DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment XDH and xdh

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000370.2 Gene:XDH / 7498 HGNCID:12805 Length:1333 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_688983.3 Gene:xdh / 560486 ZFINID:ZDB-GENE-070719-9 Length:1351 Species:Danio rerio


Alignment Length:1344 Identity:916/1344 - (68%)
Similarity:1095/1344 - (81%) Gaps:23/1344 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     4 DKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRLQNKIVHF 68
            |.|||||||:|:.|||||||.|||.||||.|||:||||||.||||||||||:|||...||:|:|:
Zfish    17 DDLVFFVNGKKITEKNADPEITLLTYLRRSLGLTGTKLGCAEGGCGACTVMVSKYHPNQNRIIHY 81

Human    69 SANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNQPE 133
            :.||||||:|||||.||||||||||..::||||||||||:|||||||||||||||||.||||.|:
Zfish    82 AINACLAPLCSLHHCAVTTVEGIGSVASKLHPVQERIAKAHGSQCGFCTPGIVMSMYALLRNNPQ 146

Human   134 PTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNCCM--NQKKDHSVSLSP--S 194
            |||.:|:.||||||||||||||||:|:|||.:|||||||......|||  ...::|..|..|  .
Zfish   147 PTMHDIQEAFQGNLCRCTGYRPILEGYRTFTKDGGCCGGKSQTNGCCMTNGNTQEHENSAHPVQH 211

Human   195 LFKPEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQHPDAKLVV 259
            |:...||.|||||||.||||||:.|....::::||.||||.|||..:|||||:|||.:|:|||||
Zfish   212 LYDQSEFMPLDPTQEIIFPPELVSLSKQTQREMRFVGERVLWIQPCSLKELLELKATYPNAKLVV 276

Human   260 GNTEIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEHGPDGISFGAACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKT 324
            ||||:||||||||:|:|:|:.||:|||||.::|..|||..||:..|:::...|..||.||||.:|
Zfish   277 GNTEVGIEMKFKNLLYPVILAPAYIPELNIIQHTQDGIEVGASVTLTVLGDVLQSAVKKLPAYQT 341

Human   325 EVFRGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNIITASPISDLNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTF 389
            |||:.||||||||||:|:::||:|||||:||||||||||||||:|.|||::|:|.:|.::||..|
Zfish   342 EVFKAVLEQLRWFAGQQIRNVAAVGGNIMTASPISDLNPVFMAAGCKLTVMSKGEKRVLEMDDKF 406

Human   390 FPGYRKTLLSPEEILLSIEIPYSREGEYFSAFKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELAL 454
            |.|||||.|.||||||||||||:::|:|||||||:.|:||||:.||.||.|.||..:..||.:.:
Zfish   407 FTGYRKTALKPEEILLSIEIPYTKKGQYFSAFKQSPRKEDDISIVTCGMNVYFKEQSNTVQSIRI 471

Human   455 CYGGMANRTISALKTTQRQLSKLWKEELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKF 519
            .|||||..|:.|..|..:.|::.|.|:||::.|:.||||:.|.|.||||||.:|.|||:|.|:||
Zfish   472 SYGGMAPVTVLATATCNKLLNRQWNEDLLEEACSSLAEEMSLSPSAPGGMVTYRRTLTISLFYKF 536

Human   520 YLTVLQKLGQE------NLEDKCGKLDPTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPL 578
            :|||..||...      .:||    :.|.|::||.|||.|.|:.|||:||||.||:|:|:||.|:
Zfish   537 FLTVQHKLAVSLQMEGVTVED----IQPEFSTATELFQVDTPSSVQLYQEVPPGQNEDDVVGHPI 597

Human   579 PHLAADMQASGEAVYCDDIPRYENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPG 643
            .||:|..||:||||||||:|.|||||.|.|||||:|||.|||||||.|..|||.|.||||.|:||
Zfish   598 IHLSALKQATGEAVYCDDMPCYENELHLALVTSTKAHALIKSIDTSSAMSVPGVVAFISAKDIPG 662

