Protein Alignment CACNA1A and Cacna1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_075461.2
• Gene: CACNA1A / 773
• HGNCID: 1388
• Length: 2512
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: XP_063133859.1
• Gene: Cacna1a / 25398
• RGDID: 2244
• Length: 2457
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 2515
• Identity: 2186/2515 - (86%)
• Similarity: 2240/2515 - (89%)
• Gaps: 150/2515 - (5%)

Human     1 MARFGDEMPARY--GGGGSGAAAGVVVGSGGGRGAGGSRQGGQPGAQRMYKQSMAQRARTMALYN 63
            |||||||||.||  ||||||.|||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    90 MARFGDEMPGRYGAGGGGSGPAAGVVVGAAGGRGAGGSRQGGQPGAQRMYKQSMAQRARTMALYN 154

Human    64 PIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITEWPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDDDKTP 128
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   155 PIPVRQNCLTVNRSLFLFSEDNVVRKYAKKITEWPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPDDDKTP 219

Human   129 MSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIIALGFAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRT 193
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   220 MSERLDDTEPYFIGIFCFEAGIKIVALGFAFHKGSYLRNGWNVMDFVVVLTGILATVGTEFDLRT 284

Human   194 LRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFE 258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   285 LRAVRVLRPLKLVSGIPSLQVVLKSIMKAMIPLLQIGLLLFFAILIFAIIGLEFYMGKFHTTCFE 349

Human   259 EGTDDIQGESPAPCGTEEPARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDL 323
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   350 EGTDDIQGESPAPCGTEEPARTCPNGTKCQPYWEGPNNGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTDL 414

Human   324 LYNSNDASGNTWNWLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERE 388
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   415 LYNSNDASGNTWNWLYFIPLIIIGSFFMLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFLKLRRQQQIERE 479

Human   389 LNGYMEWISKAEEVILAEDETDGEQRHPFDGALRRTTIKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPF 453
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   480 LNGYMEWISKAEEVILAEDETDVEQRHPFDGALRRATLKKSKTDLLNPEEAEDQLADIASVGSPF 544

Human   454 ARASIKSAKLENSTFFHKKERRMRFYIRRMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHYNQPEWLSDF 518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   545 ARASIKSAKLENSTFFHKKERRMRFYIRRMVKTQAFYWTVLSLVALNTLCVAIVHYNQPEWLSDF 609

Human   519 LYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIKPGTSFGISVLR 583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   610 LYYAEFIFLGLFMSEMFIKMYGLGTRPYFHSSFNCFDCGVIIGSIFEVIWAVIKPGTSFGISVLR 674

Human   584 ALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGQFNFDEGTPP 648
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   675 ALRLLRIFKVTKYWASLRNLVVSLLNSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGQFNFDEGTPP 739

Human   649 TNFDTFPAAIMTVFQILTGEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIA 713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   740 TNFDTFPAAIMTVFQILTGEDWNEVMYDGIKSQGGVQGGMVFSIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIA 804

Human   714 VDNLANAQELTKVEADEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVW 778
            ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   805 VDNLANAQELTK---DEQEEEEAANQKLALQKAKEVAEVSPLSAANMSIAVKEQQKNQKPAKSVW 866

Human   779 EQRTSEMRKQNLLASREALYNEMDPDERWKAAYTRHLRPDMKTHLDRPLVVDPQENRNNNTNKSR 843
            ||||||||||||||||||||.  |..|||...|.|.||||:||||||||||||||||||||||||
  Rat   867 EQRTSEMRKQNLLASREALYG--DAAERWPTTYARPLRPDVKTHLDRPLVVDPQENRNNNTNKSR 929

Human   844 AAEPTVDQRLGQQRAEDFLRKQARYHDRARDPSGSAGLDARRPWAGSQEAELSREGPYGRESDHH 908
            |.|.              ||:.||..:.||||      ||||.|..|.|....|||||||||:..
  Rat   930 APEA--------------LRQTARPRESARDP------DARRAWPSSPERAPGREGPYGRESEPQ 974

Human   909 AREGSLEQPGF-WEGEAERGKAGDPHRRHVHRQGGSRESRSGSPRTGADGEHRRHRAHRRPGEEG 972
            .||.:..:... |:.:.||.||||..|||.|             |..|:||.|||||.||||:|
  Rat   975 QREHAPPREHVPWDADPERAKAGDAPRRHTH-------------RPVAEGEPRRHRARRRPGDE- 1025

Human   973 PEDKAERRARHREGSRPARGGEGEGEGPDGGERRRRHRHGAPATYEGDARREDKERRHRRRKENQ 1037
            |:|:.|||.|.|:.:||||..:|||   |.|||:||||||.||       .:|:|||||||||:|
  Rat  1026 PDDRPERRPRPRDATRPARAADGEG---DDGERKRRHRHGPPA-------HDDRERRHRRRKESQ 1080

