DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment AP3B1 and Ap3b1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003655.3 Gene:AP3B1 / 8546 HGNCID:566 Length:1094 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006517586.1 Gene:Ap3b1 / 11774 MGIID:1333879 Length:1118 Species:Mus musculus


Alignment Length:1126 Identity:969/1126 - (86%)
Similarity:1020/1126 - (90%) Gaps:40/1126 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKR 65
            ||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MSSNSFAYNEQSGGGEAAELGQEATSTISPSGAFGLFSSDWKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKR 65

Human    66 IVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQL 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 IVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQL 130

Human   131 IRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKL 195
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 IRASALRVLSSIRVPIIVPVMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKL 195

Human   196 LKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPW 260
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 LKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHRNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPW 260

Human   261 KEGDELEDNGKNFYESDDDQKEK-TDKKKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYW 324
            :|...||||.||||||:::::|| ...:||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 REDGGLEDNEKNFYESEEEEEEKEKSSRKKSYAMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYW 325

Human   325 HISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLK 389
            |||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 HISPKSEAGVISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIERKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLK 390

Human   390 LEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRD 454
            ||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||
Mouse   391 LEILTNLANEANISTLLREFQTYVRSQDKQFAAATIQTIGRCATSISEVTDTCLNGLVCLLSNRD 455

Human   455 EIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLR 519
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 EIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIRHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLR 520

Human   520 KMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPN 584
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 KMAKSFTSEDDLVKLQILNLAAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPN 585

Human   585 VKSGALSKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSVR 649
            .|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse   586 EKSGALSKYAKKIFLAPKPAPLLESPFKDRDRFQLGTLSHTLNIKASGYLELSNWPEVAPDPSVR 650

Human   650 NVEVIELAKEWTPAGKAKQENSAKKFYSESEEEEDS------------------SDSSSDSESES 696
            ||||||.||||||.||.|:|...||||||||||||.                  |||||||||.|
Mouse   651 NVEVIESAKEWTPLGKTKKEKPMKKFYSESEEEEDEDEDEDEEEEEKEDEDENPSDSSSDSESGS 715

Human   697 GSESGEQGESGEEGDSNEDSSEDSSSEQDSESGRESGLENKRTAKRNSKAKGKSDSEDGEKENEK 761
            |||||:.|        .|||||||||.||||:|.::..|.::.||||||.|.|||||:.||:||.
Mouse   716 GSESGDTG--------TEDSSEDSSSGQDSETGSQAEAERQKVAKRNSKTKRKSDSENREKKNEN 772

Human   762 SKTSDSSNDESSSIEDSSSDSESESEPESESESRRVTKEKEKKTKQDRTPLTKDVSLLDLDDFNP 826
            ||.|:||::||||:|||||:|||||..:||...|.|...||:|.:|:|.|.:|||.|||||||||
Mouse   773 SKASESSSEESSSMEDSSSESESESGSDSEPAPRNVAPAKERKPQQERHPPSKDVFLLDLDDFNP 837

Human   827 VSTPVALPTPALSPSLMADLEGLHLSTSSSVISVSTPAFVPTKTHVLLHRMSGKGLAAHYFFPRQ 891
            ||||||||||||||||:||||||:||||||||:||||.|||||||.|||||.||||||||.||||
Mouse   838 VSTPVALPTPALSPSLIADLEGLNLSTSSSVINVSTPVFVPTKTHELLHRMHGKGLAAHYCFPRQ 902

Human   892 PCIFGDKMVSIQITLNNTTDRKIENIHIGEKKLPIGMKMHVFNPIDSLEPEGSITVSMGIDFCDS 956
            ||||.|||||:||||.||:||||||||||.|.||:||:||.|:|||||||:||:|||:|||||||
Mouse   903 PCIFSDKMVSVQITLTNTSDRKIENIHIGGKGLPVGMQMHAFHPIDSLEPKGSVTVSVGIDFCDS 967

Human   957 TQTASFQLCTKDDCFNVNIQPPVGELLLPVAMSEKDFKKE-------------QGVLTGMNETSA 1008
            |||||||||||||||||.:||||||||.||||||||||||             ||.|||||||||
Mouse   968 TQTASFQLCTKDDCFNVTLQPPVGELLSPVAMSEKDFKKEQACLCFTSVCSANQGTLTGMNETSA 1032

Human  1009 VIIAAPQNFTPSVIFQKVVNVANVGAVPSGQDNIHRFAAKTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIIN 1073
            .:||||||||||:|.||||||||:|||||.|||:|||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse  1033 TLIAAPQNFTPSMILQKVVNVANLGAVPSSQDNVHRFAARTVHSGSLMLVTVELKEGSTAQLIIN 1097

Human  1074 TEKTVIGSVLLRELKPVLSQG 1094
            |||||||||||||||||||||
Mouse  1098 TEKTVIGSVLLRELKPVLSQG 1118

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
AP3B1NP_003655.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..31 27/29 (93%)
Adaptin_N 46..581 CDD:396262 509/535 (95%)
HEAT repeat 116..144 CDD:293787 27/27 (100%)
HEAT repeat 150..180 CDD:293787 28/29 (97%)
HEAT repeat 188..213 CDD:293787 24/24 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 268..292 12/24 (50%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 662..811 92/166 (55%)
SEEEED <731..>764 CDD:434218 18/32 (56%)
AP3B1_C 813..958 CDD:464319 122/144 (85%)
Ap3b1XP_006517586.1 Adaptin_N 46..582 CDD:396262 509/535 (95%)
HEAT repeat 116..144 CDD:293787 27/27 (100%)
HEAT repeat 150..180 CDD:293787 28/29 (97%)
HEAT repeat 188..213 CDD:293787 24/24 (100%)
SEEEED <734..792 CDD:434218 35/57 (61%)
AP3B1_C 824..969 CDD:464319 122/144 (85%)

Return to query results.
Submit another query.