DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACTN4 and Actn4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427225.1 Gene:ACTN4 / 81 HGNCID:166 Length:933 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006540320.1 Gene:Actn4 / 60595 MGIID:1890773 Length:934 Species:Mus musculus


Alignment Length:934 Identity:920/934 - (98%)
Similarity:928/934 - (99%) Gaps:1/934 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDYHAANQSYQYGPSS-AGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHL 64
            |||||||||:|||||:| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MVDYHAANQAYQYGPNSGGGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHL 65

Human    65 RKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSI 129
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 RKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSI 130

Human   130 GAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKD 194
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 GAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKD 195

Human   195 GLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMT 259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 GLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMT 260

Human   260 YVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKT 324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 YVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYERLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKT 325

Human   325 IQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGWQH 389
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse   326 IQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINNGWQH 390

Human   390 LEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKALIR 454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Mouse   391 LEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKQRDYETATLSDIKALIR 455

Human   455 KHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEKT 519
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Mouse   456 KHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDNLGSLTHSRREALEKT 520

Human   520 EKQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADRER 584
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 EKQLETIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADRER 585

Human   585 EAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEH 649
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 EAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEH 650

Human   650 LRRQFASQANVVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLI 714
            ||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse   651 LRRQFASQANMVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPSLDLLEQQHQLI 715

Human   715 QEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDK 779
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 QEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDK 780

Human   780 DHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGEAEFNRIMSLVDPNH 844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||
Mouse   781 DHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGDAEFNRIMSVVDPNH 845

Human   845 SGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQ 909
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 SGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQ 910

Human   910 GPDAVPGALDYKSFSTALYGESDL 933
            ||||.|||||||||||||||||||
Mouse   911 GPDAAPGALDYKSFSTALYGESDL 934

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACTN4NP_001427225.1 None
Actn4XP_006540320.1 CH_ACTN_rpt1 48..152 CDD:409063 103/103 (100%)
CH_ACTN_rpt2 156..270 CDD:409065 113/113 (100%)
SPEC 297..518 CDD:238103 216/220 (98%)
SPEC 415..641 CDD:238103 222/225 (99%)
SPEC 533..755 CDD:238103 219/221 (99%)
PTZ00184 760..>891 CDD:185504 128/130 (98%)
EFhand_Ca_insen 864..930 CDD:430177 64/65 (98%)

Return to query results.
Submit another query.