DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits

Protein Alignment CACNA1D and Cacna1d

DIOPT Version :9

Sequence 1:	XP_011532396.1	Gene:	CACNA1D / 776	HGNCID:	1391	Length:	2246	Species:	Homo sapiens
Sequence 2:	XP_006518538.1	Gene:	Cacna1d / 12289	MGIID:	88293	Length:	2207	Species:	Mus musculus

Alignment Length:	2187	Identity:	2119/2187 - (96%)
Similarity:	2158/2187 - (98%)	Gaps:	2/2187 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

Human    60 EANYARGTRLPLSGEGPTSQPNSSKQTVLSWQAAIDAARQAKAAQTMSTSAPPPVGSLSQRKRQQ 124
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    23 EANYARGTRLPISGEGPTSQPNSSKQTVLSWQAAIDAARQAKAAQTMSTSAPPPVGSLSQRKRQQ 87

Human   125 YAKSKKQGNSSNSRPARALFCLSLNNPIRRACISIVEWKPFDIFILLAIFANCVALAIYIPFPED 189
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    88 YAKSKKQGNSSNSRPARALFCLSLNNPIRRACISIVEWKPFDIFILLAIFANCVALAIYIPFPED 152

Human   190 DSNSTNHNLEKVEYAFLIIFTVETFLKIIAYGLLLHPNAYVRNGWNLLDFVIVIVGLFSVILEQL 254
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   153 DSNSTNHNLEKVEYAFLIIFTVETFLKIIAYGLLLHPNAYVRNGWNLLDFVIVIVGLFSVILEQL 217

Human   255 TKETEGGNHSSGKSGGFDVKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVI 319
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   218 TKETEGGNHSSGKSGGFDVKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVI 282

Human   320 IIYAIIGLELFIGKMHKTCFFADSDIVAEEDPAPCAFSGNGRQCTANGTECRSGWVGPNGGITNF 384
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   283 IIYAIIGLELFIGKMHKTCFFADSDIVAEEDPAPCAFSGNGRQCTANGTECRSGWVGPNGGITNF 347

Human   385 DNFAFAMLTVFQCITMEGWTDVLYWMNDAMGFELPWVYFVSLVIFGSFFVLNLVLGVLSGEFSKE 449
            |||||||||||||||||||||||||:|||:|:|.||||||||:|.||||||||||||||||||||
Mouse   348 DNFAFAMLTVFQCITMEGWTDVLYWVNDAIGWEWPWVYFVSLIILGSFFVLNLVLGVLSGEFSKE 412

Human   450 REKAKARGDFQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEEEGGEEGKRNTSMPTSETESVNTE 514
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   413 REKAKARGDFQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEEEGGEEGKRNTSMPTSETESVNTE 477

Human   515 NVSGEGENRGCCGSLWCWWRRRGAAKAGPSGCRRWGQAISKSKLSRRWRRWNRFNRRRCRAAVKS 579
            |||||||.:||||:|||||:||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   478 NVSGEGETQGCCGTLWCWWKRRGAAKTGPSGCRRWGQAISKSKLSRRWRRWNRFNRRRCRAAVKS 542

Human   580 VTFYWLVIVLVFLNTLTISSEHYNQPDWLTQIQDIANKVLLALFTCEMLVKMYSLGLQAYFVSLF 644
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   543 VTFYWLVIVLVFLNTLTISSEHYNQPDWLTQIQDIANKVLLALFTCEMLVKMYSLGLQAYFVSLF 607

Human   645 NRFDCFVVCGGITETILVELEIMSPLGISVFRCVRLLRIFKVTRHWTSLSNLVASLLNSMKSIAS 709
            |||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   608 NRFDCFVVCGGITETILVELELMSPLGVSVFRCVRLLRIFKVTRHWTSLSNLVASLLNSMKSIAS 672

Human   710 LLLLLFLFIIIFSLLGMQLFGGKFNFDETQTKRSTFDNFPQALLTVFQILTGEDWNAVMYDGIMA 774
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   673 LLLLLFLFIIIFSLLGMQLFGGKFNFDETQTKRSTFDNFPQALLTVFQILTGEDWNAVMYDGIMA 737

Human   775 YGGPSSSGMIVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLNTAQKEEAEEKERKKIARKES 839
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   738 YGGPSSSGMIVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLNTAQKEEAEEKERKKIARKES 802

