DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment EHMT1 and Ehmt1

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011517323.1 Gene:EHMT1 / 79813 HGNCID:24650 Length:1301 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_006233681.2 Gene:Ehmt1 / 362078 RGDID:1307588 Length:1309 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1293 Identity:1152/1293 - (89%)
Similarity:1203/1293 - (93%) Gaps:7/1293 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    11 AVPARGEPQQDCCVKTELLGEETPMAADEGSAEKQAGEAHMAADGETNGSCENSDASSHANAAKH 75
            ||.|:.|.:||||:|||||.|:|.|||||||.||||||..||||||||||||.|...||.||.||
  Rat    22 AVLAKQETKQDCCMKTELLREDTLMAADEGSTEKQAGETPMAADGETNGSCEKSGDISHPNAPKH 86

Human    76 TQDSARVNPQDGTNTLTRIAENGVSERDSEAAKQNHVTADDFVQTSVIGSNGYILNKPALQAQPL 140
            ||::.|.:||:|||.::|:|||||||||:|..||||||||||:||||||||||.|||||||.|||
  Rat    87 TQENTRASPQEGTNRVSRVAENGVSERDTEVGKQNHVTADDFMQTSVIGSNGYFLNKPALQGQPL 151

Human   141 RTTSTLASSLPGHAAKTLPGGAGKGRTPSAFPQTPAAPPATLGEGSADTEDRKLPAPGADVKVHR 205
            ||.:||.|||||||||||||||.|.|||||.||||...|...|||||||||||..|.|.||:|||
  Rat   152 RTPNTLNSSLPGHAAKTLPGGASKCRTPSALPQTPTTAPTVPGEGSADTEDRKPTASGTDVRVHR 216

Human   206 ARKTMPKSVVGLHAASKDPREVREARDHKEPKEEINKNISDFGRQQLLPPFPSLHQSLPQNQCYM 270
            ||||||||::||||||||.|||   :|||||||:||:|||:.|||||||.||:||||||||||||
  Rat   217 ARKTMPKSILGLHAASKDHREV---QDHKEPKEDINRNISECGRQQLLPTFPALHQSLPQNQCYM 278

Human   271 ATTKSQTACLPFVLAAAVSRKKKRRMGTYSLVPKKKTKVLKQRTVIEMFKSITHSTVGSKGEKDL 335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||.|
  Rat   279 ATTKSQTACLPFVLAAAVSRKKKRRMGTYSLVPKKKTKVLKQRTVIEMFKSITHSTVGAKGEKVL 343

Human   336 GASSLHVNGESLEMDSDEDDSEELEEDDGHGAEQAAAFPTEDSRTSKESMSEADRAQKMDGESEE 400
            ..|:||||||||||||:|:||||||:::..||||||||||||||||||||||.|||.||||:|||
  Rat   344 DDSALHVNGESLEMDSEEEDSEELEDEEDRGAEQAAAFPTEDSRTSKESMSETDRAAKMDGDSEE 408

Human   401 EQESVDTGEEEEGGDESDLSSESSIKKKFLKRKGKTDSPWIKPARKRRRRSRKKPSGALGSESYK 465
            ||||.||||:|:||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||..||||:.|
  Rat   409 EQESPDTGEDEDGGDESDLSSESSIKKKFLKRRGKTDSPWIKPARKRRRRSRKKPSSMLGSEACK 473

Human   466 SSAGSAEQTAPGDSTGYMEVSLDSLDLRVKGILSSQA--EGLANGPDVLETDGLQEVPLCSCRME 528
            ||.||.||.|.|||.||||||||||||||:||||||.  |||||||||||||||.||||||||||
  Rat   474 SSPGSMEQAALGDSAGYMEVSLDSLDLRVRGILSSQTENEGLANGPDVLETDGLHEVPLCSCRME 538

Human   529 TPKSREITTLANNQCMATESVDHELGRCTNSVVKYELMRPSNKAPLLVLCEDHRGRMVKHQCCPG 593
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   539 TPKSREISTLANNQCMATESVDHELGRCTNSVVKYELMRPSNKAPLLVLCEDHRGRMVKHQCCPG 603

Human   594 CGYFCTAGNFMECQPESSISHRFHKDCASRVNNASYCPHCGEESSKAKEVTIAKADTTSTVTPVP 658
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||..|
  Rat   604 CGYFCTAGNFMECQPESSISHRFHKDCASRVNNASYCPHCGEETSKAKEVTIAKADTTSTVTLAP 668

