DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment EIF4G3 and eif4g3b

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_047289187.1 Gene:EIF4G3 / 8672 HGNCID:3298 Length:1822 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_073794999.1 Gene:eif4g3b / 568761 ZFINID:ZDB-GENE-090312-49 Length:1733 Species:Danio rerio


Alignment Length:1934 Identity:1067/1934 - (55%)
Similarity:1235/1934 - (63%) Gaps:313/1934 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSLPQKPALKSGTATAAGTGPGTGAAAAAAAAVPPPHPAAAAAAAAAAAAAAAAAVPPPHPNIRA 65
            ||||.|...|...|.|||||||||                  ..:|:........||        
Zfish     1 MSLPPKAVPKPAAAAAAGTGPGTG------------------QLSASQLRTTLTTVP-------- 39

Human    66 LQTQA-------PQQIPRGPVQQPLEDRIF-TPAVSAVYSTVTQVARQPGTPTPSPYSAHEINKG 122
            ||:.|       |.:.||.|  .||::||| |..||||||    |.|.||    .|::|||||||
Zfish    40 LQSVAQQVFLNFPSRYPRVP--PPLDERIFSTQPVSAVYS----VQRPPG----PPFTAHEINKG 94

Human   123 HPNLAATPPGHASSPGLSQ-----------------------TPYPSGQNAGPTTLVYPQTPQTM 164
            |||||||||||||||||||                       :||.:|||||.|.|||..|.|.|
Zfish    95 HPNLAATPPGHASSPGLSQVSVSTVSTAHLYGHPKGWEPGGGSPYTTGQNAGTTPLVYSPTTQPM 159

Human   165 NSQPQTR--SPPSRTVPIHCTDNWKRRKVLEQTPVYRSLAGRGWIKYCIFFQRPQIQPPRATIPN 227
            |:|||:|  :|..|  |.|                     .:|..:...||||.|:|..|.|||:
Zfish   160 NAQPQSRPFAPGPR--PTH---------------------HQGGFRSIQFFQRTQMQTARPTIPS 201

Human   228 SSPSIRPGAQTPT-AVYQANQHIMM-VNHLPMPYPVPQGPQYCIPQYRHSGPPYVGPPQQYPVQP 290
            ::|.|||.:|||| |||..|||||| :.|  ||:..||..||.|||||||.|.||||||||||||
Zfish   202 NTPPIRPTSQTPTAAVYSPNQHIMMTMAH--MPFHSPQTAQYYIPQYRHSAPQYVGPPQQYPVQP 264

Human   291 PGPGPFYPGPGPGDFPNAY--GTPFYPSQPVY-QSAPIIVPTQQQPPPAKREKKTIRIRDPNQGG 352
            .||..||....||:||..|  |.|:||.|||| .|.||||||.||||||||||||||||||||||
Zfish   265 TGPSTFYAAASPGEFPAPYAAGPPYYPGQPVYTPSPPIIVPTPQQPPPAKREKKTIRIRDPNQGG 329

Human   353 KDITEEIMSGGG-SRNPTPPIGRPTSTPTPP------------------QLPSQVPEHSPVVYGT 398
            ||:|:||:||.| |||||||:|||:||||||                  ||.|||.:|..::|..
Zfish   330 KDVTDEILSGVGLSRNPTPPVGRPSSTPTPPQFLCPHPHYPHIFYLKSQQLNSQVADHGHIMYNV 394

Human   399 VESAHLAASTPVTAASDQKQEEKPK--------PDPVLKSP----------SPVLRLVLSGEKKE 445
            ..|.||.||      .:.|.::|||        ..|.|:.|          |||........|.|
Zfish   395 DSSPHLPAS------FNLKADDKPKLEFSLQRTASPGLRQPDTPLERRDPSSPVQTPSSPPHKPE 453

Human   446 QEGQTSETTAIVSIAELPLPPSPTTVSSVARSTIAAPTSSALSSQPIFTTAIDDRCELSSPREDT 510
            .....|||.:.|:.|..|..|:.|..|:.|.|.:|         :|..|.||....|.|.|.:.:
Zfish   454 LPPSDSETASSVATAPTPSIPASTEESADAPSPLA---------EPSLTKAITPEPESSEPEKSS 509

Human   511 IPIPSLTSCTETSDPLPTNENDDDICKKPCS----VAPNDI-PLVSSTNLINEINGVSEKLSATE 570
            .|.|...|.:.|......| ...|:...|.|    ..|.:. ||:.::         |...|...
Zfish   510 SPPPQSLSGSLTQHEKAVN-GLTDVDAAPLSEELETQPREASPLLPTS---------SVPQSEPR 564

