DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SMARCA5 and Smarca5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003592.3 Gene:SMARCA5 / 8467 HGNCID:11101 Length:1052 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_444354.2 Gene:Smarca5 / 93762 MGIID:1935129 Length:1051 Species:Mus musculus


Alignment Length:1052 Identity:1027/1052 - (97%)
Similarity:1038/1052 - (98%) Gaps:1/1052 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDA 65
            ||||.|||||||||||||||:|: .:|||:|.|||||||.||.|...||.:||||.||||:||..
Mouse     1 MSSAVEPPPPPPPESAPSKPSAA-GAGGSSSGNKGGPEGGAAPAAPCAAGSGPADTEMEEVFDHG 64

Human    66 SPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKD 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
Mouse    65 SPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRVKKD 129

Human   131 EKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLY 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   130 EKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLY 194

Human   196 ENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCL 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
Mouse   195 ENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKKWVPTLRSVCL 259

Human   261 IGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVR 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   260 IGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVR 324

Human   326 EFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   325 EFKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRP 389

Human   391 FLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   390 FLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRK 454

Human   456 CCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCM 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   455 CCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCM 519

Human   521 WRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQV 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   520 WRNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQV 584

Human   586 DLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEM 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   585 DLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEM 649

Human   651 LQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFE 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   650 LQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFE 714

Human   716 GEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPR 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   715 GEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPR 779

Human   781 LFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNW 845
            ||||||||||:|||||||||||:|:|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Mouse   780 LFELLEKEILYYRKTIGYKVPRSPDLPNAAQAQKEEQLKIDEAEPLNDEELEEKEKLLTQGFTNW 844

Human   846 NKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEAR 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   845 NKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEAR 909

Human   911 IQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQ 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   910 IQRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQ 974

Human   976 CIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGA 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   975 CIRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGA 1039

Human  1041 PDGRGRKKKLKL 1052
            ||||||||||||
Mouse  1040 PDGRGRKKKLKL 1051

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SMARCA5NP_003592.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..83 62/81 (77%)
PLN03142 69..1012 CDD:215601 936/942 (99%)
DEAH box 308..311 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1015..1052 36/36 (100%)
Smarca5NP_444354.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..81 61/80 (76%)
PLN03142 68..1011 CDD:215601 936/942 (99%)
DEAH box 307..310 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1014..1051 36/36 (100%)

Return to query results.
Submit another query.