DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CDC42BPA and Cdc42bpa

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001374479.1 Gene:CDC42BPA / 8476 HGNCID:1737 Length:1845 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017175608.1 Gene:Cdc42bpa / 226751 MGIID:2441841 Length:1810 Species:Mus musculus


Alignment Length:1845 Identity:1728/1845 - (93%)
Similarity:1772/1845 - (96%) Gaps:35/1845 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTS 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MSGEVRLRQLEQFILDGPAQTNGQCFSVETLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTS 65

Human    66 KVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLV 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 KVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFGEVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLV 130

Human   131 NGDNKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQL 195
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
Mouse   131 NGDSKWITTLHYAFQDDNNLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEEMARFYLAEMVIAIDSVHQL 195

Human   196 HYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYG 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 HYVHRDIKPDNILMDMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKGRYG 260

Human   261 PECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 PECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSR 325

Human   326 EHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHT 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 EHRLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPPTHT 390

Human   391 AFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 AFSGHHLPFVGFTYTSSCVLSDRSCLRVTAGPTSLDLDVSVQRTLDNNLATEAYERRIKRLEQEK 455

Human   456 LELSRKLQESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKNLKEEIEKLRKQVTESSHLEQQLEEANAVR 520
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||.|.:||||||||||:||
Mouse   456 LELTRKLQESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKSLKEEIEKLRKQVAEVNHLEQQLEEANSVR 520

Human   521 QELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINER 585
            :|||||||||||.||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 RELDDAFRQIKASEKQIKTLQQEREELNKELVQASERLKNQSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINER 585

Human   586 LTELHTQKQKLARHVRDKEEEVDLVMQKVESLRQELRRTERAKKELEVHTEALAAEASKDRKLRE 650
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||:||||
Mouse   586 LTELHTQKQKLARHVRDKEEEVDLVMQKAESLRQELRRAERAKKELEVHTEALIAEASKDKKLRE 650

Human   651 QSEHYSKQLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEELSKREGIHANEI 715
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||
Mouse   651 QSEHYSKQLENELEGLKQKQISYSPGICSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYEEEISKREGIHASEI 715

Human   716 KNLKKELHDSEGQQLALNKEIMILKDKLEKTRRESQSEREEFESEFKQQYEREKVLLTEENKKLT 780
            |||||||||||||||||||||::||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
Mouse   716 KNLKKELHDSEGQQLALNKEILVLKDKLEKTRRESQSEREEFENEFKQQYEREKVLLTEENKKLT 780

Human   781 SELDKLTTLYENLSIHNQQLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQALASKM 845
            |||||||:|||:||:.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 SELDKLTSLYESLSLRNQHLEEEVKDLADKKESVAHWEAQITEIIQWVSDEKDARGYLQALASKM 845

Human   846 TEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNIIT 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Mouse   846 TEELEALRNSSLGTRATDMPWKMRRFAKLDMSARLELQSALDAEIRAKQAIQEELNKVKASNILT 910

Human   911 ECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTPTDALDQFEDSFSSSS 975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Mouse   911 ECKLKDSEKKNLELLSEIEQLIKDTEELRSEKGIEHQDSQHSFLAFLNTPTDALDQFEDSLSSSS 975

Human   976 SSLIDFLDDRSPSCTPASKGRRTDPVENTYVWNPSVKFHIQSRSTSPSTSSEAEPVKTVDSTPLS 1040
            ||||||||||||||||||||||                                   ..|..||.
Mouse   976 SSLIDFLDDRSPSCTPASKGRR-----------------------------------IADCAPLP 1005

Human  1041 VHTPTLRKKGCPGSTGFPPKRKTHQFFVKSFTTPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITC 1105
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1006 AHTPTLRKKGCPASTGFPPKRKTHQFFVKSFTAPTKCHQCTSLMVGLIRQGCSCEVCGFSCHITC 1070

Human  1106 VNKAPTTCPVPPEQTKGPLGIDPQKGIGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAIVCDFKLFLYDIA 1170
            ||||||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse  1071 VNKAPTVCPVPPEQTKGPLGIDPQKGVGTAYEGHVRIPKPAGVKKGWQRALAVVCDFKLFLYDIA 1135

