DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GFM1 and Gfm1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001295093.1 Gene:GFM1 / 85476 HGNCID:13780 Length:770 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_613057.2 Gene:Gfm1 / 28030 MGIID:107339 Length:751 Species:Mus musculus


Alignment Length:773 Identity:683/773 - (88%)
Similarity:716/773 - (92%) Gaps:25/773 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRLLGAAAVAALGRG---RAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKTTL 62
            ||||..|  ||||||   |.||.||||.||.:||..||.|||.:|||||||||||||||||||||
Mouse     1 MRLLRVA--AALGRGPFPRVPAVLGWQGKQADWKTRRWCSSGPVPNEKIRNIGISAHIDSGKTTL 63

Human    63 TERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIIDTPGHVDF 127
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse    64 TERVLYYTGRIATMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDININIIDTPGHVDF 128

Human   128 TIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMRS 192
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:||||||||
Mouse   129 TIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVSRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPSRALQQMRS 193

Human   193 KLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGHFLRDFLPLLWNWDRRSGSQIVRYGEI 257
            ||||||||:|||:||||:||||:|||||||||||||||                   |||||.||
Mouse   194 KLNHNAAFVQIPIGLEGDFKGIIDLIEERAIYFDGDFG-------------------QIVRYDEI 239

Human   258 PAELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSALKN 322
            ||.|||||.|||||||||||||||||||:||||||||:||||.|||||||.||||||||||||||
Mouse   240 PAGLRAAAADHRQELIECVANSDEQLGELFLEEKIPSVSDLKRAIRRATLSRSFTPVFLGSALKN 304

Human   323 KGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKLEVGRFGQL 387
            ||||||||||||||||||||||||||| ::|||||||||||..||:||||||||||||.||||||
Mouse   305 KGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILN-QNDSKEKTKILMNPQRDDSHPFVGLAFKLEAGRFGQL 368

Human   388 TYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTD 452
            ||||:||||||||.|||||||.||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:
Mouse   369 TYVRNYQGELKKGSTIYNTRTGKKVRVQRLVRMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTN 433

Human   453 KANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTFKVYFDTENKETVISGMGE 517
            |.||.|||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||:||.|:|||::|||||
Mouse   434 KDNSDLSMESIHVPEPVISIAMRPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTFKVHFDPESKETIVSGMGE 498

Human   518 LHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPED 582
            |||||||||:|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||:||||||||||.|||
Mouse   499 LHLEIYAQRMEREYGCPCITGKPKVAFRETIVAPVPFDFTHKKQSGGAGQFGKVIGVLEPLPPED 563

Human   583 YTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIR 647
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   564 YTKLEFSDETFGSNVPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIR 628

Human   648 AGEGALKQALANATLCILEPIMAVEVVAPNEFQGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPL 712
            ||||||||||||.||||:||||:|||:|||||||.|.|||||||||||||||:||||||||||||
Mouse   629 AGEGALKQALANGTLCIIEPIMSVEVIAPNEFQGTVFAGINRRHGVITGQDGIEDYFTLYADVPL 693

Human   713 NDMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYSRYQPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN 770
            |:||||||||||||||||||||||.|||||.|||||::||||||||||||||||||||
Mouse   694 NNMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYCRYQPCSPSTQEELINKYLEATGQLPVKKGKAKN 751

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GFM1NP_001295093.1 FusA 39..754 CDD:440248 639/714 (89%)
Gfm1NP_613057.2 FusA 45..735 CDD:440248 636/709 (90%)

Return to query results.
Submit another query.