DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment PICALM and Picalm

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_005274379.1 Gene:PICALM / 8301 HGNCID:15514 Length:686 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006229731.1 Gene:Picalm / 89816 RGDID:621054 Length:686 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:686 Identity:670/686 - (97%)
Similarity:677/686 - (98%) Gaps:0/686 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSGQSLTDRITAAQHSVTGSAVSKTVCKATTHEIMGPKKKHLDYLIQCTNEMNVNIPQLADSLFE 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSGQSLTDRITAAQHSVTGSAVSKTVCKATTHEIMGPKKKHLDYLIQCTNEMNVNIPQLADSLFE 65

Human    66 RTTNSSWVVVFKSLITTHHLMVYGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGLQGYDMSTFIRRYSRY 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RTTNSSWVVVFKSLITTHHLMVYGNERFIQYLASRNTLFNLSNFLDKSGLQGYDMSTFIRRYSRY 130

Human   131 LNEKAVSYRQVAFDFTKVKRGADGVMRTMNTEKLLKTVPIIQNQMDALLDFNVNSNELTNGVINA 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LNEKAVSYRQVAFDFTKVKRGADGVMRTMNTEKLLKTVPIIQNQMDALLDFNVNSNELTNGVINA 195

Human   196 AFMLLFKDAIRLFAAYNEGIINLLEKYFDMKKNQCKEGLDIYKKFLTRMTRISEFLKVAEQVGID 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 AFMLLFKDAIRLFAAYNEGIINLLEKYFDMKKNQCKEGLDIYKKFLTRMTRISEFLKVAEQVGID 260

Human   261 RGDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGKKIKDSTAASRATTLSNAVSSLASTGLSLTKVDEREKQ 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 RGDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGKKIKDSTAASRATTLSNAVSSLASTGLSLTKVDEREKQ 325

Human   326 AALEEEQARLKALKEQRLKELAKKPHTSLTTAASPVSTSAGGIMTAPAIDIFSTPSSSNSTSKLP 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 AALEEEQARLKALKEQRLKELAKKPHTSLTTAASPVSTSAGGIMTAPAIDIFSTPSSSNSTSKLP 390

Human   391 NDLLDLQQPTFHPSVHPMSTASQVASTWGDPFSATVDAVDDAIPSLNPFLTKSSGDVHLSISSDV 455
            ||||||||||||||||.||.|.|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||.|||||
  Rat   391 NDLLDLQQPTFHPSVHAMSAAPQVASTWGDPFSATLDAVDDAIPSLNPFLTKSSGDVHLPISSDV 455

Human   456 STFTTRTPTHEMFVGFTPSPVAQPHPSAGLNVDFESVFGNKSTNVIVDSGGFDELGGLLKPTVAS 520
            ||||||||||||||||:||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   456 STFTTRTPTHEMFVGFSPSPVTQPHPSAGLNVDFESVFGNKSTNVAVDSGGFDELGGLLKPTVAS 520

Human   521 QNQNLPVAKLPPSKLVSDDLDSSLANLVGNLGIGNGTTKNDVNWSQPGEKKLTGGSNWQPKVAPT 585
            |||:||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
  Rat   521 QNQSLPVAKLAPNKLVSDDLDSSLANLVGNLGIGNGTTKNDVSWSQPGEKKLTGGSNWQPKVAPT 585

Human   586 TAWNAATMNGMHFPQYAPPVMAYPATTPTGMIGYGIPPQMGSVPVMTQPTLIYSQPVMRPPNPFG 650
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 TAWSAATMNGMHFPQYAPPVMAYPATTPTGMIGYGIPPQMGSVPVMTQPTLIYSQPVMRPPNPFG 650

Human   651 PVSGAQLSAASSPSSHSPHRASGKDPFAELSLEDFL 686
            ||.|||||||||||.||||||:||||||||||||||
  Rat   651 PVPGAQLSAASSPSRHSPHRAAGKDPFAELSLEDFL 686

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
PICALMXP_005274379.1 ANTH 24..282 CDD:400137 257/257 (100%)
PicalmXP_006229731.1 ANTH 24..282 CDD:400137 257/257 (100%)

Return to query results.
Submit another query.