DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment NSD2 and nsd2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001427822.1 Gene:NSD2 / 7468 HGNCID:12766 Length:1398 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002936809.1 Gene:nsd2 / 100125213 XenbaseID:XB-GENE-988824 Length:1298 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1374 Identity:911/1374 - (66%)
Similarity:1071/1374 - (77%) Gaps:78/1374 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human    21 MKQAPEILGSANGKTPSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDALPFIPADKLKDLTSR 85
            |||.|.||||...|..:.||:|||||.|.:||:|:||||||:||.||||:|||||.:||||||||
 Frog     1 MKQVPHILGSPAVKPSNPEVSRECSVLLGRAQISASLQEGVIQKLNGHDSLPFIPTEKLKDLTSR 65

Human    86 VFNGEPGAHDAKLRFESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAAD 150
            |||||.||.:||:|||:||::||.|||:|||.|||||||||||||||||||||||||||||    
 Frog    66 VFNGESGAQEAKVRFEAQEVQGIETPPSTTPTKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGD---- 126

Human   151 VSQSEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVSKISSPSDKKVFRRRCVRGHVTLSSE 215
              :.||..|..:.|::|.|||.|                  |:|.:::|           :.|..
 Frog   127 --RGEEEPQPEQKKSKRGRKRKI------------------ITSEANEK-----------SSSEM 160

Human   216 HGHPMRAPARVLGRAEKIPAKKESCPNTGRDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLH 280
            ..|...:..:.:..:|.:..|.:        :|..|||:|||:|||||||||||||||::||:|:
 Frog   161 PSHSESSKMKPVSESEFLEHKNK--------EDFSLKYSVGDVVWSKVSGYPWWPCMVTSDPVLY 217

Human   281 SYTKLKGQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLK 345
            |:||:|||||:.|||||||||:|||||||.|||:|.|:||.:::.|||||||||||||||.||||
 Frog   218 SHTKVKGQKKNVRQYHVQFFGNAPERAWISEKSMVPFKGENEYDHLCQESAKQAPTKAEKTKLLK 282

Human   346 PISGKLRAQWEMGIVQAEEAASMSVEERKAKFTFLYVGDQLHLNPQVAKEAGIAAESLGEMAESS 410
            ||:||:||||::||.||:|...|:.||||.||||:|:.|:..|||:||.|.|:..||        
 Frog   283 PITGKIRAQWDIGIEQAKEGILMTPEERKEKFTFIYIKDRPQLNPRVASEVGVPVES-------- 339

Human   411 GVSEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQKTAE--ADPRRGVGSPPG 473
              ||::.|:|:  :|.....||||.::  :.|.:.|..| ..|:|..|..|  :|| :|:.||..
 Frog   340 --SEKSTESPQ--KEGSSSYKRRRVSR--TPAASKEVDP-ADKTTTAKGPENSSDP-KGMTSPAS 396

Human   474 RKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFCQKHRDEVVAEHPDASGEEIEELLRSQWSLLSEKQRARYNTK 538
            :|::....||||||||.:|||||||||:|||:.||||||.|||||||.|||::||.||:||||||
 Frog   397 KKRSGAYTPRSRKGDAVNQFLVFCQKHKDEVINEHPDASDEEIEELLESQWNMLSNKQKARYNTK 461

Human   539 FALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPTEDAEAEDTPRKRLRTDKHSLRKRDTITDKTARTS 603
            ||::...::|||||:::|.||||.|...:.|||:|.:::||||||  .|:.::|:|.....||  
 Frog   462 FAILTSPKSEEDSGSLHGHKRNHLKTTHNQTEDSEIQESPRKRLR--MHNRKQRETCKPPKAR-- 522

Human   604 SYKAMEAASSLKSQAATKNLSDACKPLKKRNRASTAASSALGFSKSSSPSASLTENEVSDSPGDE 668
                  |::.:|:..|..:|||||||||||||:||..|.||..|||||| |||||||||||.|||
 Frog   523 ------ASAPVKNSPAMFSLSDACKPLKKRNRSSTLGSVALPVSKSSSP-ASLTENEVSDSQGDE 580

