIDGSNSESTSATLQVVKTRARVILFCAHAGGEKRFY--LIQAGLLG 250

  Fly   251 --RGEYMVIFVDM------MVYSEREAEKYLRRVDQI--TFMSNCHSTENF-NQMARSLLVVAST 304
              ..||:.:.:.|      :..|..:....|..:..|  :|..|....|:. ..:|..::|:.::
 Worm   251 MNSSEYVHVMLSMRSVGFGVQTSVGKKPLTLSGLPPIWESFTVNPDGMEDLAKSVAAKMIVIDTS 315

  Fly   305 PPTKD--YIQF-TKQVQKYSSKPPFNLEIPRLFVESNFSKFISIYAAYLYDSVKLYAWAVDKMLR 366
            ...:|  ::|: ||.:.....:||.:.::|...:.:  :..:..||.:|:|...:|..||..:..
 Worm   316 SEVRDKTFLQYMTKNIVYAIREPPLSCKVPECLITN--ATGMGAYARHLFDVFYMYGMAVSSLNS 378

  Fly   367 EETRVLTD--------DVIFEVASNGTRVIDTIIKNRTYMSITGSKIKIDQYGDSEGNFSVLAYK 423
            .:..|..:        ...||..:...::.:.:.:...| .:.|...:.||.  |..:.|::   
 Worm   379 TDPNVYGNLSLLIPKFTTAFEGMTGEVKLNEDLARKPLY-QVYGLNSEYDQI--SLIDISLI--- 437

  Fly   424 PHKWNNSNNMPCNYHMVPVAYFHQGEEHPEYKLINGSID----WPSGGEKPADEPMCGFANELCK 484
                |::.|:..||                   .:|:.:    |  ||.:|.|.|:|||..:.|.
 Worm   438 ----NDTVNVVFNY-------------------ADGNTEVWHFW--GGTRPPDTPVCGFLGKSCP 477

  Fly   485 KD--DTHYTSTVAAVVLGVLLFCSGVITMS------------IYRKW-----KIELEIEGLLWKI 530
            ..  :.:....:.|:.:.:|:..:.:|.||            ::.:|     |:.|.:.....| 
 Worm   478 LPIFEQYRALVIVAIAVTILILLAIIICMSSKIRNRRVEQSRLHSEWQIHAIKLRLPMHRRASK- 541

  Fly   531 DPNEIKGYSGNEIVSSPSKVSLMSAQSYGSRWT-----NQFVTSTGRLRGAVVRIKELKFPRKRD 590
            ...|.:..|.:|..:..||........:...:|     |..|.:|..      :::||.      
 Worm   542 SSQESETESASETENFTSKSGDTMTSEFKETYTIQYLENDLVLTTAH------QVQELS------ 594

  Fly   591 ISREIMKEMRLLRELRHDNINSFIGASVEPTRILLVTDYCAKGSLYDIIENEDIKLDDLFIASLI 655
             ..|:||.:: ||:|.|:|:|.|||.|::.:|.:.|...|::|||.|||......:|..|:..:|
 Worm   595 -QAEMMKFVK-LRKLDHENLNKFIGLSIDGSRFVSVWKMCSRGSLQDIISKGSFSMDYFFMFCMI 657

  Fly   656 HDLIKGMIYIHNSQLVYHGNLKSSNCVVTSRWMLQVTDFGLHELRQCAENESIGEHQHYRNQLWR 720
            .|:.:|:.|||.|.|.:||||:|:.|:|...|.:::.||||    |..::|.  |....:|.||.
 Worm   658 RDIAEGLHYIHKSFLRHHGNLRSATCLVNDSWQVKLADFGL----QFLQDEE--EKPFKKNMLWA 716

  Fly   721 APELLRNHIHGSQ---KGDVYAFAIIMYEIFS---------RKGPFGQINFEPKEIVDYVKKLPL 773
            |||::|..:...|   ..|:|:|||:..||.:         ||..:.:|.:.       |||   
 Worm   717 APEVIRGSLSIEQMDSSADIYSFAIVASEILTKREAWDLSRRKEGYEEIKYA-------VKK--- 771

  Fly   774 KGEDPFRPEVESIIEAESCPDYVLACIRDCWAEDPEERPEFSVIRNRLKKMRGGKTKNIMDQMME 838
            .|:...||::...||....   :||.::|||.|:|||||....:...|..|......|:||.:..
 Worm   772 GGQFVLRPDLHIDIEVNQT---LLALVKDCWCENPEERPSAENVCKVLFDMTPNTEDNLMDHVFS 833

  Fly   839 MMEKYANNLEDIVTERTRLLCEEKMKTEDLLHRMLPQSVAEKLTMGQGVEPVSYDLVTIYFSDIV 903
            |:|:|.::||..|.|||:.|..||.|::.||.||||:.|||:|..||.|||.|:||||::|||:|
 Worm   834 MLEEYTSSLEVEVGERTKELTLEKKKSDILLGRMLPKQVAERLKAGQAVEPESFDLVTVFFSDLV 898

  Fly   904 GFTAMSAESTPLQVVNFLNDLYTVFDRIIRGYDVYKVETIGDAYMVVSGLPIKNGDRHAGEIASM 968
            .||.::::.:|.||||.|||:::.||.||..:||||||:|||.::.|||||.:||..|..:|..|
 Worm   899 KFTDLASKCSPFQVVNLLNDVFSNFDSIIEKHDVYKVESIGDGFLCVSGLPNRNGMEHIRQIVGM 963

  Fly   969 ALELLHAVKQHRIAHRPNETLKLRIGMHTGPVVAGVVGLTMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALK 1033
            :|..:...:..||.|.|.|.::||:|:::||.|||||||:|||||||||||||||||||||:...
 Worm   964 SLCFMEFCRNFRIPHLPRERVELRVGINSGPCVAGVVGLSMPRYCLFGDTVNTASRMESNGKPSM 1028

  Fly  1034 IHISNKC-KLALDKLGGGYITEKRGLVNMKGKGDVVTWWLTGANENAIQKKLVDMMDMPP--PLF 1095
            ||:|... .|.::.....:.|..||.|.:||||.:.|:||.|       |..:.....||  .:.
 Worm  1029 IHMSEAAHSLLVNNYPYQFETNSRGEVIIKGKGVMETYWLLG-------KMSLSNQSTPPITKVN 1086

  Fly  1096 SRPRK 1100
            .:|||
 Worm  1087 HKPRK 1091

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Gyc76CNP_001163473.1 PBP1_SAP_GC-like 26..445 CDD:380593 92/472 (19%)
PK_GC-A_B 543..827 CDD:270944 94/300 (31%)
HNOBA <833..881 CDD:462234 24/47 (51%)
CYCc 860..1052 CDD:214485 103/192 (54%)
gcy-4NP_496218.2 PBP1_NPR_GC-like 29..444 CDD:380575 90/460 (20%)
Protein Kinases, catalytic domain 558..819 CDD:473864 93/293 (32%)
HNOBA <832..876 CDD:462234 22/43 (51%)
Guanylate_cyc 882..1070 CDD:425528 99/187 (53%)

Return to query results.
Submit another query.