Human  1171 EGKASQPSVVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSASNNKCSILMLAD 1235
            |||||||:.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:||||||||||
Mouse  1136 EGKASQPTSVISQVIDMRDEEFSVSSVLASDVIHASRKDIPCIFRVTASQLSAPSNKCSILMLAD 1200

Human  1236 TENEKNKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGL 1300
            :|||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1201 SENERSKWVGVLSELHKILKKNKFRDRSVYVPKEAYDSTLPLIKTTQAAAIIDHERIALGNEEGL 1265

Human  1301 FVVHVTKDEIIRVGDNKKIHQIELIPNDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLSETKGC 1365
            ||||||||||:|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
Mouse  1266 FVVHVTKDEIVRVGDNKKIHQIELIPSDQLVAVISGRNRHVRLFPMSALDGRETDFYKLAETKGC 1330

Human  1366 QTVTSGKVRHGALTCLCVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPYNVQWMAIFSEQLCVGFQSG 1430
            ||:.:||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||
Mouse  1331 QTIAAGKVRHGALSCLCVAMKRQVLCYELFQSKTRHRKFKEIQVPCNVQWMAIFSEHLCVGFQSG 1395

Human  1431 FLRYPLNGEGNPYSMLHSNDHTLSFIAHQPMDAICAVEISSKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQ 1495
            ||||||||||.|.:||||||||||||:||||||:||||||:||||||||||||||||||||||||
Mouse  1396 FLRYPLNGEGGPCNMLHSNDHTLSFISHQPMDALCAVEISNKEYLLCFNSIGIYTDCQGRRSRQQ 1460

Human  1496 ELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNNEGSLNLLGLETIRLI 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse  1461 ELMWPANPSSCCYNAPYLSVYSENAVDIFDVNSMEWIQTLPLKKVRPLNTEGSLNLLGLETIRLI 1525

Human  1561 YFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNP 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1526 YFKNKMAEGDELVVPETSDNSRKQMVRNINNKRRYSFRVPEEERMQQRREMLRDPEMRNKLISNP 1590

Human  1626 TNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMPGFPYPSPHHHSGLISSPINFEHIYHMTVNSAEKFLSPDSIN 1690
            ||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||.|||:||||:||:
Mouse  1591 TNFNHIAHMGPGDGIQILKDLPMPGFPYSPPHHHSGLISSPSNFEHIYHMTVTSAEQFLSPESIS 1655

Human  1691 PEYSPSLRSVPGTPSFMTLRNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQN 1755
            |...|||||.||||..:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1656 PGSPPSLRSAPGTPHSVTLRNPRPQESRTVFSGSVSIPSITKSRPEPGRSMSASSGLSARSSAQN 1720

Human  1756 GSALKREFSGGSYSAKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDFDGEDSDSPRHSTASNSSNLSS 1820
            |||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||
Mouse  1721 GSALKREFSGGSYNTKRQPMPSPSEGSLSSGGMDQGSDAPARDYDGEDSDSPRHSTASNSSNLSS 1785

Human  1821 PPSPASPRKTKSLSLESTDRGSWDP 1845
            ||||.||:|||||||||||||||||
Mouse  1786 PPSPISPQKTKSLSLESTDRGSWDP 1810

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CDC42BPANP_001374479.1 STKc_MRCK_alpha 4..412 CDD:270773 405/407 (100%)
Mplasa_alph_rch <442..954 CDD:275316 486/511 (95%)
KELK 529..608 CDD:464876 76/78 (97%)
DMPK_coil 881..941 CDD:117396 58/59 (98%)
C1_MRCKalpha 1062..1121 CDD:410414 56/58 (97%)
PH_MRCK 1123..1257 CDD:269949 124/133 (93%)
CNH 1288..1546 CDD:459938 242/257 (94%)
Cdc42bpaXP_017175608.1 STKc_MRCK_alpha 4..412 CDD:270773 405/407 (100%)
SMC_prok_B <438..824 CDD:274008 361/385 (94%)
KELK 529..608 CDD:464876 76/78 (97%)
DMPK_coil 881..941 CDD:117396 58/59 (98%)
C1_MRCKalpha 1027..1086 CDD:410414 56/58 (97%)
PH_MRCK 1088..1222 CDD:269949 124/133 (93%)
CNH 1253..1511 CDD:459938 242/257 (94%)

Return to query results.
Submit another query.