DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment XDH and Xdh

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000370.2 Gene:XDH / 7498 HGNCID:12805 Length:1333 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_058850.2 Gene:Xdh / 497811 RGDID:62043 Length:1331 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1333 Identity:1207/1333 - (90%)
Similarity:1279/1333 - (95%) Gaps:2/1333 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MTADKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRLQNKI 65
            ||||:|||||||:||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||:||||||||||
  Rat     1 MTADELVFFVNGKKVVEKNADPETTLLVYLRRKLGLCGTKLGCGEGGCGACTVMISKYDRLQNKI 65

Human    66 VHFSANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRN 130
            ||||.||||||||||||||||||||||:|: :|||||||||:|||||||||||||||||||||||
  Rat    66 VHFSVNACLAPICSLHHVAVTTVEGIGNTQ-KLHPVQERIARSHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRN 129

Human   131 QPEPTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNCCMNQKKDHSVSLSPSL 195
            |||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.||||||||||.||.:|||||||
  Rat   130 QPEPTVEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFAKDGGCCGGSGNNPNCCMNQTKDQTVSLSPSL 194

Human   196 FKPEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQHPDAKLVVG 260
            |.||:|.|||||||||||||||||||||:|:|||||||||||||||::|||||||||||||||||
  Rat   195 FNPEDFKPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPQKKLRFEGERVTWIQASTMEELLDLKAQHPDAKLVVG 259

Human   261 NTEIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEHGPDGISFGAACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKTE 325
            ||||||||||||||||:|||||||||||||.|||:||||||:||||:||..|.:.:||||.||||
  Rat   260 NTEIGIEMKFKNMLFPLIVCPAWIPELNSVVHGPEGISFGASCPLSLVESVLAEEIAKLPEQKTE 324

Human   326 VFRGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNIITASPISDLNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTFF 390
            |||||:||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   325 VFRGVMEQLRWFAGKQVKSVASIGGNIITASPISDLNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVRMDHTFF 389

Human   391 PGYRKTLLSPEEILLSIEIPYSREGEYFSAFKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELALC 455
            ||||||||.|||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||||:||
  Rat   390 PGYRKTLLRPEEILLSIEIPYSKEGEFFSAFKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTIEVQELSLC 454

Human   456 YGGMANRTISALKTTQRQLSKLWKEELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKFY 520
            :||||:|||||||||.:||||.|.|||||.|||||||||||.||||||||:||.|||||||||||
  Rat   455 FGGMADRTISALKTTPKQLSKSWNEELLQSVCAGLAEELHLAPDAPGGMVEFRRTLTLSFFFKFY 519

Human   521 LTVLQKLGQENLEDKCGKLDPTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPLPHLAADM 585
            ||||||||:.:|||.|||||||||||||||||||||:|||||||||.||||||||||||||||:|
  Rat   520 LTVLQKLGRADLEDMCGKLDPTFASATLLFQKDPPANVQLFQEVPKDQSEEDMVGRPLPHLAANM 584

Human   586 QASGEAVYCDDIPRYENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPGSNITGIC 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||::|:|||.||.||:.
  Rat   585 QASGEAVYCDDIPRYENELSLRLVTSTRAHAKITSIDTSEAKKVPGFVCFLTAEDVPNSNATGLF 649

Human   651 NDETVFAKDKVTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEELPAIITIEDAIKNNSFYGPELKI 715
            |||||||||:||||||||||||||||||.||||:|||||||:|||||||:|||.||||||.|:||
  Rat   650 NDETVFAKDEVTCVGHIIGAVVADTPEHAQRAARGVKITYEDLPAIITIQDAINNNSFYGSEIKI 714

Human   716 EKGDLKKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTMKTQSFVAKM 780
            |||||||||||||||||||:||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   715 EKGDLKKGFSEADNVVSGELYIGGQEHFYLETNCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTMKTQSFVAKM 779

Human   781 LGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGRHPFLA 845
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   780 LGVPDNRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAHKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGRHPFLA 844

Human   846 RYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLPSNT 910
            :||||||||||||||||.||||.|||:|||:||||||||||||.|||||||||||:|||||||||
  Rat   845 KYKVGFMKTGTVVALEVAHFSNGGNTEDLSRSIMERALFHMDNAYKIPNIRGTGRICKTNLPSNT 909

Human   911 AFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLYKEGDLTHFNQKLEGFTLPRCWEECLAS 975
            |||||||||||||||.||||||:|||:|||||||||:||||||||||||||||||||||:||:||
  Rat   910 AFRGFGGPQGMLIAEYWMSEVAITCGLPAEEVRRKNMYKEGDLTHFNQKLEGFTLPRCWDECIAS 974

Human   976 SQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGALLHVYTDGSVLLTHGGTEMG 1040
            |||.|||.||:|||:|||||||||||||||||||||:|||||.|||:||||||||||||||||||
  Rat   975 SQYLARKREVEKFNRENCWKKRGLCIIPTKFGISFTLPFLNQGGALVHVYTDGSVLLTHGGTEMG 1039

Human  1041 QGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETSTNTVPNTSPTAASVSADLNGQAVYAACQTILKRLEPY 1105
            ||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||:
  Rat  1040 QGLHTKMVQVASRALKIPTSKIHISETSTNTVPNTSPTAASASADLNGQAVYEACQTILKRLEPF 1104

Human  1106 KKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSLSATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTG 1170
            |||.|:|.||.||..||...|||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1105 KKKKPNGPWEAWVMDAYTSAVSLSATGFYKTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDCLTG 1169

Human  1171 DHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGS 1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1170 DHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTMEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPAFGS 1234

Human  1236 IPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQHTGNNVKELFRLDSP 1300
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||||| |:|.|:||:||||
  Rat  1235 IPIEFRVSLLRDCPNKRAIYASKAVGEPPLFLASSIFFAIKDAIRAARAQH-GDNAKQLFQLDSP 1298

Human  1301 ATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSVRV 1333
            ||||||||||||:||||||||||||||.||||:
  Rat  1299 ATPEKIRNACVDQFTTLCVTGVPENCKSWSVRI 1331

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
XDHNP_000370.2 PLN02906 23..1319 CDD:215491 1173/1295 (91%)
XdhNP_058850.2 PLN02906 23..1317 CDD:215491 1173/1295 (91%)

Return to query results.
Submit another query.