DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACTN4 and actn4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427225.1 Gene:ACTN4 / 81 HGNCID:166 Length:933 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_021337011.1 Gene:actn4 / 322221 ZFINID:ZDB-GENE-030131-940 Length:923 Species:Danio rerio


Alignment Length:933 Identity:808/933 - (86%)
Similarity:868/933 - (93%) Gaps:10/933 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR 65
            ||||||.|...||       .|||..:   ||.||:|||||||||||||||||||||||||||||
Zfish     1 MVDYHAVNNQGQY-------SAGGPPT---YMEQENDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLR 55

Human    66 KAGTQIENIDEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIG 130
            |||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    56 KAGTQIENIEEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIG 120

Human   131 AEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDG 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   121 AEEIVDGNAKMTLGMIWTIILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDG 185

Human   196 LAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTY 260
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
Zfish   186 LAFNALIHRHRPELIDYDKLRKDDPVTNLNNAFEVAERYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTY 250

Human   261 VSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTI 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|:||:
Zfish   251 VSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLMEDYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRAPEKTM 315

Human   326 QEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGKMVSDINNGWQHL 390
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||..|..|
Zfish   316 AEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRPAFMPSEGRMVSDINGAWHKL 380

Human   391 EQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETATLSDIKALIRK 455
            |.||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||..:|||||:||:||||::|
Zfish   381 EGAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKAAIHEGWTDGKEAMLTQKDYETASLSEIKALLKK 445

Human   456 HEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEKTE 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.:||.||||||:|||||||||.:|||:||:||
Zfish   446 HEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICEQWDALGSLTQNRRESLERTE 510

Human   521 KQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADRERE 585
            ||||:||:|:|||||||||||||||.||||||||||||.|:||:|||:||:|||||||:|::|||
Zfish   511 KQLESIDELYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDMFIVHNIDEIQGLITAHEQFKSTLPEANKERE 575

Human   586 AILAIHKEAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEHL 650
            ||.||..|.|:||..|.|||:|:|||||:|||.|:.||||||||||:||.||.||.::||||:||
Zfish   576 AIQAIQAEVQKIANYNGIKLAGNNPYTTITPQSIDKKWEKVQQLVPQRDQALQEELTRQQSNDHL 640

Human   651 RRQFASQANVVGPWIQTKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQ 715
            |||||:|||::|||||.||||||||||||||||||||:||.|||:||::||||:|.||..|||||
Zfish   641 RRQFANQANMIGPWIQNKMEEIGRISIEMNGTLEDQLTHLSQYEQSIIEYKPNIDQLEGDHQLIQ 705

Human   716 EALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLLTTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKD 780
            ||||||||:|.|||||:|||||||||||||||||:|||:||||||||||||:.|:|.||||||||
Zfish   706 EALIFDNKYTAYTMEHLRVGWEQLLTTIARTINEIENQVLTRDAKGISQEQLHEYRTSFNHFDKD 770

Human   781 HGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQKQTGSMDSDDFRALLISTGYSLGEAEFNRIMSLVDPNHS 845
            |.|.|..|||||||||||||||||:||:||.||||||||||||||.|||:|||.|||.:||||:|
Zfish   771 HSGLLQSEEFKACLISLGYDVENDKQKRTGIMDSDDFRALLISTGNSLGDAEFARIMGIVDPNNS 835

Human   846 GLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQG 910
            |.||||||||||||||||||||||||||||:||||||:|||||||||||||||||||||||||.|
Zfish   836 GAVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKILAGDKNYITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYSG 900

Human   911 PDAVPGALDYKSFSTALYGESDL 933
            ||||.|||||.||||||||||||
Zfish   901 PDAVAGALDYMSFSTALYGESDL 923

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACTN4NP_001427225.1 None
actn4XP_021337011.1 CH_ACTN_rpt1 37..141 CDD:409063 102/103 (99%)
CH_ACTN_rpt2 145..259 CDD:409065 111/113 (98%)
Spectrin 283..393 CDD:395348 98/109 (90%)
SPEC 404..631 CDD:238103 180/226 (80%)
Spectrin 639..742 CDD:395348 85/102 (83%)
PTZ00184 749..>880 CDD:185504 110/130 (85%)
EFhand_Ca_insen 853..919 CDD:430177 60/65 (92%)

Return to query results.
Submit another query.