DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CEP290 and Cep290

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011537058.1 Gene:CEP290 / 80184 HGNCID:29021 Length:2769 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001387926.1 Gene:Cep290 / 216274 MGIID:2384917 Length:2763 Species:Mus musculus


Alignment Length:2772 Identity:2338/2772 - (84%)
Similarity:2568/2772 - (92%) Gaps:12/2772 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MPPNINWKEIMKVDPDDLPRQEELADNLLISLSKVEVNELKSEKQENVIHLFRITQSLMKMKAQE 65
            |||||.|||::|||||||||||||||.||||||||||||||:|.|||:|||||||||||||||||
Mouse     1 MPPNIKWKELIKVDPDDLPRQEELADKLLISLSKVEVNELKNEDQENMIHLFRITQSLMKMKAQE 65

Human    66 VELALEEVEKAGEEQAKFENQLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRNEICQLEKQLEQKDRE 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||||||||||
Mouse    66 VELALEEVEKAGEEQAKFENQLKTKVMKLENELEMAQQSAGGRDTRFLRDEIRQLEKQLEQKDRE 130

Human   131 LEDMEKELEKEKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENKRLKKKNEQLCQDIIDYQKQIDSQKETLL 195
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||:||
Mouse   131 LEDMEKELDKEKKVNEQLALRNEEAENENSKLRRENKRLKKKNEQLRQDIIDYQKQIDSQKESLL 195

Human   196 SRRGEDSDYRSQLSKKNYELIQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDEYNRM 260
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 SRRGEDSDYRSQLSKKNYELVQYLDEIQTLTEANEKIEVQNQEMRKNLEESVQEMEKMTDEYNRM 260

Human   261 KAIVHQTDNVIDQLKKENDHYQLQVQELTDLLKSKNEEDDPIMVAVNAKVEEWKLILSSKDDEII 325
            ||:|||:|.|:||:||||:||:|||:|||||||:|:|||||:|:|||||||||||||||||||||
Mouse   261 KALVHQSDAVMDQIKKENEHYRLQVRELTDLLKAKDEEDDPVMMAVNAKVEEWKLILSSKDDEII 325

Human   326 EYQQMLHNLREKLKNAQLDADKSNVMALQQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTCIIEDLKN 390
            ||||||.:||.|||||||||||||:|||:||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Mouse   326 EYQQMLQSLRGKLKNAQLDADKSNIMALKQGIQERDSQIKMLTEQVEQYTKEMEKNTFIIEDLKN 390

Human   391 ELQRNKGASTLSQQTH-MKIQSTLDILKEKTKEAERTAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESG 454
            |||::||.|...|||| |||.|.:.||:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 ELQKDKGTSNFYQQTHYMKIHSKVQILEEKTKEAERIAELAEADAREKDKELVEALKRLKDYESG 455

Human   455 VYGLEDAVVEIKNCKNQIKIRDREIEILTKEINKLELKISDFLDENEALRERVGLEPKTMIDLTE 519
            ||||||||:||||||.||||||.|:|:|||||||||:||:|.||||||||||.||||||||||||
Mouse   456 VYGLEDAVIEIKNCKAQIKIRDGEMEVLTKEINKLEMKINDILDENEALRERAGLEPKTMIDLTE 520

Human   520 FRNSKHLKQQQYRAENQILLKEIESLEEERLDLKKKIRQMAQERGKRSATSGLTTEDLNLTENIS 584
            |||||.|||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||:|.||||.:||||:|..|
Mouse   521 FRNSKRLKQQQYRAENQVLLKEIESLEEERLDLKRKIRQMAQERGKRNAASGLTIDDLNLSETFS 585

Human   585 QGDRISERKLDLLSLKNMSEAQSKIRSSDKAELLHRRSSFNTPQSDQNETEENMTIGSLSRMLSE 649
            ..::|..|||:.:||.||:|.||||:||.|.||||||.||:..||||:|.||||...|||||||.
Mouse   586 HENKIEGRKLNFMSLNNMNETQSKIKSSAKTELLHRRPSFSVVQSDQSEAEENMATRSLSRMLSG 650

Human   650 IHHSVESGMHPFVPLTRLSSSMQVKENS-TPETITIREIFKAPCLQSSRNLESLVSTFSRESHEE 713
            ||.||.|...|.|.|||.||.||||::| |||.||||||||||||:|.|.|||||||||::..||
Mouse   651 IHQSVGSAGDPIVSLTRCSSFMQVKDSSATPEAITIREIFKAPCLRSLRKLESLVSTFSKDGSEE 715

