Protein Alignment SMC1A and smc1al

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_006297.2
• Gene: SMC1A / 8243
• HGNCID: 11111
• Length: 1233
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_997975.2
• Gene: smc1al / 403060
• ZFINID: ZDB-GENE-040426-57
• Length: 1233
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1233
• Identity: 1111/1233 - (90%)
• Similarity: 1185/1233 - (96%)
• Gaps: 1/1233 - (0%)

Human     1 MGFLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFQRFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLGEKTSNLRVKTLRDLI 65
            ||:|||||||||||||||||||||.:|||||||||||||||||||||||.|||||||||||:|||
Zfish     1 MGYLKLIEIENFKSYKGRQIIGPFHKFTAIIGPNGSGKSNLMDAISFVLAEKTSNLRVKTLKDLI 65

Human    66 HGAPVGKPAANRAFVSMVYSEEGAEDRTFARVIVGGSSEYKINNKVVQLHEYSEELEKLGILIKA 130
            |||||||||||||||:|||.::|.::.:|:|:|:|.||||:||||||.|.:||||||||||||||
Zfish    66 HGAPVGKPAANRAFVTMVYQQDGGQELSFSRIIIGSSSEYRINNKVVGLSDYSEELEKLGILIKA 130

Human   131 RNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDKRKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 RNFLVFQGAVESIAMKNPKERTALFEEISRSGELAQEYDRCKKEMVKAEEDTQFNYHRKKNIAAE 195

Human   196 RKEAKQEKEEADRYQRLKDEVVRAQVQLQLFKLYHNEVEIEKLNKELASKNKEIEKDKKRMDKVE 260
            |||||||||||:||||||||||||.||||||||||||.||||||:|||.:||||:||:||||:||
Zfish   196 RKEAKQEKEEAERYQRLKDEVVRAHVQLQLFKLYHNESEIEKLNRELAHRNKEIDKDRKRMDRVE 260

Human   261 DELKEKKKELGKMMREQQQIEKEIKEKDSELNQKRPQYIKAKENTSHKIKKLEAAKKSLQNAQKH 325
            :|||:||||||:|||:||.|||||||||:|||||||.||||||||:|||||||||:||||||||.
Zfish   261 EELKDKKKELGRMMRDQQMIEKEIKEKDAELNQKRPLYIKAKENTAHKIKKLEAARKSLQNAQKC 325

Human   326 YKKRKGDMDELEKEMLSVEKARQEFEERMEEESQSQGRDLTLEENQVKKYHRLKEEASKRAATLA 390
            |||||||||||::|..:||.||||||||||||:||||:||.|||||||.||||||||||||||||
Zfish   326 YKKRKGDMDELDREQGAVEMARQEFEERMEEEAQSQGQDLQLEENQVKAYHRLKEEASKRAATLA 390

Human   391 QELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKVETEAKIKQKLREIEENQKRIEKLEEYITTSKQSLEEQKKL 455
            ||||||||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||:|||||:|||:|||::
Zfish   391 QELEKFNRDQKADQDRLDLEERKKIETEAKIKQKIREIEENQKRIEKLEDYITTSRQSLDEQKRM 455

Human   456 EGELTEEVEMAKRRIDEINKELNQVMEQLGDARIDRQESSRQQRKAEIMESIKRLYPGSVYGRLI 520
            |.|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||||
Zfish   456 EEELTEEVEQAKRRIDEINMELNQVMEQLGDARIDRQENSRQQRKAEILESIKRLYPGSVYGRLI 520

Human   521 DLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKL 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   521 DLCQPTQKKYQIAVTKVLGKNMDAIIVDSEKTGRDCIQYIKEQRGEPETFLPLDYLEVKPTDEKL 585

Human   586 RELKGAKLVIDVIRYEPPHIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGHQRHKTVALDGTLFQKSG 650
            |||:||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Zfish   586 RELRGAKLVIDVIRYEPPQIKKALQYACGNALVCDNVEDARRIAFGGPYRHKTVALDGTLFQKSG 650

Human   651 VISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLKEKKERLTEELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYS 715
            |||||||||||||||||||||||||::||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   651 VISGGASDLKAKARRWDEKAVDKLKDRKEKLTDELKEQMKAKRKEAELRQVQSQAHGLQMRLKYS 715

Human   716 QSDLEQTKTRHLALNLQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSREREMKDLKEKMNQVEDEVFEEF 780
            ||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||:|||||::||.||||||.||
Zfish   716 QSDLEQTKTRHLSLNMQEKSKLESELANFGPRINDIKRIIQSRERDMKDLKDRMNVVEDEVFVEF 780

Human   781 CREIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFENQKTRLGIQLDFEKNQLKEDQDKVHMWEQTVKKD 845
            |:|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||:|||||||||:||.|||||||||
Zfish   781 CKEIGVRNIREFEEEKVKRQNEIAKKRLEFETQKTRLAIQLDYEKNQLKEDQEKVVMWEQTVKKD 845

Human   846 ENEIEKLKKEEQRHMKIIDETMAQLQDLKNQHLAKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKEMTHLQK 910
            |||||||||||||:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||:|.|||
Zfish   846 ENEIEKLKKEEQRNMKIIDETMAQLQDLKNQHLTKKSEVNDKNHEMEEIRKKLGGANKELTQLQK 910

Human   911 EVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLSKGTMDDISQEEGSSQGEDSVSGSQRISS-IYA 974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||:||.|:|:|.||:.|| :.|
Zfish   911 EVTAIETKLEQKRSDRHNLLQACKMQDIKLPLRSGTMDDISQEEGNSQAEESLSSSQKTSSTVLA 975

Human   975 REALIEIDYGDLCEDLKDAQAEEEIKQEMNTLQQKLNEQQSVLQRIAAPNMKAMEKLESVRDKFQ 1039
            :||||||||..|.|||||:.::||||.|||||||:||||||:||||:||||||||||||||||||
Zfish   976 KEALIEIDYNSLSEDLKDSLSDEEIKAEMNTLQQRLNEQQSILQRISAPNMKAMEKLESVRDKFQ 1040

Human  1040 ETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFNACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE 1104
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1041 ETSDEFEAARKRAKKAKQAFEQIKKERFDRFHACFESVATNIDEIYKALSRNSSAQAFLGPENPE 1105

Human  1105 EPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGK 1169
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish  1106 EPYLDGINYNCVAPGKRFRPMDNLSGGEKTVAALALLFAIHSYKPAPFFVLDEIDAALDNTNIGK 1170

Human  1170 VANYIKEQSTCNFQAIVISLKEEFYTKAESLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLTKYPDANPNPNE 1232
            ||||||:||..|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||::|.||||||||
Zfish  1171 VANYIKDQSVQNFQAIVISLKEEFYTKADSLIGVYPEQGDCVISKVLTFDLSQYADANPNPNE 1233

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
SMC1A	NP_006297.2	SMC_N	3..1210	CDD:426784	1088/1207 (90%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	284..308		20/23 (87%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	348..369		17/20 (85%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	947..966		14/18 (78%)
smc1al	NP_997975.2	SMC_N	3..1211	CDD:426784	1088/1207 (90%)