DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACTN4 and actn4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427225.1 Gene:ACTN4 / 81 HGNCID:166 Length:933 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_017951705.1 Gene:actn4 / 448522 XenbaseID:XB-GENE-494339 Length:926 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:936 Identity:835/936 - (89%)
Similarity:881/936 - (94%) Gaps:13/936 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGD---YMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNS 62
            |||||          .::|......|.:|.   ||.||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MVDYH----------MTSGGAPPHMGQLGQDQRYMEQEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNS 55

Human    63 HLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLV 127
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog    56 HLRKAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLV 120

Human   128 SIGAEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISW 192
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   121 SIGAEEIVDGNTKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISW 185

Human   193 KDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAI 257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
 Frog   186 KDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAERYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAI 250

Human   258 MTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQ 322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:
 Frog   251 MTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPE 315

Human   323 KTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGW 387
            ||:.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   316 KTMHDMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGW 380

Human   388 QHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKAL 452
            |||||||||:||||||.||||||||||||||||||.||||||:|||||||.:|||:|||:|||||
 Frog   381 QHLEQAEKGFEEWLLNAIRRLERLDHLAEKFRQKALIHEAWTEGKEAMLKQKDYESATLADIKAL 445

Human   453 IRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALE 517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:||.||||||||||.||||||:||||||
 Frog   446 IRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDLLGSLTHTRREALE 510

Human   518 KTEKQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADR 582
            .|||||||||||:|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:||:|||||||||||
 Frog   511 VTEKQLEAIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLIAAHEQFKSTLPDADR 575

Human   583 EREAILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSN 647
            ||||||.|..|||:||:.:||||:..||||||||||||||||||||||||||.||..|..|||||
 Frog   576 EREAILGIQNEAQKIADYSHIKLASGNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDGALKGEHDKQQSN 640

Human   648 EHLRRQFASQANVVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQ 712
            ||||.||||.|||||||||.||||||||:||::||||||::||||||:|:::||||:|.||||||
 Frog   641 EHLRLQFASLANVVGPWIQAKMEEIGRIAIELHGTLEDQMTHLKQYEQSVINYKPNIDKLEQQHQ 705

Human   713 LIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHF 777
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|:|||||||
 Frog   706 LIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEHLLTTIARTSNEVENQILTRDAKGISQEQMHEYRASFNHF 770

Human   778 DKDHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGEAEFNRIMSLVDP 842
            |:||.|||||||||||||||||||||||||:.|::|:|||||||||||||||:|||||||::|||
 Frog   771 DRDHTGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKRIGALDADDFRALLISTGYSLGDAEFNRIMAIVDP 835

Human   843 NHSGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAP 907
            |::|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||||
 Frog   836 NNTGMVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNYITAAELRRELPPDQAEYCIARMAP 900

Human   908 YQGPDAVPGALDYKSFSTALYGESDL 933
            |||||||||||||.||||||||||||
 Frog   901 YQGPDAVPGALDYMSFSTALYGESDL 926

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACTN4NP_001427225.1 None
actn4XP_017951705.1 CH_ACTN_rpt1 40..144 CDD:409063 102/103 (99%)
CH_ACTN_rpt2 148..262 CDD:409065 112/113 (99%)
SPEC 289..510 CDD:238103 202/220 (92%)
SPEC 407..630 CDD:238103 195/222 (88%)
SPEC 522..747 CDD:238103 189/224 (84%)
PTZ00184 752..>883 CDD:185504 113/130 (87%)
EFhand_Ca_insen 856..922 CDD:430177 62/65 (95%)

Return to query results.
Submit another query.