Protein Alignment AP3B1 and Ap3b1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_003655.3
• Gene: AP3B1 / 8546
• HGNCID: 566
• Length: 1094
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001416145.1
• Gene: Ap3b1 / 309969
• RGDID: 1310256
• Length: 1096
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1106
• Identity: 975/1106 - (88%)
• Similarity: 1026/1106 - (92%)
• Gaps: 22/1106 - (1%)

Human     1 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKR 65
            ||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSSNSFAYNEQSGGGEAAELGQEATSTISSSGAFGLFSSDWKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKR 65

Human    66 IVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQL 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 IVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQL 130

Human   131 IRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKL 195
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 IRASALRVLSSIRVPIIVPVMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKL 195

Human   196 LKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPW 260
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHRNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPW 260

Human   261 KEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWH 325
            :|.|.:|||.||||:|||:  ||...|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 REDDGVEDNEKNFYDSDDE--EKKSGKKKPYSMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWH 323

Human   326 ISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKL 390
            |||:||||:|||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   324 ISPRSEAGVISKSLVRLLRSHREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKL 388

Human   391 EILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDE 455
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|.|||||||||||||||||||
  Rat   389 EILTNLANEANISTLLREFQTYVRSQDKQFAAATIQTIGRCATSIAEVTDTCLNGLVCLLSNRDE 453

Human   456 IVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRK 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   454 IVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRK 518

Human   521 MAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNV 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   519 MAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNE 583

Human   586 KSGALSKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVRN 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||
  Rat   584 KSGALSKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNVKASGYLELSNWPEVAPDPSVRN 648

Human   651 VEVIELAKEWTPAGKAKQENSAKKFYSESE------------EEEDSSDSSSDSESESGSESGEQ 703
            |||||.||||||.||.|:|...||||||||            ||||.|||||||||.||.
  Rat   649 VEVIESAKEWTPLGKTKKEKPEKKFYSESEEEEEEEEEDEEDEEEDPSDSSSDSESGSGR----- 708

Human   704 GESGEEGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEKSKTSDSS 768
             |||:.|.|:|||||||||.||||:|.|:..|::|.||.|||.|.||.|||.||:|.||:.|:||
  Rat   709 -ESGDSGSSSEDSSEDSSSGQDSETGSEAEAEHQRVAKTNSKTKRKSASEDREKKNGKSQASESS 772

Human   769 NDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNPVSTPVAL 833
            ::||||.|:|||:|||.|  :||...|:..|.||:|.:|:|.|.:|||.||||||||||||||||
  Rat   773 SEESSSTEESSSESESGS--DSEPAPRKTAKAKERKPQQERHPPSKDVFLLDLDDFNPVSTPVAL 835

Human   834 PTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQPCIFGDK 898
            |||||||||:||||||:||||||:|:||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
  Rat   836 PTPALSPSLIADLEGLNLSTSSSIINVSTPVFVPTKTHELLHRMRGKGLAAHYCFPRQPCIFGDK 900

Human   899 MVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDSTQTASFQ 963
            |||:||||.||:|.||||||:|.|||.:|::||||:||:|||||||:||||||||||||||||||
  Rat   901 MVSVQITLTNTSDGKIENIHVGGKKLAVGVQMHVFHPIESLEPEGSVTVSMGIDFCDSTQTASFQ 965

Human   964 LCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGVLTGMNETSAVIIAAPQNFTPSVIFQKVVN 1028
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||.:||||||||||:|.|||||
  Rat   966 LCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKEQGMLTGMNETSATLIAAPQNFTPSMILQKVVN 1030

Human  1029 VANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQ 1093
            |||:|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1031 VANLGAVPSSQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIINTEKTVIGSVLLRELKPVLSQ 1095

Human  1094 G 1094
            |
  Rat  1096 G 1096

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
AP3B1	NP_003655.3	Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1..31		27/29 (93%)
		Adaptin_N	46..581	CDD:396262	513/534 (96%)
		HEAT repeat	116..144	CDD:293787	27/27 (100%)
		HEAT repeat	150..180	CDD:293787	28/29 (97%)
		HEAT repeat	188..213	CDD:293787	24/24 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	268..292		15/23 (65%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	662..811		90/160 (56%)
		SEEEED	<731..>764	CDD:434218	19/32 (59%)
		AP3B1_C	813..958	CDD:464319	121/144 (84%)
Ap3b1	NP_001416145.1	None