DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment GFM1 and Gfm1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001295093.1 Gene:GFM1 / 85476 HGNCID:13780 Length:770 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_446077.2 Gene:Gfm1 / 114017 RGDID:631396 Length:751 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:773 Identity:682/773 - (88%)
Similarity:718/773 - (92%) Gaps:25/773 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MRLLGAAAVAALGRG---RAPASLGWQRKQVNWKACRWSSSGVIPNEKIRNIGISAHIDSGKTTL 62
            ||||  ...|.||||   |.||.||||.||.|||..||.|||.||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MRLL--RITAGLGRGPLPRVPAILGWQGKQANWKTYRWCSSGSIPNEKIRNIGISAHIDSGKTTL 63

Human    63 TERVLYYTGRIAKMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWKDVNINIIDTPGHVDF 127
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||
  Rat    64 TERVLYYTGRIATMHEVKGKDGVGAVMDSMELERQRGITIQSAATYTMWRDVNINIIDTPGHVDF 128

Human   128 TIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVNRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMRS 192
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   129 TIEVERALRVLDGAVLVLCAVGGVQCQTMTVSRQMKRYNVPFLTFINKLDRMGSNPARALQQMRS 193

Human   193 KLNHNAAFMQIPMGLEGNFKGIVDLIEERAIYFDGDFGHFLRDFLPLLWNWDRRSGSQIVRYGEI 257
            ||||||||:|||:||||:||||:|||||||||||||||                   |||||.||
  Rat   194 KLNHNAAFVQIPIGLEGDFKGIIDLIEERAIYFDGDFG-------------------QIVRYDEI 239

Human   258 PAELRAAATDHRQELIECVANSDEQLGEMFLEEKIPSISDLKLAIRRATLKRSFTPVFLGSALKN 322
            ||:|||||.|||||||||||||||||||:||||||||:||||||||||||.||||||||||||||
  Rat   240 PADLRAAAADHRQELIECVANSDEQLGELFLEEKIPSVSDLKLAIRRATLSRSFTPVFLGSALKN 304

Human   323 KGVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNKEDDSKEKTKILMNSSRDNSHPFVGLAFKLEVGRFGQL 387
            ||||||||||||:|||||||||||:|| ::|||||.|||||..||:||||||||||||.||||||
  Rat   305 KGVQPLLDAVLEFLPNPSEVQNYALLN-QNDSKEKNKILMNPKRDDSHPFVGLAFKLEAGRFGQL 368

Human   388 TYVRSYQGELKKGDTIYNTRTRKKVRLQRLARMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTD 452
            ||||:||||||||.|||||||.||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||:
  Rat   369 TYVRNYQGELKKGSTIYNTRTGKKVRVQRLVRMHADMMEDVEEVYAGDICALFGIDCASGDTFTN 433

Human   453 KANSGLSMESIHVPDPVISIAMKPSNKNDLEKFSKGIGRFTREDPTFKVYFDTENKETVISGMGE 517
            |.||.||||||||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||:||||:|||::|||||
  Rat   434 KDNSDLSMESIHVPDPVISVAMKPSNKNDLEKFSKGIARFTREDPTFKVHFDTESKETIVSGMGE 498

Human   518 LHLEIYAQRLEREYGCPCITGKPKVAFRETITAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLDPED 582
            |||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||.|||
  Rat   499 LHLEIYAQRMEREYGCPCITGKPKVAFRETVTAPVPFDFTHKKQSGGAGQYGKVIGVLEPLAPED 563

Human   583 YTKLEFSDETFGSNIPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIR 647
            ||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   564 YTKLEFSDETFGANVPKQFVPAVEKGFLDACEKGPLSGHKLSGLRFVLQDGAHHMVDSNEISFIR 628

Human   648 AGEGALKQALANATLCILEPIMAVEVVAPNEFQGQVIAGINRRHGVITGQDGVEDYFTLYADVPL 712
            |||||||||||:|||||:||||:|||:|||||||.|.|||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   629 AGEGALKQALASATLCIIEPIMSVEVIAPNEFQGAVFAGINRRHGVITGQDGIEDYFTLYADVPL 693

Human   713 NDMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYSRYQPCLPSTQEDVINKYLEATGQLPVKKGKAKN 770
            |:||||||||||||||||||||||:|||||.|||||:::|||||||||||||||||||
  Rat   694 NNMFGYSTELRSCTEGKGEYTMEYNRYQPCSPSTQEELVNKYLEATGQLPVKKGKAKN 751

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
GFM1NP_001295093.1 FusA 39..754 CDD:440248 639/714 (89%)
Gfm1NP_446077.2 FusA 45..735 CDD:440248 635/709 (90%)

Return to query results.
Submit another query.