Human   840 LENKKNNKPEVNQIANSDNKVTIDDYREEDEDKDPYPPCDVPVGEEEEEEEEDEPEVPAGPRPRR 904
            ||||||||||||||||||||||||||:|:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   803 LENKKNNKPEVNQIANSDNKVTIDDYQEDAEDKDPYPPCDVPVGEEEEEEEEDEPEVPAGPRPRR 867

Human   905 ISELNMKEKIAPIPEGSAFFILSKTNPIRVGCHKLINHHIFTNLILVFIMLSSAALAAEDPIRSH 969
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   868 ISELNMKEKIAPIPEGSAFFILSKTNPIRVGCHKLINHHIFTNLILVFIMLSSAALAAEDPIRSH 932

Human   970 SFRNTILGYFDYAFTAIFTVEILLKMTTFGAFLHKGAFCRNYFNLLDMLVVGVSLVSFGIQSSAI 1034
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   933 SFRNTILGYFDYAFTAIFTVEILLKMTTFGAFLHKGAFCRNYFNLLDMLVVGVSLVSFGIQSSAI 997

Human  1035 SVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVFVAIRTIGNIMIVTTLLQFMFACIGVQLFKGKFY 1099
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   998 SVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVFVAIRTIGNIMIVTTLLQFMFACIGVQLFKGKFY 1062

Human  1100 RCTDEAKSNPEECRGLFILYKDGDVDSPVVRERIWQNSDFNFDNVLSAMMALFTVSTFEGWPALL 1164
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1063 RCTDEAKSNPEECRGLFILYKDGDVDSPVVRERIWQNSDFNFDNVLSAMMALFTVSTFEGWPALL 1127

Human  1165 YKAIDSNGENIGPIYNHRVEISIFFIIYIIIVAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEKEYKNCELDKNQ 1229
            ||||||||||:||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1128 YKAIDSNGENVGPVYNYRVEISIFFIIYIIIVAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEKEYKNCELDKNQ 1192

Human  1230 RQCVEYALKARPLRRYIPKNPYQYKFWYVVNSSPFEYMMFVLIMLNTLCLAMQHYEQSKMFNDAM 1294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1193 RQCVEYALKARPLRRYIPKNPYQYKFWYVVNSSPFEYMMFVLIMLNTLCLAMQHYEQSKMFNDAM 1257

Human  1295 DILNMVFTGVFTVEMVLKVIAFKPKGYFSDAWNTFDSLIVIGSIIDVALSEADHYFTDAWNTFDA 1359
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1258 DILNMVFTGVFTVEMVLKVIAFKPKGYFSDAWNTFDSLIVIGSIIDVALSEADHYFTDAWNTFDA 1322

Human  1360 LIVVGSVVDIAITEVNPTESENVPVPTATPGNSEESNRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTL 1424
            |||||||||||||||||:|||.:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1323 LIVVGSVVDIAITEVNPSESETIPLPTATPGNSEESNRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTL 1387

Human  1425 LWTFIKSFQALPYVALLIAMLFFIYAVIGMQMFGKVAMRDNNQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCAT 1489
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1388 LWTFIKSFQALPYVALLIAMLFFIYAVIGMQMFGKVAMRDNNQINRNNNFQTFPQAVLLLFRCAT 1452

Human  1490 GEAWQEIMLACLPGKLCDPESDYNPGEEYTCGSNFAIVYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDY 1554
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1453 GEAWQEIMLACLPGKLCDPDSDYNPGEEYTCGSNFAIVYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDY 1517

Human  1555 LTRDWSILGPHHLDEFKRIWSEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKLCPHRVACKRLVAM 1619
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1518 LTRDWSILGPHHLDEFKRIWSEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKLCPHRVACKRLVAM 1582

Human  1620 NMPLNSDGTVMFNATLFALVRTALKIKTEGNLEQANEELRAVIKKIWKKTSMKLLDQVVPPAGDD 1684
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1583 NMPLNSDGTVMFNATLFALVRTALKIKTEGNLEQANEELRAVIKKIWKKTSMKLLDQVVPPAGDD 1647

Human  1685 EVTVGKFYATFLIQDYFRKFKKRKEQGLVGKYPAKNTTIALQAGLRTLHDIGPEIRRAISCDLQD 1749
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1648 EVTVGKFYATFLIQDYFRKFKKRKEQGLVGKYPAKNTTIALQAGLRTLHDIGPEIRRAISCDLQD 1712

Human  1750 DEPEETKREEEDDVFKRNGALLGNHVNHVNSDRRDSLQQTNTTHRPLHVQRPSIPPASDTEKPLF 1814
            ||||::|.||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse  1713 DEPEDSKPEEE-DVFKRNGALLGNHVNHVNSDRRDSLQQTNTTHRPLHVQRPSMPPASDTEKPLF 1776