Human  1038 GSGVPVSGPNLSTTRPIQQDLGRQDPPLAEDIDNMKNNKLATAESAAPHGSLGHAGLPQSPAKMG 1102
            |||||:|||||||||||||||||||.|||||:||||||||||.|.|:||.||||:|||.||||:|
  Rat  1081 GSGVPMSGPNLSTTRPIQQDLGRQDLPLAEDLDNMKNNKLATGEPASPHDSLGHSGLPPSPAKIG 1145

Human  1103 NSTDPGPMLAIPAMATNPQNAASRRTPNNPGNPSNPGPPKTPENSLIVTNPSGTQTNSAKTARKP 1167
            |||:||     ||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
  Rat  1146 NSTNPG-----PALATNPQNAASRRTPNNPGNPSNPGPPKTPENSLIVTNPSSTQPNSAKTARKP 1205

Human  1168 DHTTVDIPPACPPPLNHTVVQVNKNANPDPLPKKEEEKKEEEEDDRGEDGPKPMPPYSSMFILST 1232
            :|..|:||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||
  Rat  1206 EHMAVEIPPAC-PPLNHTVVQVNKNANPDPLPKKEEEKKEEEEADPGEDGPKPMPPYSSMFILST 1269

Human  1233 TNPLRRLCHYILNLRYFEMCILMVIAMSSIALAAEDPVQPNAPRNNVLRYFDYVFTGVFTFEMVI 1297
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1270 TNPLRRLCHYILNLRYFEMCILMVIAMSSIALAAEDPVQPNAPRNNVLRYFDYVFTGVFTFEMVI 1334

Human  1298 KMIDLGLVLHQGAYFRDLWNILDFIVVSGALVAFAFTGNSKGKDINTIKSLRVLRVLRPLKTIKR 1362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1335 KMIDLGLVLHQGAYFRDLWNILDFIVVSGALVAFAFTGNSKGKDINTIKSLRVLRVLRPLKTIKR 1399

Human  1363 LPKLKAVFDCVVNSLKNVFNILIVYMLFMFIFAVVAVQLFKGKFFHCTDESKEFEKDCRGKYLLY 1427
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
  Rat  1400 LPKLKAVFDCVVNSLKNVFNILIVYMLFMFIFAVVAVQLFKGKFFHCTDESKEFERDCRGKYLLY 1464

Human  1428 EKNEVKARDREWKKYEFHYDNVLWALLTLFTVSTGEGWPQVLKHSVDATFENQGPSPGYRMEMSI 1492
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1465 EKNEVKARDREWKKYDFHYDNVLWALLTLFTVSTGEGWPQVLKHSVDATFENQGPSPGYRMEMSI 1529

Human  1493 FYVVYFVVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGDKMMEEYSLEKNERACIDFAISAKPLTRHMPQNKQS 1557
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1530 FYVVYFVVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGDKMMEEYSLEKNERACIDFAISAKPLTRHMPQNKQS 1594

Human  1558 FQYRMWQFVVSPPFEYTIMAMIALNTIVLMMKFYGASVAYENALRVFNIVFTSLFSLECVLKVMA 1622
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1595 FQYRMWQFVVSPPFEYTIMAMIALNTIVLMMKFYGASVAYENALRVFNIVFTSLFSLECVLKVMA 1659

Human  1623 FGILNYFRDAWNIFDFVTVLGSITDILVTEFGNPNNFINLSFLRLFRAARLIKLLRQGYTIRILL 1687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1660 FGILNYFRDAWNIFDFVTVLGSITDILVTEFG--NNFINLSFLRLFRAARLIKLLRQGYTIRILL 1722

Human  1688 WTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIGIDVEDEDSDEDEFQITEHNNFRTFFQALM 1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1723 WTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIGIDGEDEDSDEDEFQITEHNNFRTFFQALM 1787

Human  1753 LLFRSATGEAWHNIMLSCLSGKPCDKNSGILTRECGNEFAYFYFVSFIFLCSFLMLNLFVAVIMD 1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1788 LLFRSATGEAWHNIMLSCLSGKPCDKNSGIQKPECGNEFAYFYFVSFIFLCSFLMLNLFVAVIMD 1852

Human  1818 NFEYLTRDSSILGPHHLDEYVRVWAEYDPAAWGRMPYLDMYQMLRHMSPPLGLGKKCPARVAYKR 1882
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||:.|.|||.:||.:|||||||||||.|||.||
  Rat  1853 NFEYLTRDSSILGPHHLDEYVRVWAEYDPAACGRIHYKDMYSLLRVISPPLGLGKKCPHRVACKR 1917

