DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PPFIA3 and Ppfia3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003651.1 Gene:PPFIA3 / 8541 HGNCID:9247 Length:1194 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001257914.1 Gene:Ppfia3 / 140591 RGDID:620054 Length:1192 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1194 Identity:1169/1194 - (97%)
Similarity:1177/1194 - (98%) Gaps:2/1194 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRLRELGH 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRLRELGH 65

Human    66 EKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERS 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 EKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERS 130

Human   131 LRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQET 195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   131 LRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQEA 195

Human   196 LNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLC 260
            ||||:|||||||||||||||||||||||||||.|:|:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LNLRDQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPVGESSRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLC 260

Human   261 RQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 RQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA 325

Human   326 NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEE 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEE 390

Human   391 RHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 RHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGA 455

Human   456 LEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQ 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
  Rat   456 LEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPP-SYSRSLPGSALELRYSQ 519

Human   521 APTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPPPFPGELDGSDEEEAEGM 585
            ||||||||.||||.||||||||||||||.|:|.||||:||.||||||||||||||||||||.|||
  Rat   520 APTLPSGAPLDPYGAGSGRAGKRGRWSGAKDESSKDWDRSTPAGSIPPPFPGELDGSDEEETEGM 584

Human   586 FGAELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYR 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   585 FGAELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYR 649

Human   651 SSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTP 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.|||||:|||.|||||||||||||
  Rat   650 SSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPARE-TDKTNHVPKDEAGVPRGEGPAIPGDTP 713

Human   716 PPTPRSARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG 780
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||:||||||||||||||||||||
  Rat   714 PPTPRSARLERMTQALALQAGSLEDGAPPRGSESTPDSLHKAPKRKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG 778

Human   781 PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVS 845
            ||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   779 PPGRESVSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVS 843

Human   846 WLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAP 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   844 WLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAP 908

Human   911 ASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFM 975
            |||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   909 ASSRTPTGNVWMTHEEMESLTAATKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFM 973

Human   976 ESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMV 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   974 ESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMV 1038

Human  1041 WSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFS 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1039 WSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFS 1103

Human  1106 NLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLR 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1104 NLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLR 1168

Human  1171 KLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC 1194
            ||||||||||||||||||||||||
  Rat  1169 KLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC 1192

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PPFIA3NP_003651.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 21/21 (100%)
Smc 39..>635 CDD:440809 581/595 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 202..233 28/30 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 525..583 50/57 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 624..819 185/194 (95%)
PHA03307 630..>836 CDD:223039 196/205 (96%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 835..905 CDD:188961 69/69 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 952..1017 CDD:188964 64/64 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1037..1108 CDD:188967 70/70 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1157..1194 36/36 (100%)
Ppfia3NP_001257914.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 21/21 (100%)
Smc 39..>634 CDD:440809 581/595 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 201..239 34/37 (92%)
PHA03307 493..>795 CDD:223039 285/303 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 521..587 57/65 (88%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 623..815 183/192 (95%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 833..903 CDD:188961 69/69 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 950..1015 CDD:188964 64/64 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1035..1106 CDD:188967 70/70 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1155..1192 36/36 (100%)

Return to query results.
Submit another query.