DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment XDH and xdh

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_000370.2 Gene:XDH / 7498 HGNCID:12805 Length:1333 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031758260.1 Gene:xdh / 100497499 XenbaseID:XB-GENE-956800 Length:1335 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1336 Identity:933/1336 - (69%)
Similarity:1101/1336 - (82%) Gaps:14/1336 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     4 DKLVFFVNGRKVVEKNADPETTLLAYLRRKLGLSGTKLGCGEGGCGACTVMLSKYDRLQNKIVHF 68
            |:|:|||||:||:||||||..|||.||||||||.|||||||||||||||||:|::::.|::|:|:
 Frog     8 DQLLFFVNGKKVIEKNADPGMTLLTYLRRKLGLPGTKLGCGEGGCGACTVMVSRFNQFQDRILHY 72

Human    69 SANACLAPICSLHHVAVTTVEGIGSTKTRLHPVQERIAKSHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNQPE 133
            |.||||||||||||.||||||||||:||||||:|||||||||||||||||||||||||||||.||
 Frog    73 SVNACLAPICSLHHTAVTTVEGIGSSKTRLHPIQERIAKSHGSQCGFCTPGIVMSMYTLLRNTPE 137

Human   134 PTMEEIENAFQGNLCRCTGYRPILQGFRTFARDGGCCGGDGNNPNCCMNQKK-DHSVSLSPSLFK 197
            |||::|:|||||||||||||||||:||:||.:: ||||....| .||.:..: :..:|:|.:||.
 Frog   138 PTMDDIDNAFQGNLCRCTGYRPILEGFKTFTKE-GCCGNKTEN-GCCRDMNRVNEDISVSSALFD 200

Human   198 PEEFTPLDPTQEPIFPPELLRLKDTPRKQLRFEGERVTWIQASTLKELLDLKAQHPDAKLVVGNT 262
            |.||.|||||||.|||||||..|::|.|.|.|:|..|||:|.|.|:|||.||||:||||||||||
 Frog   201 PSEFRPLDPTQEVIFPPELLIYKNSPPKSLCFKGGNVTWLQPSNLEELLALKAQYPDAKLVVGNT 265

Human   263 EIGIEMKFKNMLFPMIVCPAWIPELNSVEHGPDGISFGAACPLSIVEKTLVDAVAKLPAQKTEVF 327
            |:|||.|||||.:|:|:.|..:|:||.:||..:||.|||||.|:.:|:.|..|||.||..:||||
 Frog   266 EVGIETKFKNMHYPVIIAPGLVPDLNIIEHKEEGIYFGAACSLATMEEVLRKAVAHLPDYQTEVF 330

Human   328 RGVLEQLRWFAGKQVKSVASVGGNIITASPISDLNPVFMASGAKLTLVSRGTRRTVQMDHTFFPG 392
            ||.|||||||||:|:::||::||||:||||||||||||||||.||.:.|:...|.|:||.|||.|
 Frog   331 RGALEQLRWFAGQQIRNVAAIGGNIMTASPISDLNPVFMASGTKLYIFSKDGNRMVKMDGTFFTG 395

Human   393 YRKTLLSPEEILLSIEIPYSREGEYFSAFKQASRREDDIAKVTSGMRVLFKPGTTEVQELALCYG 457
            ||:|:|.|||||||||||||::.|||||||||||||||||.||||||||||.|:.:|:.:.|.||
 Frog   396 YRRTILRPEEILLSIEIPYSKKWEYFSAFKQASRREDDIAIVTSGMRVLFKAGSPQVESIQLSYG 460

Human   458 GMANRTISALKTTQRQLSKLWKEELLQDVCAGLAEELHLPPDAPGGMVDFRCTLTLSFFFKFYLT 522
            |||..|:.|..|......|.|.::|||..|..||:|:.|.|..|||||::|.||.||||||||||
 Frog   461 GMAPITVMAKNTCTELAGKYWDDKLLQSACRLLAKEMALSPSVPGGMVEYRQTLALSFFFKFYLT 525

Human   523 VLQKL-----GQENLEDKCGKLDPTFASATLLFQKDPPADVQLFQEVPKGQSEEDMVGRPLPHLA 582
            |.:||     |..|..:   .|.|...|||.||.|..|..|||:|||||||.||||||||:.||:
 Frog   526 VHKKLALDLNGNNNFAE---TLSPKDESATELFHKSHPCSVQLYQEVPKGQKEEDMVGRPMVHLS 587

Human   583 ADMQASGEAVYCDDIPRYENELSLRLVTSTRAHAKIKSIDTSEAKKVPGFVCFISADDVPGSNIT 647
            |..||:||||||||:|.|||||.|.|:|||:|||:|.||||.||...||||.|:.|:||||||:|
 Frog   588 AIKQATGEAVYCDDMPLYENELYLVLITSTKAHARIISIDTEEAALTPGFVRFLFANDVPGSNVT 652

