Protein Alignment SMC1A and Smc1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_006297.2
• Gene: SMC1A / 8243
• HGNCID: 11111
• Length: 1233
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_113871.2
• Gene: Smc1a / 63996
• RGDID: 61991
• Length: 1233
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1233
• Identity: 1230/1233 - (99%)
• Similarity: 1231/1233 - (99%)
• Gaps: 0/1233 - (0%)

Human     1 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLI 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLI 65

Human    66 HGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKA 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 HGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKA 130

Human   131 RNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 RNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAE 195

Human   196 RKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVE 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 RKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVE 260

Human   261 DELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 DELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH 325

Human   326 YKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLA 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 YKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLA 390

Human   391 QELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKL 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 QELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKL 455

Human   456 EGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLI 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 EGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLI 520

Human   521 DLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKL 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 DLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKL 585

Human   586 RELKGAKLVIDVIRYEPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSG 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 RELKGAKLVIDVIRYEPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSG 650

Human   651 VISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYS 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 VISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYS 715

Human   716 QSDLEQTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 QSDLEQTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF 780

Human   781 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKD 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKD 845

Human   846 ENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQK 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 ENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQK 910

Human   911 EVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGSQRISSIYAR 975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||:|||||||.||||||
  Rat   911 EVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGGSQGEESVSGSQRTSSIYAR 975

Human   976 EALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQE 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 EALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQE 1040

Human  1041 TSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEE 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1041 TSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPEE 1105

Human  1106 PYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKV 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1106 PYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGKV 1170

Human  1171 ANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ 1233
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 ANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNEQ 1233

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC1A	NP_006297.2	SMC_N	3..1210	CDD:426784	1203/1206 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	284..308		23/23 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	348..369		20/20 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	947..966		16/18 (89%)
Smc1a	NP_113871.2	SMC_N	3..1210	CDD:426784	1203/1206 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	284..307		22/22 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	350..369		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	946..969		20/22 (91%)