DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment MYO18B and Myo18b

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011528760.1 Gene:MYO18B / 84700 HGNCID:18150 Length:2610 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001419354.1 Gene:Myo18b / 304551 RGDID:1594542 Length:2551 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2631 Identity:1888/2631 - (71%)
Similarity:2127/2631 - (80%) Gaps:101/2631 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAISSRLALWEQKIREEDKSPPPSSPPPLFSVIPGGFIKQLVRGTEKEAKEARQRKQLAVASPER 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:||||:||:..:.||  
  Rat     1 MAISSRLALWEQKIREEDKSPPPSSPPPLFSVIPGGFIKQLVRETEKESKEARRRKEAGLTSP-- 63

Human    66 EVETEAKRGQVIFPRSSDQIEAERGGEPVCSLLSQDAWKRTSLIPEISISQPNSKSSSGTRSGSQ 130
            ||||                                        |.:..:|.| |:::..:.|| 
  Rat    64 EVET----------------------------------------PAVPTNQSN-KTNNVPKPGS- 86

Human   131 QISQDDQSSSPGSSDILGKESEGSRSPDPEQMTSINGEKAQELGSSATPTKKTVPFKRGVRRGDV 195
            |.|||..|::..|:||.||:.......|...:||.:||:.||.|.:.||.|:|:||::|||||||
  Rat    87 QTSQDSSSTTHDSADIPGKQPPEPGDKDSTPVTSTSGERPQESGPTGTPAKRTLPFRKGVRRGDV 151

Human   196 LLMVAKLDPDSAKPE-KTHPHDAPPCKTSPPATDTGKEKKGETSRTPCGSQASTEILAPKAEKTR 259
            |||||||||:.||.| |..|.|....||..||.|:|..|||..:.|.|..|||      .:||||
  Rat   152 LLMVAKLDPELAKAEQKIQPRDVSTDKTPAPAKDSGGTKKGMITGTSCDPQAS------MSEKTR 210

Human   260 TGGLGDPGQGTVALKKGEEGQSIVGKGLGTPKTTELKEAEPQGKDRQGTRPQAQGPGEGVRPGKA 324
            |.|:||.||..    ||.:.|...|||...|:|...||.|.|..:..|||.|.|..|...:.|.|
  Rat   211 TRGVGDTGQSI----KGGKCQGTEGKGSRDPQTKGQKEGESQNTEEHGTRSQTQEAGNKGQQGTA 271

Human   325 EKEGAEPTNTVEKGNVSKDVGSEGKHVRPQIPGRKWGGFLGRRSKWDGPQNKKDKEGVLLSKAEK 389
            ||||..|...:||.:..|..|:|.:.:.|.:|.||||..||||||||.||: |::......|.||
  Rat   272 EKEGGGPPKKMEKEDGPKVAGAEVRPLEPPVPLRKWGSSLGRRSKWDSPQS-KNRVTESRRKDEK 335

Human   390 TGEPQTQMEKTSQVQGELGDDLRMGEKAGELRSTTGKAGESWDKKEKMGQPQ------GKSGNAG 448
            |.:.|:..|:..:.:..|..|...|:.|    ..||:..||..|..|:|:||      .|:....
  Rat   336 TEDKQSPKEEKMEDKQSLAVDRSCGQPA----EPTGQQPESPAKMGKVGRPQKKLVTPEKTRELP 396

Human   449 EARSQT---EKGCEAPKEVSTMVESPAAPGKGGWPGSRGQEAEEPCSRAGDGAGALETELEGPSQ 510
            |..::|   |:.|:|...::|...|..|..:.|.|.||.|.||||.... :.....|.:.||..:
  Rat   397 EVAAETQSPEESCKARDGIATEGTSAEAAKREGQPESRMQGAEEPRVHT-EEVDVTEPQAEGRRE 460

Human   511 PALEKDAERPRIRKENQDGPAPQEEGKGGQSRDSDQAPEDRWYEAEKVWLAQKDGFTLATVLKPD 575
            ...|...|||.::|..::....|:..:||||.|||||.|||||||:||||.|||.||||||||||
  Rat   461 SVPETGMERPSMQKPMEEKQILQDPDRGGQSGDSDQAFEDRWYEAQKVWLVQKDRFTLATVLKPD 525

Human   576 EGTADLPAGRVRLWIDADKTITEVDEEHVHRANPPELDQVEDLASLISVNESSVLNTLLQRYKAQ 640
            |||||||||||||.||||:|:||||||.||||||.||||.||||.|:||||||||||||:||:||
  Rat   526 EGTADLPAGRVRLCIDADRTVTEVDEEQVHRANPSELDQAEDLAFLVSVNESSVLNTLLKRYQAQ 590