Human  1883 LLRMDLPVADDNTVHFNSTLMALIRTALDIKIAKGGADKQQMDAELRKEMMAIWPNLSQKTLDLL 1947
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1918 LLRMDLPVADDNTVHFNSTLMALIRTALDIKIAKGGADKQQMDAELRKEMMAIWPNLSQKTLDLL 1982

Human  1948 VTPHKSTDLTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKLQAMREEQDRTPLMFQRMEPPSPTQEGGPGQNAL 2012
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.||||
  Rat  1983 VTPHKSTDLTVGKIYAAMMIMEYYRQSKAKKLQAMREEQNRTPLMFQRMEPPSPTQEGGPSQNAL 2047

Human  2013 PSTQLDPGGALMAHESGLKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSPEQGPPTDMPNSQPNSQSVEMREMG 2077
            |||||||||.|||.||.:||||||||||||||||||||||||:|||.||||||||||||||||||
  Rat  2048 PSTQLDPGGGLMAQESSMKESPSWVTQRAQEMFQKTGTWSPERGPPIDMPNSQPNSQSVEMREMG 2112

Human  2078 RDGYSDSEHYLPMEGQGRAASMPRLPAENQRRRGRPRGNNLSTISDTSPMKRSASVLGPKARRLD 2142
            .|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  2113 TDGYSDSEHYLPMEGQTRAASMPRLPAENQRRRGRPRGNNLSTISDTSPMKRSASVLGPKARRLD 2177

Human  2143 DYSLERVPPEENQRHHQRRRDRSHRASERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPSKERDQERGR 2207
            ||||||||||||||:|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||
  Rat  2178 DYSLERVPPEENQRYHQRRRDRGHRTSERSLGRYTDVDTGLGTDLSMTTQSGDLPSKDRDQDRGR 2242

Human  2208 PKDRKHRQHHHHHHHHHHPPPPDKDRYAQERPDHGRARARDQRWSRSPSEGREHMAHRQGSSSVS 2272
            |||||||.||||||||||||.||::||||||||.||||||:|||||||||||||..|||||||||
  Rat  2243 PKDRKHRPHHHHHHHHHHPPAPDRERYAQERPDTGRARAREQRWSRSPSEGREHATHRQGSSSVS 2307

Human  2273 GSPAPSTSGTSTPRRGRRQLPQTPSTPRPHVSYSPVIRKAGGSGPPQQQQQQQQQQQQQAVARPG 2337
            ||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
  Rat  2308 GSPAPSTSGTSTPRRGRRQLPQTPCTPRPLVSYSP------------------------------ 2342

Human  2338 RAATSGPRRYPGPTAEPLAGDRPPTGGHSSGRSPRMERRVPGPARSESPRACRHGGARWPASGPH 2402
                 .|||   |.|..:||...|.||                    |||.||. ..||||
  Rat  2343 -----APRR---PAARRMAGPPAPPGG--------------------SPRGCRR-APRWPA---- 2374

Human  2403 VSEGPPGPRHHGYYRGSDYDEADGPGSGGGEEAMAGAYDAPPPVRHASSGATGRSPRTPRASGPA 2467
              ..|.|||.    ||:||.|.|.|     .|...||::..|           ||||||||:|
  Rat  2375 --HAPEGPRP----RGADYTEPDSP-----REPPGGAHEPAP-----------RSPRTPRAAG-- 2415

Human  2468 CASPSRHGRRLPNGYYPAHGLARPRGPGSRKGLHEPYSESDDDWC 2512
            |||| |||||||||||..||..|||  .:|:|.|:.||||:||||
  Rat  2416 CASP-RHGRRLPNGYYAGHGAPRPR--TARRGAHDAYSESEDDWC 2457

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CACNA1A	NP_075461.2	I	85..363		276/277 (100%)
		Ion_trans	97..371	CDD:459842	272/273 (100%)
		Binding to the beta subunit. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P27884	383..400		16/16 (100%)
		II	473..717		243/243 (100%)
		Ion_trans	487..725	CDD:459842	237/237 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	822..1224		271/402 (67%)
		III	1234..1517		280/282 (99%)
		Ion_trans	1247..1478	CDD:459842	228/230 (99%)
		Ion_trans	1568..1827	CDD:459842	252/258 (98%)
		GPHH	1836..1889	CDD:465306	42/52 (81%)
		Ca_chan_IQ	1899..1976	CDD:462591	76/76 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	1994..2037		37/42 (88%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	2049..2512		312/462 (68%)
		PHA03307	2239..>2509	CDD:223039	133/269 (49%)
		polyglutamine repeat	2319..2331		0/11 (0%)
Cacna1a	XP_063133859.1	None