DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PPFIA3 and ppfia3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003651.1 Gene:PPFIA3 / 8541 HGNCID:9247 Length:1194 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_003198161.2 Gene:ppfia3 / 567230 ZFINID:ZDB-GENE-100311-3 Length:1226 Species:Danio rerio


Alignment Length:1253 Identity:930/1253 - (74%)
Similarity:1024/1253 - (81%) Gaps:86/1253 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMCEVMPTISEDGRRGSALGP-----------------------------DEAG--GELERLMVT 34
            ||||||||||||||.|:..||                             ||.|  |.||.|||.
Zfish     1 MMCEVMPTISEDGRGGAGGGPSSPAGGGGGMGGGAGGMGGGYGGREARGGDEGGSTGNLESLMVN 65

Human    35 MLTERERLLETLREAQDGLATAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLER 99
            ||||||||||:|||.|:.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||:||||||||
Zfish    66 MLTERERLLESLRETQESLGTAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAVLTKELNVCREQLLER 130

Human   100 EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHK 164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Zfish   131 EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHK 195

Human   165 ALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGG 229
            |||||||||||:|||||||||||||.|..|.|:||:|:.||..||:. ||    :.|.||.....
Zfish   196 ALDEKVRERLRVALERVAVLEEELESSTNEVLSLRDQIKRRERGLDN-GK----ERLPNGPSSIL 255

Human   230 DSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEA 294
            |......:.|..:||||||:.||:||||::|||:.::||:|.||.|||.|:||||.|||||:|||
Zfish   256 DDGEIDRQREGEIERQRAELSQLKERLALMCRQVGEIEEQLTTARRELAKSEEANQKLQRDVKEA 320

Human   295 LAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQ 359
            |.|||||||||||||:||||||||||||||..||||||||||||||||||||:|||.|.||||||
Zfish   321 LCQREDMEERITTLERRYLSAQREATSLHDIKDKLENELASKESLYRQSEEKNRQLQERLDDAKQ 385

Human   360 KLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMND 424
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Zfish   386 KLQQTLQRAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRERMND 450

Human   425 DHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMER 489
            :||||||:|||||||||||||||||||||.||||||:||||:|||||:||:||.||:||:||:||
Zfish   451 EHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEEKNALSEELANMKKIQDDLLANKDQLIAELER 515

Human   490 MQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQ-APTLPSGA--HLDPY----VAGSGRAGKRGRWS 547
            :|:|:|||||||.|||||||||||||||||| ..:||:|:  ||:.|    ..|..|...|||||
Zfish   516 LQLELDQLRGRPGSSYSRSLPGSALELRYSQGGGSLPAGSTTHLEHYGNTGTGGVVRRTHRGRWS 580

Human   548 GVKEEPSK--DWERSAPAGSIPPPFPGELD---GSDEEEAEGMFGAELLSPSGQADVQTLAIMLQ 607
            |.:|:.||  |||..|..||   .|.|.::   ..|||:.|.:||:||||||||.||||||||||
Zfish   581 GAREDASKYGDWESGALLGS---GFEGGVEDRCSDDEEDRETLFGSELLSPSGQTDVQTLAIMLQ 642

Human   608 EQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD-------SLGRYRSSCS-LPPSLTTSTL 664
            ||||||||||||||||||:||.||||:||||||..||       ||||..:... :|||||:|||
Zfish   643 EQLEAINKEIKLIQEEKESTELRAEEIESRVSSVALDGPPIPPTSLGRDSTGRGFIPPSLTSSTL 707

Human   665 ASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPRSARLERMTQ 729
            ||||||||||||||| |.||||| ||:.|:  ||:     ....|:...|||||||:.||:|||.
Zfish   708 ASPSPPSSGHSTPRL-PHSPARE-TDRQNN--KED-----DRSLALLDSTPPPTPRALRLDRMTH 763

Human   730 AL--ALQAGSLE------DGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDS 786
            ..  ||...|.|      ||.   .|..:.||||||.||||||||||||||||:|.|||.|||:|
Zfish   764 THPGALLDDSREFRSLSADGS---SSNSSQDSLHKASKKKSIKSSIGRLFGKKDKVRMGQPGRES 825

Human   787 SSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWV 851
            :|||.||||:....|||||.|:.||.|||||:|:||||||||||||||||:||||||||||||||
Zfish   826 TSLASTPSDDLGTVDPLGLTKMAGPVDKDRRSKKKHELLEEACRQGLPFASWDGPTVVSWLELWV 890

Human   852 GMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTS 916
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|:|
Zfish   891 GMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASTRSS 955

Human   917 TGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDA 981
            |.||||||.|||||||.||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   956 TSNVWMTHAEMESLTAATKPELKEISWDQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDA 1020

Human   982 RMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERV 1046
            ||||||.||||||||||||||||||:|||||||||||||||:|||||:|||.|.:||||||||||
Zfish  1021 RMLDHLTKKELRGQLKMVDSFHRVSMHYGIMCLKRLNYDRKELERRRDESQHQNKDVMVWSNERV 1085

Human  1047 MGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLG 1111
            |.||..:||||:|.|||||||||||||||:||||:|||||||||.||.|||||||||:::|||:|
Zfish  1086 MCWVQSIGLKEYADNLTESGVHGALLALDDTFDYTDLALLLQIPNQNTQARQLLEKEYNSLISMG 1150

Human  1112 TDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEG 1176
            |:||.|||..|:|:||||||||||||||||||.||:|.||.|||   |.|:.:|.:.|||:    
Zfish  1151 TERRPDEDGTKTFTRSPSWRKMFREKDLRGVTSDSSETLPANFR---ASAISTPSVTLRKV---- 1208

Human  1177 QTSGSSRADGVSVRTYSC 1194
            |:..|.||:..|||||||
Zfish  1209 QSDASPRAESGSVRTYSC 1226

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PPFIA3NP_003651.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 17/50 (34%)
Smc 39..>635 CDD:440809 470/607 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 202..233 10/30 (33%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 525..583 27/68 (40%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 624..819 124/210 (59%)
PHA03307 630..>836 CDD:223039 135/221 (61%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 835..905 CDD:188961 68/69 (99%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 952..1017 CDD:188964 62/64 (97%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1037..1108 CDD:188967 57/70 (81%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1157..1194 15/36 (42%)
ppfia3XP_003198161.2 Smc 77..>670 CDD:440809 464/600 (77%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 874..944 CDD:188961 68/69 (99%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 991..1056 CDD:188964 62/64 (97%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1076..1147 CDD:188967 57/70 (81%)

Return to query results.
Submit another query.