Human   714 IND-ICLFSDDCMKKVSRSHQALEKTSFVQKSNSSFHGLSTASDIMQKLSLRQKSAIFCQQIHEN 777
            ::: :|..|||.||:.|.:|:.||||.|:|||:|||.....|:::|||||.||.||||.||.::.
Mouse   716 LSEYLCSLSDDHMKRGSGNHRGLEKTRFLQKSSSSFQVSPAAAELMQKLSHRQSSAIFPQQSYDR 780

Human   778 RADMDKSQVATLEEEQVHSQVKYADINLKEDIIKSEVPLQTEILKNKLKVNLPDPVSITAQSKLS 842
              |:||   .|.|:.||:||:::|.::||:|..:||:|.|||:|.:|.:|||.|.|.||||||.|
Mouse   781 --DVDK---VTSEDNQVYSQIEHAVLSLKDDKGQSELPSQTEMLSSKTQVNLSDLVPITAQSKPS 840

Human   843 QINSLENLIEQLRRELVFLRSQNEIIAQEFLIKEAECRNADIELEHHRSQAEQNEFLSRELIEKE 907
            .|:.||.||.|.:|:|.|||||||.|.|:..|:|.:.|||::||:|.||||||||||||||.|||
Mouse   841 LIHPLEKLIGQPQRQLAFLRSQNETIVQDLPIQEEQSRNAELELDHQRSQAEQNEFLSRELAEKE 905

Human   908 RDLERSRTVIAKFQNKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKEMQKDPDVKGGETSLIIPSLERLVNA 972
            :|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||:|.||.||||||||||||||||||||
Mouse   906 KDLERSRTVIAKFQSKLKELVEENKQLEEGMKEILQAIKDMPKDSDVKGGETSLIIPSLERLVNA 970

Human   973 IESKNAEGIFDASLHLKAQVDQLTGRNEELRQELRESRKEAINYSQQLAKANLKIDHLEKETSLL 1037
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||.|||||||||||||.||
Mouse   971 MESKNAEGIFDASLHLKAQVDQLTGRNEELRQELRQSRKEAVNYSQQLVKANLKIDHLEKETDLL 1035

Human  1038 RQSEGSNVVFKGIDLPDGIAPSSASIINSQNEYLIHLLQELENKEKKLKNLEDSLEDYNRKFAVI 1102
            |||.|||||:||||||||||||||.||||||||||||||||:|||||||:|||||||||||||||
Mouse  1036 RQSAGSNVVYKGIDLPDGIAPSSAYIINSQNEYLIHLLQELDNKEKKLKHLEDSLEDYNRKFAVI 1100

Human  1103 RHQQSLLYKEYLSEKETWKTESKTIKEEKRKLEDQVQQDAIKVKEYNNLLNALQMDSDEMKKILA 1167
            |||||||||||||||:.|||:|:.|:|||||||||.:|||:|||||||||:||||||:||||:|:
Mouse  1101 RHQQSLLYKEYLSEKDIWKTDSEMIREEKRKLEDQAEQDAVKVKEYNNLLSALQMDSNEMKKMLS 1165

Human  1168 ENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVELERQLRKENEKQKNELLSMEAEVCEKIGCLQRFKEMAIFK 1232
            |||||||||||||||||||||||||:||.|||||.|.:|::::|||||.||:|.|||||||||||
Mouse  1166 ENSRKITVLQVNEKSLIRQYTTLVEMERHLRKENGKHRNDVIAMEAEVTEKLGSLQRFKEMAIFK 1230

Human  1233 IAALQKVVDNSVSLSELELANKQYNELTAKYRDILQKDNMLVQRTSNLEHLECENISLKEQVESI 1297
            |||||||:||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||:|:|
Mouse  1231 IAALQKVIDNSVSLSELELANKQYNELTTKYRDILQKDNMLVQRTSNLEHLECENASLKEQMEAI 1295

Human  1298 NKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNESSMDKAKKSITNSDIVSISKKITMLEMKELNERQRAEH 1362
            :|||||||||||||||||||||||||:|:|||||||:|||||||||||||:||||||||||||||
Mouse  1296 SKELEITKEKLHTIEQAWEQETKLGNDSNMDKAKKSMTNSDIVSISKKITVLEMKELNERQRAEH 1360

Human  1363 CQKMYEHLRTSLKQMEERNFELETKFAELTKINLDAQKVEQMLRDELADSVSKAVSDADRQRILE 1427
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
Mouse  1361 CQKMYEHLRTSLKQMEERNFELETKFTELTKINLDAQKVEQMLRDELADSVTKAVSDADRQRILE 1425

Human  1428 LEKNEMELKVEVSKLREISDIARRQVEILNAQQQSRDKEVESLRMQLLDYQAQSDEKSLIAKLHQ 1492
            |||:|:||||||||||||||||:|||:.||:|||||:|||||||.||||:|||||||:|||||||
Mouse  1426 LEKSEVELKVEVSKLREISDIAKRQVDFLNSQQQSREKEVESLRTQLLDFQAQSDEKALIAKLHQ 1490

