DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PPFIA3 and ppfia3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003651.1 Gene:PPFIA3 / 8541 HGNCID:9247 Length:1194 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_012823004.1 Gene:ppfia3 / 100491659 XenbaseID:XB-GENE-6040150 Length:1214 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1226 Identity:988/1226 - (80%)
Similarity:1084/1226 - (88%) Gaps:44/1226 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRLRELGH 65
            |||||||||:||.||||....|:|  ..|:|||.||.||||||:||||.|:.|||||||||||||
 Frog     1 MMCEVMPTINEDNRRGSTYSSDDA--NFEQLMVNMLNERERLLDTLRETQESLATAQLRLRELGH 63

Human    66 EKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERS 130
            ||:||||||:||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog    64 EKESLQRQLNIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEISELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERS 128

Human   131 LRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQET 195
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||:|:||:
 Frog   129 LRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRVALERVAVLEEELEMSSQES 193

Human   196 LNLREQLSRRRSGLEEPGKDGD--GQTLANGLG----PGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRE 254
            :.|||||:|||||:::.|||||  ..|:.||..    .||    |.:||||.||:||.|:|||:|
 Frog   194 IALREQLARRRSGIDDGGKDGDTPSSTILNGSSHLELRGG----RESELEEMLEKQRLELCQLKE 254

Human   255 RLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREA 319
            ||.::||||::|||||.||.::|.|:||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   255 RLTMMCRQMAELEEELNTAQKDLIKSEEVNAKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREA 319

Human   320 TSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAA 384
            |||||.|||||||||||||||||||||:|||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   320 TSLHDVNDKLENELASKESLYRQSEEKNRQLQEWLEDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAA 384

Human   385 LNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHL 449
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
 Frog   385 LSKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDEHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHL 449

Human   450 KERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSAL 514
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||:||:||||:|||||||||.|:||||||||||
 Frog   450 KERMGALEEKNTLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLVAEIERMQLEIDQLRGRPSSTYSRSLPGSAL 514

Human   515 ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSG---RAGKRGRWSGVKEEPSK-------DWERSAPA---GSI 566
            |||||||||||.|:|:|.|  ||.   |..|:|||:.:|::|||       ||||:..|   .::
 Frog   515 ELRYSQAPTLPMGSHVDHY--GSTAVIRRPKKGRWAAMKDDPSKTRTLDEQDWERAQQANVLANV 577

Human   567 PPPFPGELDGSDEEEAEGMF-GAELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQR 630
            ...|..:||||||::.:.:| .|:|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|
 Frog   578 AQAFEADLDGSDEDDRDTIFSSADLLSPSGQTDVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTELR 642

Human   631 AEELESRVSSSGLD-SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANH 694
            |||:||||:|..|| |||||||:.|:|.|:|||||||||||||||||||:.|.|||||| ||.||
 Frog   643 AEEIESRVTSGTLDGSLGRYRSASSIPTSVTTSTLASPSPPSSGHSTPRITPHSPAREG-DKFNH 706

Human   695 VPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPP-TPRSARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGS---EG------ 749
            :|||::   |.|...:..:|..| |||:.|||||||||||||.|||||...|.|   :|      
 Frog   707 LPKEDS---RDEKALMQCETTAPLTPRAVRLERMTQALALQASSLEDGRDQRASLAADGLGGTNS 768

Human   750 -TPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGD 813
             :.||||||.||||||||||||||||||||||..||:|||.|||||:||...||:||:||.||.|
 Frog   769 TSQDSLHKAAKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGQMGRESSSAAGTPSEETSPADPMGLSKLGGPVD 833

Human   814 KDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTE 878
            ||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   834 KDRRNKKKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTE 898

Human   879 IQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISW 943
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||
 Frog   899 IQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPATSRTSTGNVWMTHEEMETLTATTKPETKEISW 963

Human   944 EQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLH 1008
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   964 EQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLH 1028

Human  1009 YGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLA 1073
            ||||||||||||||:|||||||||.|::|||||||||||.||..:||||:|.||.||||||||:|
 Frog  1029 YGIMCLKRLNYDRKELERRREESQNQLKDVMVWSNERVMCWVQAIGLKEYANNLQESGVHGALIA 1093

Human  1074 LDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKD 1138
            ||:|||::||||||||||||.||||:||||||:|||:||:|||||||||:|||||||||||||||
 Frog  1094 LDDTFDFNDLALLLQIPTQNTQARQVLEKEFSSLISMGTERRLDEDSAKTFSRSPSWRKMFREKD 1158

Human  1139 LRGVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC 1194
            ||||:||||||||||||:||..::.||.:.|||:|.||.||.|.|||.||||||||
 Frog  1159 LRGVSPDSAEMLPPNFRTAAVSSITSPAVQLRKMQSEGSTSTSPRADNVSVRTYSC 1214

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PPFIA3NP_003651.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..23 15/21 (71%)
Smc 39..>635 CDD:440809 496/615 (81%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 202..233 16/36 (44%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 525..583 28/70 (40%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 624..819 140/206 (68%)
PHA03307 630..>836 CDD:223039 151/217 (70%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 835..905 CDD:188961 69/69 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 952..1017 CDD:188964 64/64 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1037..1108 CDD:188967 56/70 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1157..1194 22/36 (61%)
ppfia3XP_012823004.1 SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat1 855..925 CDD:188961 69/69 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat2 972..1037 CDD:188964 64/64 (100%)
SAM_liprin-alpha1,2,3,4_repeat3 1057..1128 CDD:188967 56/70 (80%)
Smc 44..>649 CDD:440809 491/610 (80%)

Return to query results.
Submit another query.