Human   641 LLHTCTGPDLIVLQPRGPSVPSAGKVPKGRRDGLPAHIGSMAQRAYWALLNQRRDQSIVALGWSG 705
            |.|||:|||||.|||:..:|||:||||:||:||||||:.|:|||||||||:|||||||||||.||
  Rat   591 LPHTCSGPDLIALQPQTTTVPSSGKVPRGRQDGLPAHVTSLAQRAYWALLSQRRDQSIVALGRSG 655

Human   706 AGKTTCCEQVLEHLVGMAGSVDGRVSVEKIRATFTVLRAFGSVSMAHSRSATRFSMVMSLDFNAT 770
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|||.||.:|||.||||:||||||||||
  Rat   656 AGKTTCCEQVLEHLVGMAGSVDGRVSVEKLRATFTVLQAFGCVSTSHSRRATRFAMVMSLDFNAT 720

Human   771 GRITAAQLQTMLLEKSRVARQPEGESNFLVFSQMLAGLDLDLRTELNLHQMADSSSFGMGVWSKP 835
            ||:||||||:||||.|||||||:||.||.||||:|||||:||||||||||||:||:||||:||||
  Rat   721 GRVTAAQLQSMLLENSRVARQPQGEGNFEVFSQLLAGLDVDLRTELNLHQMAESSAFGMGLWSKP 785

Human   836 EDKQKAAAAFAQLQGAMEMLGISESEQRAVWRVLAAIYHLGAAGACKVGRKQFMRFEWANYAAEA 900
            |||||||.||:||:||||:|||.|.||||:||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   786 EDKQKAATAFSQLRGAMELLGILEGEQRAIWRVLAAIYHLGAAGACKVGRKQFMRFEWANHAAEA 850

Human   901 LGCEYEELNTATFKHHLRQIIQQMTFGPSRWGLEDEETSSGLKMTGVDCVEGMASGLYQELFAAV 965
            |||:|||||||||||||||||:|||.||.|.||:|.|..||||||||:||||||||||||||.||
  Rat   851 LGCDYEELNTATFKHHLRQIIEQMTSGPQRQGLQDNEACSGLKMTGVECVEGMASGLYQELFVAV 915

Human   966 VSLINRSFSSHHLSMASIMVVDSPGFQNPRHQGKDRAATFEELCHNYAHERLQLLFYQRTFVSTL 1030
            ||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||||||||:|||.||||||||.|||||||
  Rat   916 VSLINRSFSSQHLSMASIMVVDTPGFQNPRHQGKDRAATFEELCYNYAQERLQLLFYHRTFVSTL 980

Human  1031 QRYQEEGVPVQFDLPDPSPGTTVAVVDQNPSQQVRLPAGGGAQDARGLFWVLDEEVHVEGSSDSV 1095
            :||:|||:||.||||:.|||||||||||||| ||.|.||.|.:||.||||||||||.||||||||
  Rat   981 ERYREEGIPVPFDLPESSPGTTVAVVDQNPS-QVHLTAGRGIEDAAGLFWVLDEEVRVEGSSDSV 1044

Human  1096 VLERLCAAFEKKGAGTEGSSALRTCEQPLQCEIFHQLGWDPVRYDLTGWLHRAKPNLSALDAPQV 1160
            |||||.|.||||.:|.|...::|||||||.||:|||||.|||||||||||.|||||||||:|||:
  Rat  1045 VLERLHAGFEKKASGAEEPPSMRTCEQPLNCELFHQLGRDPVRYDLTGWLRRAKPNLSALEAPQI 1109

Human  1161 LHQSKREELRSLFQARAKLPPVCRAVAGLEGTSQQALQRSRMVRRTFASSLAAVRRKAPCSQIKL 1225
            |.|||||||:|||||||||||||..||||||||||||.|.|:|||.||||||||:|||||:||||
  Rat  1110 LQQSKREELQSLFQARAKLPPVCLMVAGLEGTSQQALHRGRVVRRAFASSLAAVKRKAPCAQIKL 1174

Human  1226 QMDALTSMIKRSRLHFIHCLVPNPVVESRSGQESPPPPQPGRDKPGAGGPLALDIPALRVQLAGF 1290
            |||||.|:::||:|||||||||. .||:::||.:|.|.|||.|:.||..|.|.|||||||||||.
  Rat  1175 QMDALISLLRRSQLHFIHCLVPT-TVETKAGQGTPTPSQPGGDQGGANEPPAPDIPALRVQLAGS 1238

