DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment SGIP1 and Sgip1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_016857994.1 Gene:SGIP1 / 84251 HGNCID:25412 Length:850 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001363865.1 Gene:Sgip1 / 313413 RGDID:1564957 Length:855 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:878 Identity:792/878 - (90%)
Similarity:802/878 - (91%) Gaps:51/878 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGI----------------------------QPSP 37
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:                            ||||
  Rat     1 MMEGLKKRTRKAFGIRKKEKDTDSTGSPDRDGMQGKKKAQKTQLLLTSCFWLRALSLTLSQQPSP 65

Human    38 HEPPYNSKAECAREGGKKVSKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFY 102
            |||||:||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 HEPPYHSKAECAREGGKKASKKSNGAPNGFYAEIDWERYNSPELDEEGYSIRPEEPGSTKGKHFY 130

Human   103 SSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDILKNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRN 167
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 SSSESEEEEESHKKFNIKIKPLQSKDVLKNAATVDELKASIGNIALSPSPVRKSPRRSPGAIKRN 195

Human   168 LSSEEVARPRRSTPTPELISKKPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINP 232
            ||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LSSEEVARPRRSTPTPELTSKKPLDDTLALAPLFGPPLESAFDEQKTEVLLDQPEIWGSGQPINP 260

Human   233 SMESPKLTRPFPTGTPPPLPPKNVPATPPRTGSPLTIGPGNDQSATEVKIEKLPSINDLDSIFGP 297
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||:..||||:|||.||||||||:||||||||
  Rat   261 SMESPKLARPFPTGTPPPLPPKAVPATPPRTGSPLTVATGNDQAATEAKIEKLPSISDLDSIFGP 325

Human   298 VLSPKSVAVNAEEKWVHFSDTSPEHVTPELTPREKVVSPPATPDNPADSPAPGPLGPPGPTGPPG 362
            ||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||:|||..|.|||||||||.||||..||||
  Rat   326 VLSPKSVAVNTEEKWVHFSDASPEHVTPELTPREKVVTPPAASDIPADSPAPGPPGPPGSAGPPG 390

Human   363 PPGPPRNVLSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETISSPKDFGLGQRATPPPPPPPTYRTVVSSPG 427
            ||| ||:|.|||||||||||||||||||||||||:||||:.||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 PPG-PRHVPSPLNLEEVQKKVAEQTFIKDDYLETLSSPKECGLGQRATPPPPPPPTYRTVVSSPG 454

Human   428 PGSGPGPGTTSGASSPARPATPLVPCRSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSS 492
            ||||.|.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 PGSGSGTGTASGASSPARPATPLVPCSSTTPPPPPPRPPSRPKLPPGKPGVGDVSRPFSPPIHSS 519

Human   493 SPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTVVSEDDVFYDKLPSFERRCETPAENEQPSLVWFDR 557
            |||||||||||||||||||||||||||||||                      ||||||||||||
  Rat   520 SPPPIAPLARAESTSSISSTNSLSAATTPTV----------------------ENEQPSLVWFDR 562

Human   558 GKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITR 622
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   563 GKFYLTFEGSSRGPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFKGADPSKCIVKITGEMVLSFPAGITR 627

Human   623 HFANNPSPAALTFRVINFSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQ 687
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   628 HFANNPSPAALTFRVINSSRLEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTKEFWVNMPNLMTHLKKVSEQKPQ 692

Human   688 ATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPSSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPID 752
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   693 ATYYNVDMLKYQVSAQGIQSTPLNLAVNWRCEPGSTDLRIDYKYNTDAMTTAVALNNVQFLVPID 757

Human   753 GGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEG 817
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   758 GGVTKLQAVLPPAVWNAEQQRILWKIPDISQKSENGGVGSLLARFQLSEGPSKPSPLVVQFTSEG 822

Human   818 STLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN 850
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   823 STLSGCDIELVGAGYRFSLIKKRFAAGKYLADN 855

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
SGIP1XP_016857994.1 SGIP1_MHD 583..849 CDD:271172 263/265 (99%)
Sgip1NP_001363865.1 SGIP1_MHD 588..854 CDD:271172 263/265 (99%)

Return to query results.
Submit another query.