Human   659 GQEKGSALEGRADTTTGSAAGPPLSEDDKLQGAASHVPEGFDPTGPAGLGRPTPGLSQGPGKETL 723
            ||||..|.||||||||||.||.|  ||:|.|...:..||.|||.||||..|||.|.|||||||||
  Rat   669 GQEKSLAAEGRADTTTGSIAGAP--EDEKSQSTVTQAPECFDPAGPAGFVRPTSGFSQGPGKETL 731

Human   724 ESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQNKRSPLHAAAEAGH 788
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   732 ESALIALDSEKPKKLRFHPKQLYFSARQGELQKVLLMLVDGIDPNFKMEHQSKRSPLHAAAEAGH 796

Human   789 VDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLEAVKYLIKAGALVDPKDAEGSTCLHLAAKKG 853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat   797 VDICHMLVQAGANIDTCSEDQRTPLMEAAENNHLDAVKYLIKAGAQVDPKDAEGSTCLHLAAKKG 861

Human   854 HYEVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAF 918
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   862 HYDVVQYLLSNGQMDVNCQDDGGWTPMIWATEYKHVDLVKLLLSKGSDINIRDNEENICLHWAAF 926

Human   919 SGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCAS 983
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   927 SGCVDIAEILLAAKCDLHAVNIHGDSPLHIAARENRYDCVVLFLSRDSDVTLKNKEGETPLQCAS 991

Human   984 LNSQVWSALQMSKALQDSAPDRPSPVERIVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSEPCPSNYKYVSQNC 1048
            |||||||||||||||||||||:|..||:.|||||||||||||||||||||||.||:|||||||||
  Rat   992 LNSQVWSALQMSKALQDSAPDKPVAVEKTVSRDIARGYERIPIPCVNAVDSELCPTNYKYVSQNC 1056

Human  1049 VTSPMNIDRNITHLQYCVCIDDCSSSNCMCGQLSMRCWYDKDGRLLPEFNMAEPPLIFECNHACS 1113
            |||||||||||||||||||:||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1057 VTSPMNIDRNITHLQYCVCVDDCSSSTCMCGQLSMRCWYDKDGRLLPEFNMAEPPLIFECNHACS 1121

Human  1114 CWRNCRNRVVQNGLRARLQLYRTRDMGWGVRSLQDIPPGTFVCEYVGELISDSEADVREEDSYLF 1178
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1122 CWRNCRNRVVQNGLRARLQLYRTQDMGWGVRSLQDIPLGTFVCEYVGELISDSEADVREEDSYLF 1186

Human  1179 DLDNKDGEVYCIDARFYGNVSRFINHHCEPNLVPVRVFMAHQDLRFPRIAFFSTRLIEAGEQLGF 1243
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||||
  Rat  1187 DLDNKDGEVYCIDARFYGNVSRFINHHCEPNLVPVRVFMSHQDLRFPRIAFFSTRLIQAGEQLGF 1251

Human  1244 DYGERFWDIKGKLFSCRCGSPKCRHSSAALAQRQASAAQEAQEDGLPDTSSAAAADPL 1301
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
  Rat  1252 DYGERFWDVKGKLFSCRCGSPKCRHSSAALAQRQASAAQEAQENGLPDTSSAAAADPL 1309

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
EHMT1XP_011517323.1 EHMT_ZBD 517..647 CDD:411018 126/129 (98%)
ANKYR 723..979 CDD:440430 251/255 (98%)
ANK repeat 745..771 CDD:293786 25/25 (100%)
ANK repeat 777..806 CDD:293786 28/28 (100%)
ANK repeat 808..839 CDD:293786 28/30 (93%)
ANK repeat 841..873 CDD:293786 30/31 (97%)
ANK repeat 875..906 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 908..939 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 941..972 CDD:293786 30/30 (100%)
SET_EHMT1 1039..1269 CDD:380933 221/229 (97%)
Ehmt1XP_006233681.2 EHMT_ZBD 527..657 CDD:411018 126/129 (98%)
ANKYR 731..987 CDD:440430 251/255 (98%)
ANK repeat 785..814 CDD:293786 28/28 (100%)
ANK repeat 816..847 CDD:293786 28/30 (93%)
ANK repeat 849..881 CDD:293786 30/31 (97%)
ANK repeat 883..914 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 916..947 CDD:293786 30/30 (100%)
ANK repeat 949..980 CDD:293786 30/30 (100%)
SET_EHMT1 1047..1277 CDD:380933 221/229 (97%)

Return to query results.
Submit another query.