Human  1291 HILEALRLHRTGYADHMGLTRFRRQFQVLDAPLLKKLMSTSEGIDERKAVEELLETLDLEKKAVA 1355
            ||||||||||.|||:||||.:|||:||.||..|||:|..||||:||||||||||:||||||||||
  Rat  1239 HILEALRLHRAGYAEHMGLAQFRRRFQALDPALLKRLDLTSEGLDERKAVEELLQTLDLEKKAVA 1303

Human  1356 VGHSQVFLKAGVISRLEKQREKLVSQSIVLFQAACKGFLSRQEFKKLKIRRLAAQCIQKNVAVFL 1420
            ||||||||||||:||||:|||||||::||||||||:|||||||:||||||||||.|||||:.|||
  Rat  1304 VGHSQVFLKAGVVSRLERQREKLVSRNIVLFQAACRGFLSRQEYKKLKIRRLAALCIQKNLTVFL 1368

Human  1421 AVKDWPWWQLLGSLQPLLSATIGTEQLRAKEEELTTLRRKLEKSEKLRNELRQNTDLLESKIADL 1485
            .|||||||.||.||:||||:|:.||||||||||||.||:||:.||..|:||||:.||||||||||
  Rat  1369 KVKDWPWWGLLASLRPLLSSTLSTEQLRAKEEELTLLRQKLQNSENSRSELRQSADLLESKIADL 1433

Human  1486 TSDLADERFKGDVACQVLESERAERLQAFREVQELKSKHEQVQKKLGDVNKQLEEAQQKIQLNDL 1550
            ||:|||||||||||||.|||||||||||.|||||||:|::|||..||.|.||||||||:||..:|
  Rat  1434 TSELADERFKGDVACQALESERAERLQALREVQELKAKYQQVQDALGGVQKQLEEAQQRIQTANL 1498

Human  1551 ERNPTGGADEWQMRFDCAQMENEFLRKRLQQCEERLDSELTARKELEQKLGELQSAYDGAKKMAH 1615
            |..|||||||||||.||||:||:||||||||||||||||:.||.|||||||||||||:.|||.||
  Rat  1499 EEKPTGGADEWQMRLDCAQLENDFLRKRLQQCEERLDSEMKARTELEQKLGELQSAYEEAKKTAH 1563

Human  1616 QLKRKCHHLTCDLEDTCVLLENQQSRNHELEKKQKKFDLQLAQALGESVFEKGLREKVTQENTSV 1680
            ||:|||||||.|||||.|||||||||||:|||:|||||||||||||||:|||.|||||::||:.|
  Rat  1564 QLRRKCHHLTWDLEDTRVLLENQQSRNHDLEKRQKKFDLQLAQALGESMFEKSLREKVSRENSGV 1628

Human  1681 RWELGQLQQQLKQKEQEASQLKQQVEMLQDHKRELLGSPSLGENCVAGLKERLWKLESSALEQQK 1745
            |||||||||||:|||||||:||::||.||..|||||...|:|...||.||||:|:|||:||||:|
  Rat  1629 RWELGQLQQQLEQKEQEASKLKEEVERLQGQKRELLNCASVGNQGVASLKERVWELESNALEQEK 1693

Human  1746 IQSQQENTIKQLEQLRQRFELEIERMKQMHQKDREDQEEELEDVRQSCQKRLHQLEMQLEQEYEE 1810
            ::||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
  Rat  1694 VRSQQENTIKQLEQLRQRFELEIERMKQMHQKDREDQEEELEDVRQSCQKRLRQLEMQLEQEYEE 1758

Human  1811 KQMVLHEKQDLEGLIGTLCDQIGHRDFDVEKRLRRDLRRTHALLSDVQLLLGTMEDGKTSVSKEE 1875
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|:||.|||:||||
  Rat  1759 KQAALHEKHDLEGLIGTLCDQIGHRDFDVEKRLRRDLRRTHALLSDVQLLLATIEDSKTSISKEE 1823

Human  1876 LEKVHSQLEQSEAKCEEALKTQKVLTADLESMHSELENMTRNKSLVDEQLYRLQFEKADLLKRID 1940
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||:||||||||
  Rat  1824 LEKVHSQLEQSEAKCEDALKTQKVLTADLESMHSELENVTRSKSLVDEQLYRLQFERADLLKRID 1888

Human  1941 EDQDDLNELMQKHKDLIAQSAADIGQIQELQLQLEEAKKEKHKLQEQLQVAQMRIEYLEQSTVDR 2005
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||:||:|||||||:|
  Rat  1889 EDQDDLNGLMQKHKDLIAQSAADIGQIQELQLQLEEAKKEKQKLWEQLQVAQLRIQYLEQSTVER 1953