Human  1493 HNVSLQLSEATALGKLESITSKLQKMEAYNLRLEQKLDEKEQALYYARLEGRNRAKHLRQTIQSL 1557
            |.||||:|||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1491 HVVSLQISEATALGKLESVTSKLQKMEAYNLRLEQKLDEKEQALYYARLEGRNRAKHLRQTIQSL 1555

Human  1558 RRQFSGALPLAQQEKFSKTMIQLQNDKLKIMQEMKNSQQEHRNMENKTLEMELKLKGLEELISTL 1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mouse  1556 RRQFSGALPLAQQEKFSKTMIQLQNDKLKIMQEMKNSQQEHRNMENKTLELELKLKGLEELISTL 1620

Human  1623 KDTKGAQKVINWHMKIEELRLQELKLNRELVKDKEEIKYLNNIISEYERTISSLEEEIVQQNKFH 1687
            ||.:|||||||||:||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||:|||||||||:|||
Mouse  1621 KDARGAQKVINWHVKIEELRLQELKLNRELVKGKEEIKYLNNIISEYEHTINSLEEEIVQQSKFH 1685

Human  1688 EERQMAWDQREVDLERQLDIFDRQQNEILNAAQKFEEATGSIPDPSLPLPNQLEIALRKIKENIR 1752
            ||||||||||||:|||||||||.||||||:||||||::|||:||||||||||||||||||||||:
Mouse  1686 EERQMAWDQREVELERQLDIFDHQQNEILSAAQKFEDSTGSMPDPSLPLPNQLEIALRKIKENIQ 1750

Human  1753 IILETRATCKSLEEKLKEKESALRLAEQNILSRDKVINELRLRLPATAEREKLIAELGRKEMEPK 1817
            :||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||:|||
Mouse  1751 VILKTQATCKSLEEKLKEKESALRLAEQNILSRDKVINELRLRLPATADREKLIAELERKELEPK 1815

Human  1818 SHHTLKIAHQTIANMQARLNQKEEVLKKYQRLLEKAREEQREIVKKHEEDLHILHHRLELQADSS 1882
            ||||:|||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||:|||:||.|||:|
Mouse  1816 SHHTMKIAHQTIANMQARLNHKEEVLKKYQHLLEKAREEQREIVKKHEEDLHVLHHKLEQQADNS 1880

Human  1883 LNKFKQTAWDLMKQSPTPVPTNKHFIRLAEMEQTVAEQDDSLSSLLVKLKKVSQDLERQREITEL 1947
            ||||:|||.||:||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||:|||:|:|||||
Mouse  1881 LNKFRQTAQDLLKQSPAPVPTNKHFIRLAEMEQTVAEQDDSLSSLLTKLKKVSKDLEKQKEITEL 1945

Human  1948 KVKEFENIKLQLQENHEDEVKKVKAEVEDLKYLLDQSQKESQCLKSELQAQKEANSRAPTTTMRN 2012
            ||:||||.||:|||.|..||||||||||||::.|.|:.|:||.||||||||||||||||||||||
Mouse  1946 KVREFENTKLRLQETHASEVKKVKAEVEDLRHALAQAHKDSQSLKSELQAQKEANSRAPTTTMRN 2010

Human  2013 LVERLKSQLALKEKQQKALSRALLELRAEMTAAAEERIISATSQKEAHLNVQQIVDRHTRELKTQ 2077
            ||:||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:.||||||:|||||:|:|||||||:|
Mouse  2011 LVDRLKSQLALKEKQQKALSRALLELRSEMTAAAEERIIAVTSQKEANLNVQQVVERHTRELKSQ 2075

Human  2078 VEDLNENLLKLKEALKTSKNRENSLTDNLNDLNNELQKKQKAYNKILREKEEIDQENDELKRQIK 2142
            :|||||||||||||||||||:||||.|:||:|||||||||||||||||||:.||||||||:||||
Mouse  2076 IEDLNENLLKLKEALKTSKNKENSLADDLNELNNELQKKQKAYNKILREKDGIDQENDELRRQIK 2140

Human  2143 RLTSGLQGKPLTDNKQSLIEELQRKVKKLENQLEGKVEEVDLKPMKEKNAKEELIRWEEGKKWQA 2207
            ||:||||.|.|.|||||||:|||:||||||:|||.||::||:||:|||::||||||||||||||.
Mouse  2141 RLSSGLQSKTLIDNKQSLIDELQKKVKKLESQLERKVDDVDIKPVKEKSSKEELIRWEEGKKWQT 2205