Human   571 SIVEIVKQEVLPLTLELEILENPPEEMKLECIPAPITP----STVPSFPPTPPTPPASPPHTPVI 631
            .:..::::|..|:.:...:   ||.|....| |..::|    ||..:...|||.||....|.   
Zfish   565 PVTPVLEEESDPINMNSPL---PPVEDDAGC-PDNVSPSLSTSTTAAISTTPPAPPPGLSHP--- 622

Human   632 VPAAATTVSSPSAAITVQRVLEEDESIRTCLSEDAKEIQNKIEVEADGQTEEILDSQN----LNS 692
                    |..|||:.                   :...|..|::..|:..|.|..:.    |.|
Zfish   623 --------SQVSAALD-------------------RRPSNGAEIKETGKENEALPDKRGEPFLQS 660

Human   693 RRSPVPAQIAITVPKTWKKPKDRTRTTEEMLEAELELKAEEELSIDKVLESEQDKMSQG------ 751
            |:|  ..|...:.||||||||:             ::...::...||..:::|..|...      
Zfish   661 RKS--SNQATSSAPKTWKKPKE-------------DMPVGQDQCPDKEEDTDQASMEPAPESPSP 710

Human   752 --FHPERDPSDLKKVKAV-EENGE-EAEPVRNGAESVSEGEGIDANSGSTDSSGDGVTFPFKPES 812
              ...||.||    |.|| ||||| |.||:|||||..||.|           |.|.:..|...|.
Zfish   711 PPVEVERRPS----VGAVLEENGEQEVEPLRNGAEHTSETE-----------SSDSIHPPAVKEP 760

Human   813 W-----KPTDTEGKKQYDREFLLDFQFMPACIQKPEGLPPISDVVLDKINQPKLPMRTLDPRILP 872
            .     :|.:..|||||:|:|||.|||||||:|||||||||||||||||||.|||||.:|||:|.
Zfish   761 LIKVLPQPAEKNGKKQYNRDFLLGFQFMPACVQKPEGLPPISDVVLDKINQNKLPMRPVDPRVLS 825

Human   873 RGPDFTPAFADFGRQTPGGRGVPICKVQSRHGLPILEQSKAPTCPPLVMSHPPMKSLPLGLLNVG 937
            ||||||||||||.|...||||.|                                     |||||
Zfish   826 RGPDFTPAFADFSRPISGGRGAP-------------------------------------LLNVG 853

Human   938 SRRSQPGQRREPRKIIT-VSVKEDVHLKKAENAWKPSQKRDSQADDPENIKTQELFRKVRSILNK 1001
            .|| .||     ||||| |||.::|.||..||||||..||:...:||:..:||||||||||||||
Zfish   854 MRR-PPG-----RKIITNVSVIDEVQLKTTENAWKPGMKREGAVEDPDAQRTQELFRKVRSILNK 912

Human  1002 LTPQMFNQLMKQVSGLTVDTEERLKGVIDLVFEKAIDEPSFSVAYANMCRCLVTLKVPMADKPGN 1066
            ||||||:||||||:.||:||||||||||||||||||:||||||||.|||.||.||||||.|||.:
Zfish   913 LTPQMFSQLMKQVTDLTIDTEERLKGVIDLVFEKAINEPSFSVAYGNMCSCLATLKVPMTDKPNS 977

Human  1067 TVNFRKLLLNRCQKEFEKDKADDDVFEKKQKELEAASAPEERTRLHDELEEAKDKARRRSIGNIK 1131
            ||||||||||||||||||||.|||.||||.:|||||:|..||.||.:||||||||||||||||||
Zfish   978 TVNFRKLLLNRCQKEFEKDKMDDDAFEKKHRELEAATASSERERLQEELEEAKDKARRRSIGNIK 1042

Human  1132 FIGELFKLKMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKI 1196
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1043 FIGELFKLRMLTEAIMHDCVVKLLKNHDEESLECLCRLLTTIGKDLDFEKAKPRMDQYFNQMEKI 1107

Human  1197 VKERKTSSRIRFMLQDVIDLRLCNWVSRRADQGPKTIEQIHKEAKIEEQEEQRKV-QQLMTKE-K 1259
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||:||||||||| |||::|: |
Zfish  1108 VKERKTSSRIRFMLQDVIDLRLHNWVSRRADQGPKTIEQIHKDAKLEEQEEQRKVHQQLLSKDNK 1172

