DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACTN4 and Actn4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427225.1 Gene:ACTN4 / 81 HGNCID:166 Length:933 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_008757407.1 Gene:Actn4 / 63836 RGDID:61816 Length:933 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:933 Identity:919/933 - (98%)
Similarity:927/933 - (99%) Gaps:0/933 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR 65
            |||||||||:|||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MVDYHAANQAYQYGPSSGGNGTGGGGGMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR 65

Human    66 KAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIG 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 KAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIG 130

Human   131 AEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDG 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 AEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDG 195

Human   196 LAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTY 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 LAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTY 260

Human   261 VSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTI 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 VSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYERLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTI 325

Human   326 QEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGWQHL 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
  Rat   326 QEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNGWQHL 390

Human   391 EQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKALIRK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 EQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKALIRK 455

Human   456 HEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEKTE 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   456 HEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDNLGSLTHSRREALEKTE 520

Human   521 KQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADRERE 585
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 KQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADRERE 585

Human   586 AILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEHL 650
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 AILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTSVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEHL 650

Human   651 RRQFASQANVVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQ 715
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 RRQFASQANMVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQ 715

Human   716 EALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKD 780
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 EALIFDNKHTNYTMEHLRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKD 780

Human   781 HGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGEAEFNRIMSLVDPNHS 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||||||
  Rat   781 HGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGDAEFNRIMSVVDPNHS 845

Human   846 GLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQG 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 GLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQG 910

Human   911 PDAVPGALDYKSFSTALYGESDL 933
            |||.|||||||||||||||||||
  Rat   911 PDAAPGALDYKSFSTALYGESDL 933

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACTN4NP_001427225.1 None
Actn4XP_008757407.1 CH_ACTN_rpt1 47..151 CDD:409063 103/103 (100%)
CH_ACTN_rpt2 155..269 CDD:409065 113/113 (100%)
SPEC 296..517 CDD:238103 217/220 (99%)
SPEC 414..640 CDD:238103 222/225 (99%)
SPEC 532..754 CDD:238103 218/221 (99%)
PTZ00184 759..>890 CDD:185504 128/130 (98%)
EFhand_Ca_insen 863..929 CDD:430177 64/65 (98%)

Return to query results.
Submit another query.