Human   648 GICNDETVFAKDKVTCVGHIIGAVVADTPEHTQRAAQGVKITYEELPAIITIEDAIKNNSFYGPE 712
            |..:|||:||:|.||||||:||.|||||.|:.||||:.||:.||||..||||::||:..||:.|.
 Frog   653 GFAHDETIFAEDLVTCVGHVIGGVVADTQENAQRAAKRVKVLYEELTPIITIQEAIEQESFHQPI 717

Human   713 LKIEKGDLKKGFSEADNVVSGEIYIGGQEHFYLETHCTIAVPKGEAGEMELFVSTQNTMKTQSFV 777
            .|:|.||::|||.||:::|.|||||||||||||||:|:|||||.|.|||||||||||..|||:.|
 Frog   718 KKMEDGDIEKGFKEAEHIVEGEIYIGGQEHFYLETNCSIAVPKEEDGEMELFVSTQNATKTQNCV 782

Human   778 AKMLGVPANRIVVRVKRMGGGFGGKETRSTVVSTAVALAAYKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGRHP 842
            |..|||.:|:||||||||||||||||:|||:|||::|:||:||||||||||||||||||||||||
 Frog   783 AHALGVSSNKIVVRVKRMGGGFGGKESRSTIVSTSIAVAAHKTGRPVRCMLDRDEDMLITGGRHP 847

Human   843 FLARYKVGFMKTGTVVALEVDHFSNVGNTQDLSQSIMERALFHMDNCYKIPNIRGTGRLCKTNLP 907
            :|.||||||||.|.:.||:|.:::|.||:.|||..|::|.||||||.||||||||.|.|||||||
 Frog   848 YLGRYKVGFMKNGKITALDVSYYANAGNSVDLSHGIIDRTLFHMDNAYKIPNIRGRGYLCKTNLP 912

Human   908 SNTAFRGFGGPQGMLIAECWMSEVAVTCGMPAEEVRRKNLYKEGDLTHFNQKLEGFTLPRCWEEC 972
            |||||||||||||||:||.||:.:..|||:|||:||..|:|.|||||||.|:||..|:.||||||
 Frog   913 SNTAFRGFGGPQGMLVAEAWMNHIVQTCGLPAEQVRELNMYSEGDLTHFTQQLESCTVRRCWEEC 977

Human   973 LASSQYHARKSEVDKFNKENCWKKRGLCIIPTKFGISFTVPFLNQAGALLHVYTDGSVLLTHGGT 1037
            |..:.||.||..:::||:::.|||||:.||||||||||||.||||:|||:|||||||||||||||
 Frog   978 LKQANYHERKRSIEEFNRQHRWKKRGIAIIPTKFGISFTVAFLNQSGALVHVYTDGSVLLTHGGT 1042

Human  1038 EMGQGLHTKMVQVASRALKIPTSKIYISETSTNTVPNTSPTAASVSADLNGQAVYAACQTILKRL 1102
            |||||||||||||||:||.||||:|:||||||||||||||||||||:||||.|::.|||.||:||
 Frog  1043 EMGQGLHTKMVQVASKALGIPTSRIFISETSTNTVPNTSPTAASVSSDLNGMAIFNACQKILQRL 1107

Human  1103 EPYKKKNPSGSWEDWVTAAYMDTVSLSATGFYRTPNLGYSFETNSGNPFHYFSYGVACSEVEIDC 1167
            |||:..||:|.||.|::|||:|.|:|||||||:.|.:||..|.|.|.|.:|||||||||||||||
 Frog  1108 EPYRNSNPNGPWESWISAAYLDRVNLSATGFYKIPGIGYDMEKNEGRPSNYFSYGVACSEVEIDC 1172

Human  1168 LTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELHYSPEGSLHTRGPSTYKIPA 1232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||:|.|:||||..|||||
 Frog  1173 LTGDHKNLRTDIVMDVGSSLNPAIDIGQVEGAFVQGLGLFTLEELKYSPDGILYTRGPGMYKIPA 1237

Human  1233 FGSIPIEFRVSLLRDCPNKKAIYASKAVGEPPLFLAASIFFAIKDAIRAARAQHTGNNVKELFRL 1297
            ||.|||||.|||||:|||.||||:|||||||||||::|||||||:||.||||:   :.:...|||
 Frog  1238 FGDIPIEFNVSLLRNCPNSKAIYSSKAVGEPPLFLSSSIFFAIKEAIMAARAE---SGITGAFRL 1299

Human  1298 DSPATPEKIRNACVDKFTTLCVTGVPENCKPWSVRV 1333
            |||||||:|||||||.||.|.....|....||::||
 Frog  1300 DSPATPERIRNACVDDFTKLIPVPEPGTFLPWAIRV 1335

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
XDHNP_000370.2 PLN02906 23..1319 CDD:215491 913/1301 (70%)
xdhXP_031758260.1 PLN02906 28..1318 CDD:215491 911/1297 (70%)

Return to query results.
Submit another query.