Human  2006 AIVSRQEAVICDLENKTEFQKVQIKRFEVLVIRLRDSLIKMGEELSQAATSESQQRESSQYYQRR 2070
            ||||||||:|||||:||||||||:|||||||||||||:||||||||:|..:|:||||:|||||:|
  Rat  1954 AIVSRQEAIICDLESKTEFQKVQMKRFEVLVIRLRDSMIKMGEELSRAVKAEAQQRENSQYYQQR 2018

Human  2071 LEELKADMEELVQREAEASRRCMELEKYVEELAAVRQTLQTDLETSIRRIADLQAALEEVASSDS 2135
            ||||||:|:||||||.||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2019 LEELKAEMQELVQREEEASRRCMEMEKYVEELAAVRQTLQTDLETSIRRIADLQAALEEVASSDS 2083

Human  2136 DTESVQTAVDCGSSGRKEMDNVSILSSQPEGSLQSWLSCTLSLATDTMRTPSRQSATSSRILSPR 2200
            |||||||||||.|...||.||||::|||||.|||||:||:||||||::|.||||||.||.:.|||
  Rat  2084 DTESVQTAVDCSSRSGKEGDNVSVISSQPESSLQSWMSCSLSLATDSVRIPSRQSAISSSLHSPR 2148

Human  2201 INEEAGDTERTQSALALSRARSTNVHS------KTSGDKPVSPHFVRRQKYCHFGDGEVLAVQRK 2259
            ::|||||:||.:.|       ||.:|.      .|:|...||.|.|..||..|.||||..||.||
  Rat  2149 VSEEAGDSERPRPA-------STVLHGDWDAPRDTAGAGSVSLHPVLPQKPYHLGDGEGFAVHRK 2206

Human  2260 ST-ERLEPASSPLASRSTNTSPLSREKLPSPSAALSEFVEGLRRKRAQRGQGSTLGLEDWPTLPI 2323
            || ||....||...|||...||     |||||||||||||.||||||||||||||.|.|.|..||
  Rat  2207 STPERPGSLSSSPTSRSEVVSP-----LPSPSAALSEFVEELRRKRAQRGQGSTLHLGDGPVFPI 2266

Human  2324 YQTTGASTLRRGRAGSDEGNLSLRVGAKSPLEIE---GAAGGLLRSTSLKCISSDGVGGTTLLPE 2385
            :|||||.:||||||.||||:||||...||||..|   ||.|||.||||||||:|:|..|.|.||:
  Rat  2267 FQTTGAFSLRRGRASSDEGDLSLRTRVKSPLGAEGNAGATGGLSRSTSLKCITSEGAEGITRLPD 2331

Human  2386 KSKTQFSSCESLLESRPSMGRKLSSPTTPRDMLLSPTLRPRRRCLESSVDDAGCPDLGKEPLVFQ 2450
            |.||:|.||||||||.||..|||||||.    ||||||||||.|||||||||.|.||||||||||
  Rat  2332 KQKTRFGSCESLLESGPSTRRKLSSPTA----LLSPTLRPRRPCLESSVDDAACLDLGKEPLVFQ 2392

Human  2451 NRQFAHLMEEPLGSDPFSWKLPSLDYERKTKVDFDDFLPAIRKPQTPTSLAGSAKGGQDGSQRSS 2515
            ||||:|||||...|||||||||||:|.|:||||||||||||:||.  .:|:|::|.|::.|:...
  Rat  2393 NRQFSHLMEETPDSDPFSWKLPSLNYRRQTKVDFDDFLPAIKKPD--VALSGASKDGKEASKHPG 2455

Human  2516 IHFET-EEANRSFLSGIKTILKKSPEPKEDPAHLSDSSSSSGSIVSFKSADSIKSRPGIPRLAGD 2579
            :|||. |.|:|||||||||||||:||.|||||||||||||||||:||||.|.::..|.:|||.||
  Rat  2456 VHFEMGEAADRSFLSGIKTILKKNPEAKEDPAHLSDSSSSSGSILSFKSTDGMRGGPRVPRLQGD 2520

Human  2580 GGERTSPERREPGTGRKDDDVASIMKKYLQK 2610
            ||||.|||.||||:.|:||||.|||:||||:
  Rat  2521 GGERMSPEHREPGSLRRDDDVESIMRKYLQQ 2551

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
MYO18BXP_011528760.1 2A1904 <263..555 CDD:273344 111/300 (37%)
COG5022 552..2129 CDD:227355 1315/1576 (83%)
MYSc_Myo18 627..1364 CDD:276837 601/736 (82%)
Myo18bNP_001419354.1 PTZ00449 <223..561 CDD:185628 155/343 (45%)
COG5022 547..2077 CDD:227355 1276/1531 (83%)
MYSc_Myo18 577..1312 CDD:276837 601/736 (82%)

Return to query results.
Submit another query.