Human   644 SNITG-ICNDETVFAKDKVTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEEL-PAIITIEDAIKNN 706
            ||:|| :..||||||.|||||||||:||:||||..|.||||:.|||:|||| |.|:||:|||.|.
Zfish   663 SNMTGPVVYDETVFADDKVTCVGHIVGAIVADTQAHAQRAAKVVKISYEELKPVIVTIQDAINNK 727

Human   707 SFYGPELKIEKGDLKKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTM 771
            ||:.|...|||||:.:||.::|:::.||::|||||.|||||:||:|||:||.||||||||||:..
Zfish   728 SFFEPVRTIEKGDVAQGFKDSDHILHGEMHIGGQEQFYLETNCTLAVPRGEDGEMELFVSTQSAS 792

Human   772 KTQSFVAKMLGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCMLDRDEDMLI 836
            |||:.|||.|||||||:|.|||||||||||||:|||::||.||:||.|...|||||||||||||:
Zfish   793 KTQALVAKALGVPANRVVCRVKRMGGGFGGKESRSTILSTVVAVAAQKVKCPVRCMLDRDEDMLV 857

Human   837 TGGRHPFLARYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRL 901
            |||||||..:|||||||.|.|:||||..:||.||:.|||.||:|||||||||.|.||||.|||.:
Zfish   858 TGGRHPFFGQYKVGFMKNGRVMALEVTLYSNAGNSLDLSLSILERALFHMDNSYNIPNICGTGYM 922

Human   902 CKTNLPSNTAFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLYKEGDLTHFNQKLEGFTLP 966
            ||||||||:|||||||||||:|||.|||:||::||:|||||||.|:|.|||||||||:|:.||:.
Zfish   923 CKTNLPSNSAFRGFGGPQGMMIAESWMSDVALSCGLPAEEVRRMNMYNEGDLTHFNQRLDQFTIA 987

Human   967 RCWEECLASSQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGALLHVYTDGSVL 1031
            ||||||:..|.::.||..|:|:|:::.|.||||.|||||||||||..||||||||:|||:|||||
Zfish   988 RCWEECMQLSDFNKRKDAVEKYNRQHRWTKRGLSIIPTKFGISFTAVFLNQAGALVHVYSDGSVL 1052

Human  1032 LTHGGTEMGQGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETSTNTVPNTSPTAASVSADLNGQAVYAACQ 1096
            |||||||||||||||||||||:.|:||.:||:|:||||:|||||||||||.|:||||.|||.|||
Zfish  1053 LTHGGTEMGQGLHTKMVQVASKTLEIPCTKIHITETSTSTVPNTSPTAASASSDLNGMAVYNACQ 1117

Human  1097 TILKRLEPYKKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSLSATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACS 1161
            |||:||:|:|:|||.|.|||||||||.|.|:|||.|||:||:|||.|:||||.||:|||||||.|
Zfish  1118 TILQRLQPFKEKNPKGCWEDWVTAAYFDRVNLSANGFYKTPDLGYDFDTNSGRPFNYFSYGVAVS 1182

Human  1162 EVEIDCLTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPS 1226
            |||||||||.||||.|.||||||.|||||:|||||||.|:|||||||||||.|||:|.|:||||.
Zfish  1183 EVEIDCLTGSHKNLHTSIVMDVGKSLNPALDIGQVEGGFMQGLGLFTLEELRYSPDGYLYTRGPG 1247

Human  1227 TYKIPAFGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQH--TGN 1289
            .|||||||.||.|.:||||||.||.|||::||||||||||||||:|:||||||.||||:.  ||.
Zfish  1248 MYKIPAFGDIPSELKVSLLRDAPNDKAIFSSKAVGEPPLFLAASVFYAIKDAITAARAESGLTGP 1312

Human  1290 NVKELFRLDSPATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSVRV 1333
                 ||||||||||:|||||.||||.||....|....||:|:|
Zfish  1313 -----FRLDSPATPERIRNACEDKFTKLCPPADPGTFIPWAVQV 1351

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
XDHNP_000370.2 PLN02906 23..1319 CDD:215491 895/1309 (68%)
xdhXP_688983.3 PLN02906 36..1336 CDD:215491 894/1308 (68%)

Return to query results.
Submit another query.