Human  1260 RRPGVQRVDEGGWNTVQGAKNSRVLDPSKFLKITKPTIDEKIQLVPKAQLGSWGKGSSG--GAKA 1322
            |||.|||  |..|:||...||||.:||:|..|.:||.|||||||.|:||: :|.|||||  ||||
Zfish  1173 RRPVVQR--EETWSTVPMTKNSRTIDPAKIPKFSKPAIDEKIQLGPRAQV-NWMKGSSGGAGAKA 1234

Human  1323 SETDALRSSASSLNRFSALQPPA-PSGSTPSTPVEFDSRRTLTSRGSMGREKNDKPLPSATARPN 1386
            ||:||.|.|| ||||:|.|||.| .:.|.|||..:|||||.|.||||.|||:|||||.:..||..
Zfish  1235 SESDASRPSA-SLNRYSPLQPSALQTSSLPSTSPDFDSRRVLGSRGSSGRERNDKPLSAGPARTG 1298

Human  1387 TFMRGGSSKDLLDNQSQEEQRRE--MLETVKQLTGGVDVERNSTEAERNKTRESA-KPEISAMSA 1448
            ......|:|:..:...||..||:  ..:|.|.|....|..|    .|.::.|||| |.|..:..:
Zfish  1299 PISLSSSNKETPEELVQEVSRRDSNASDTPKLLVSTADKSR----LENSQPRESAVKLEALSGPS 1359

Human  1449 HDKAALSEEELERKSKSIIDEFLHINDFKEAMQCVEELNAQGLLHVFVRVGVESTLERSQITRDH 1513
            .||.||||||:||:|||||||||||||:|||:||||||....:|:||||||||||||||||||||
Zfish  1360 PDKPALSEEEMERRSKSIIDEFLHINDYKEALQCVEELEQSAMLYVFVRVGVESTLERSQITRDH 1424

Human  1514 MGQLLYQLVQSEKLSKQDFFKGFSETLELADDMAIDIPHIWLYLAELVTPMLKEGGISMRELTIE 1578
            |||||:||:|:..|.|..||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|||||||||..|
Zfish  1425 MGQLLFQLLQAGVLPKLQFFKGFSETLELADDMAIDIPHIWLYLAELVTPVLREGGISMRELFSE 1489

Human  1579 FSKPLLPVGRAGVLLSEILHLLCKQMSHKKVGALWREADLSWKDFLPEGEDVHNFLLEQKLDFIE 1643
            ||||||||||||:|.|||||||||||||||||:|||::.|||.||:||.||||:|:.|.||:|..
Zfish  1490 FSKPLLPVGRAGILFSEILHLLCKQMSHKKVGSLWRDSGLSWADFIPETEDVHSFITEHKLEFTL 1554

Human  1644 SDSPCSSEALSKKELSAEELYKRLEKLIIEDKANDEQIFDWVEANLDEIQMSSPTFLRALMTAVC 1708
            ||....:||:||:.||.|||.|:||||::||...||||||||||||||.:|||..|:||||||||
Zfish  1555 SDGSNPTEAVSKRTLSPEELNKQLEKLLLEDMVGDEQIFDWVEANLDESEMSSAPFVRALMTAVC 1619

Human  1709 KAAIIADSSTFRVDTAVIKQRVPILLKYLDSDTEKELQALYALQASIVKLDQPANLLRMFFDCLY 1773
            |||:..:.|:.:||.::|:.|:|:|.|||:||||::|||||||||.|||||||||||||||||||
Zfish  1620 KAAVKTEGSSCKVDLSIIQTRLPVLHKYLNSDTERQLQALYALQALIVKLDQPANLLRMFFDCLY 1684

Human  1774 DEEVISEDAFYKWESSKDPAEQNGKGVALKSVTAFFTWLREAEEESEDN 1822
            ||:|||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1685 DEDVISEDAFYKWEVSKDPAEQQGKGVALKSVTAFFTWLREAEEESEDN 1733

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
EIF4G3XP_047289187.1 PHA03378 <74..492 CDD:223065 230/485 (47%)
MIF4G 992..1220 CDD:397130 205/227 (90%)
MA3 1459..1571 CDD:397128 91/111 (82%)
W2_eIF4G1_like 1665..1793 CDD:211397 94/127 (74%)
W2 <1772..1818 CDD:473053 42/45 (93%)
eif4g3bXP_073794999.1 None

Return to query results.
Submit another query.