Human  2208 KIEGIRNKLKEKEGEVFTLTKQLNTLKDLFAKADKEKLTLQRKLKTTGMTVDQVLGIRALESEKE 2272
            |:||:||:|||||||...|.|||||||:|||||||||||||:||||||||||||||:||||||||
Mouse  2206 KVEGLRNRLKEKEGEAHGLAKQLNTLKELFAKADKEKLTLQKKLKTTGMTVDQVLGVRALESEKE 2270

Human  2273 LEELKKRNLDLENDILYMRAHQALPRDSVVEDLHLQNRYLQEKLHALEKQFSKDTYSKPSQNQIS 2337
            ||||||:||||||||||||..||||||||||||||||:|||||||.|||:.||:.|   ||:..|
Mouse  2271 LEELKKKNLDLENDILYMRTQQALPRDSVVEDLHLQNKYLQEKLHTLEKKLSKEKY---SQSLTS 2332

Human  2338 GIESDDHCQREQELQKENLKLSSENIELKFQLEQANKDLPRLKNQVRDLKEMCEFLKKEKAEVQR 2402
            .||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||.|.|::|
Mouse  2333 EIESDDHCQKEQELQKENLKLSSENIELKFQLEQANKDLPRLKNQVKDLKEMCEFLKKGKLELER 2397

Human  2403 KLGHVRGSGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENEQLKKASGILTSEKMANIEQENEKLKAEL 2467
            |||.|||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:||..|||||
Mouse  2398 KLGQVRGAGRSGKTIPELEKTIGLMKKVVEKVQRENEQLKKASGILTSEKMATIEEENRNLKAEL 2462

Human  2468 EKLKAHLGHQLSMHYESKTKGTEKIIAENERLRKELKKETDAAEKLRIAKNNLEILNEKMTVQLE 2532
            ||||||.|.||||.:|||.||||||:|||||||||||||.:|:|||||||||||::|:||..|||
Mouse  2463 EKLKAHFGRQLSMQFESKNKGTEKIVAENERLRKELKKEIEASEKLRIAKNNLELVNDKMAAQLE 2527

Human  2533 ETGKRLQFAESRGPQLEGADSKSWKSIVVTRMYETKLKELETDIAKKNQSITDLKQLVKEATERE 2597
            ||||||||||||.||||||||||||||||:|:||||:||||:||||||||||||||||:||||||
Mouse  2528 ETGKRLQFAESRAPQLEGADSKSWKSIVVSRVYETKMKELESDIAKKNQSITDLKQLVREATERE 2592

Human  2598 QKVNKYNEDLEQQIKILKHVPEGAETEQGLKRELQVLRLANHQLDKEKAELIHQIEANKDQSGAE 2662
            ||..||.|||||||:|||:|||||||||.|.||||:|||||:|:|||:||||||||.||||:.|:
Mouse  2593 QKAKKYTEDLEQQIEILKNVPEGAETEQELIRELQLLRLANNQMDKERAELIHQIEINKDQTRAD 2657

Human  2663 STIPDADQLKEKIKDLETQLKMSDLEKQHLKEEIKKLKKELENFDPSFFEEIEDLKYNYKEEVKK 2727
            |:|||:|||||||.||||||:..:|||||.|||:|||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2658 SSIPDSDQLKEKINDLETQLRKLELEKQHSKEEVKKLKKELENFDPSFFEEIEDLKYNYKEEVKK 2722

Human  2728 NILLEEKVKKLSEQLGVELTSPVAASEEFEDEEESPVNFPIY 2769
            |||||||:||||||.|.||.||:||||..|| .|||.:||||
Mouse  2723 NILLEEKLKKLSEQFGFELPSPLAASEHSED-GESPHSFPIY 2763

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CEP290XP_011537058.1 Smc <93..>374 CDD:440809 257/280 (92%)
SMC_N <243..563 CDD:481474 277/320 (87%)
SMC_prok_B 843..1562 CDD:274008 630/718 (88%)
SMC_prok_B 1369..2176 CDD:274008 718/806 (89%)
CEP209_CC5 1576..1703 CDD:465184 117/126 (93%)
PTZ00121 <1856..2741 CDD:173412 744/884 (84%)
Cep290NP_001387926.1 SMC_prok_B 28..>564 CDD:274008 483/535 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 128..164 34/35 (97%)
SMC_prok_B <853..1560 CDD:274008 624/706 (88%)
SMC_prok_B 1367..2142 CDD:274008 693/774 (90%)
CEP209_CC5 1574..1701 CDD:465184 117/126 (93%)
SMC_prok_B 1908..2625 CDD:274008 605/719 (84%)

Return to query results.
Submit another query.