DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SMARCA5 and smarca5

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003592.3 Gene:SMARCA5 / 8467 HGNCID:11101 Length:1052 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001075098.2 Gene:smarca5 / 282615 ZFINID:ZDB-GENE-021125-1 Length:1035 Species:Danio rerio


Alignment Length:1052 Identity:900/1052 - (85%)
Similarity:963/1052 - (91%) Gaps:23/1052 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     2 SSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDAS 66
            ||..:.....|.:..|:.||.      .::|..|..|.......:.|.|:.|..|:.:::...  
Zfish     6 SSMEQQREEEPSQLDPAGPAE------DDTSENGHDEASDTAMDSEAQSSSPPSAKGKDLLGG-- 62

Human    67 PGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDE 131
                         ||||:||||.|||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    63 -------------YEEKVQTDRTNRFEYLLKQTEVFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDE 114

Human   132 KQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYE 196
            ||||||.||.||||||||||||||:|:||||:|||||:|||||||.|||||||||||||||||||
Zfish   115 KQNLLSAGDNRHRRTEQEEDEELLSENSKATSVCTRFDDSPSYVKTGKLRDYQVRGLNWLISLYE 179

Human   197 NGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLI 261
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||:|::||||
Zfish   180 NGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLYNWMNEFKRWVPSLKAVCLI 244

Human   262 GDKEQRAAFVRDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVRE 326
            ||:|:|.||:||.|||||||||||||||||.|::|||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   245 GDREERTAFIRDTLLPGEWDVCVTSYEMLIIERAVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVRE 309

Human   327 FKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPF 391
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||::|||:||||||||||.|||||||.|||||
Zfish   310 FKTTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSSEDFDAWFDTNNCLGDTKLVERLHTVLRPF 374

Human   392 LLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKC 456
            |||||||||||||.||||:|||||||||||||||:||||||||||||||||||||||:|||||||
Zfish   375 LLRRIKADVEKSLLPKKEIKIYVGLSKMQREWYTKILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNVLMQLRKC 439

Human   457 CNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMW 521
            |||||||||||||||||||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   440 CNHPYLFDGAEPGPPYTTDLHLVVNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMW 504

Human   522 RNYEYCRLDGQTPHDERQDSINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLATADVVILYDSDWNPQVD 586
            |||.||||||||||:|||.||||:|||||:||:|||||||||||||||||||||:||||||||||
Zfish   505 RNYGYCRLDGQTPHEERQISINAFNEPNSSKFLFMLSTRAGGLGINLATADVVIIYDSDWNPQVD 569

Human   587 LQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEML 651
            ||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.::||:||||||
Zfish   570 LQAMDRAHRIGQKKQVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSIVIQQGRLVDPSMNKLGKDEML 634

Human   652 QMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEG 716
            .:||||||||||||||||||||||||||||.:||.||.||::.:||.||||||||||:|||||||
Zfish   635 SIIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGERKTMEMKEKMANLGEGSLRNFTMDTENSVYNFEG 699

Human   717 EDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRL 781
            ||||||:|:. |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   700 EDYREKKKVV-TNWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRL 763

Human   782 FELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAAQAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWN 846
            |||||||||:|||||||||||||:|||:|:.|||||.||||||.||:|||||||.||:||||.|.
Zfish   764 FELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDLPNSAEMQKEEQAKIDEAEPLNEEELEEKENLLSQGFTIWT 828

Human   847 KRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARI 911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   829 KRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAREVEGKTPEEVMEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARI 893

Human   912 QRRISIKKALDTKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQC 976
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
Zfish   894 QRRISIKKALDSKIGRYKAPFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKESVYDELRQC 958

Human   977 IRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPST-QKRKMDGA 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:.|: ||||.||.
Zfish   959 IRNSPQFRFDWFLKSRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEREKAEKKKRGPRTSSAQKRKQDGT 1023

Human  1041 PDGRGRKKKLKL 1052
            ||||||||||||
Zfish  1024 PDGRGRKKKLKL 1035

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SMARCA5NP_003592.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..83 15/80 (19%)
PLN03142 69..1012 CDD:215601 851/942 (90%)
DEAH box 308..311 2/2 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1015..1052 30/37 (81%)
smarca5NP_001075098.2 PLN03142 4..1030 CDD:215601 893/1045 (85%)

Return to query results.
Submit another query.