Human  1815 PPAGNSVCHNHHNHNSIGKQVPTSTNANLNNANMSKAAHGKRPSIGNLEHVSENGHHSSHKHDRE 1879
            ||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|. |||||
Mouse  1777 PPAGNSGCHNHHNHNSIGKQAPTSTNANLNNANMSKAAHGKPPSIGNLEHVSENGHYSC-KHDRE 1840

Human  1880 PQRRSSVKRTRYYETYIRSDSGDEQLPTICREDPEIHGYFRDPHCLGEQEYFSSEECYEDDSSPT 1944
            .|||||:||||||||||||:|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Mouse  1841 LQRRSSIKRTRYYETYIRSESGDEQFPTICREDPEIHGYFRDPRCLGEQEYFSSEECCEDDSSPT 1905

Human  1945 WSRQNYGYYSRYPGRNIDSERPRGYHHPQGFLEDDDSPVCYDSRRSPRRRLLPPTPASHRRSSFN 2009
            ||||||.||:||||.::|.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||
Mouse  1906 WSRQNYNYYNRYPGSSMDFERPRGYHHPQGFLEDDDSPTGYDSRRSPRRRLLPPTPPSHRRSSFN 1970

Human  2010 FECLRRQSSQEEVPSSPIFPHRTALPLHLMQQQIMAVAGLDSSKAQKYSPSHSTRSWATPPATPP 2074
            ||||||||||::|..||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1971 FECLRRQSSQDDVLPSPALPHRAALPLHLMQQQIMAVAGLDSSKAQKYSPSHSTRSWATPPATPP 2035

Human  2075 YRDWTPCYTPLIQVEQSEALDQVNGSLPSLHRSSWYTDEPDISYRTFTPASLTVPSSFRNKNSDK 2139
            ||||:|||||||||::||::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2036 YRDWSPCYTPLIQVDRSESMDQVNGSLPSLHRSSWYTDEPDISYRTFTPASLTVPSSFRNKNSDK 2100

Human  2140 QRSADSLVEAVLISEGLGRYARDPKFVSATKHEIADACDLTIDEMESAASTLLNGNVRPRANGDV 2204
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.||||||:
Mouse  2101 QRSADSLVEAVLISEGLGRYARDPKFVSATKHEIADACDLTIDEMESAASTLLNGSVCPRANGDM 2165

Human  2205 GPLSHRQDYELQDFGPGYSDEEPDPGRDEEDLADEMICITTL 2246
            ||:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
Mouse  2166 GPISHRQDYELQDFGPGYSDEEPDPGREEEDLADEMICITTL 2207

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CACNA1D	XP_011532396.1	Ion_trans	180..454	CDD:278921	267/273 (98%)
		Ion_trans	600..817	CDD:278921	214/216 (99%)
		Ion_trans	960..1219	CDD:278921	255/258 (99%)
		Ion_trans	1279..1560	CDD:278921	275/280 (98%)
		GPHH	1568..1631	CDD:293510	62/62 (100%)
		Ca_chan_IQ	1633..1704	CDD:285917	70/70 (100%)
		CAC1F_C	1728..2243	CDD:293490	471/514 (92%)
Cacna1d	XP_006518538.1	Ion_trans	125..417	CDD:366146	285/291 (98%)
		Ion_trans	545..780	CDD:366146	232/234 (99%)
		Ion_trans	905..1182	CDD:366146	273/276 (99%)
		Ion_trans	1224..1523	CDD:366146	293/298 (98%)
		GPHH	1532..1585	CDD:374878	52/52 (100%)
		Ca_chan_IQ	1596..1667	CDD:370105	70/70 (100%)
		CAC1F_C	1690..2206	CDD:374867	474/517 (92%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C83962193
Domainoid	1	1.000	992	1.000	Domainoid score	I1724
eggNOG	1	0.900	-	-		E1_KOG2301
HGNC	1	1.500	-	-
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H578
Inparanoid	1	1.050	4221	1.000	Inparanoid score	I231
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
NCBI	1	1.000	-	-
OMA	1	1.010	-	-		QHG48156
OrthoDB	1	1.010	-	-		D1680at314146
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0000179
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto117793
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_100303
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR45628
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	1	1.030	-	avgDist	Average_Evolutionary_Distance	R175
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X533
SwiftOrtho	0	0.000	Not matched by this tool.
TreeFam	1	0.960	-	-
	18	18.300