Human   669 PSESPYESADETQTEVSVSSKKSERGVTAKKEYVCQLCEKPGSLLLCEGPCCGAFHLACLGLSRR 733
            .||||.|||||:|.|:|:..:||||| ..|||.|||:|||.|.|:||||.||.||||:|:|||.|
 Frog   581 RSESPSESADESQAEISMLHRKSERG-AMKKELVCQVCEKVGDLMLCEGVCCSAFHLSCIGLSTR 644

Human   734 PEGRFTCSECASGIHSCFVCKESKTDVKRCVVTQCGKFYHEACVKKYPLTVFESRGFRCPLHSCV 798
            |.|::.|.||.||..|||:||||..|||||:|..|||||||:|::||||.||||||||||||.|.
 Frog   645 PAGKYLCKECTSGARSCFLCKESNRDVKRCIVPHCGKFYHESCLRKYPLAVFESRGFRCPLHRCA 709

Human   799 SCHASNPSNPRPSKGKMMRCVRCPVAYHSGDACLAAGCSVIASNSIICTAHFTARKGKRHHAHVN 863
            :|:.|||||||.|||||:||||||:|||..::|:.|||:.:.|.||||::||.|.|.|.||||:|
 Frog   710 TCYFSNPSNPRASKGKMVRCVRCPLAYHGAESCIVAGCTALTSTSIICSSHFAANKAKSHHAHIN 774

Human   864 VSWCFVCSKGGSLLCCESCPAAFHPDCLNIEMPDGSWFCNDCRAGKKLHFQDIIWVKLGNYRWWP 928
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||..|.||||||||||||||
 Frog   775 VSWCFVCSNGGSLLCCESCPAAFHPDCLNIEMPDGSWFCNDCRLGKKPRFNDIIWVKLGNYRWWP 839

Human   929 AEVCHPKNVPPNIQKMKHEIGEFPVFFFGSKDYYWTHQARVFPYMEGDRGSRYQGVRGIGRVFKN 993
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||::.|.:.||:||||
 Frog   840 AEVCHPKNVPPNIQKMKHAIGEFPVFFFGSKDYYWTHQARVFPYMEGDRGSKHHGGKSIGKVFKN 904

Human   994 ALQEAEARFREIKLQREARETQESERKPPPYKHIKVNKPYGKVQIYTADISEIPKCNCKPTDENP 1058
            ||||||.||.||..||||:.|||:|:||||||||||||||||||:|||||||||||||||:.|.|
 Frog   905 ALQEAETRFCEIMRQREAKVTQENEKKPPPYKHIKVNKPYGKVQVYTADISEIPKCNCKPSSEKP 969

Human  1059 CGFDSECLNRMLMFECHPQVCPAGEFCQNQCFTKRQYPETKIIKTDGKGWGLVAKRDIRKGEFVN 1123
            |||||||||||||:||||||||||:.||||||.||||||||||||:||||||:|.|||:||||||
 Frog   970 CGFDSECLNRMLMYECHPQVCPAGDRCQNQCFNKRQYPETKIIKTEGKGWGLIATRDIKKGEFVN 1034

Human  1124 EYVGELIDEEECMARIKHAHENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCQPNCETLKWTV 1188
            ||:||||||||||.||:||.|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||.||:|
 Frog  1035 EYIGELIDEEECMYRIRHAQENDITHFYMLTIDKDRIIDAGPKGNFSRFMNHSCQPNCETQKWSV 1099

Human  1189 NGDTRVGLFAVCDIPAGTELTFNYNLDCLGNEKTVCRCGASNCSGFLGDRPKTSTTLSSEEKGKK 1253
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||:|||||.|||||||||||.:|..|.|||.||
 Frog  1100 NGDTRVGLFAVRDIPAGEELTFNYNLDCLGNEKTICRCGAPNCSGFLGDRPKNNTASSHEEKVKK 1164

Human  1254 TKKKTRRRRAKGEGKRQSEDECFRCGDGGQLVLCDRKFCTKAYHLSCLGLGKRPFGKWECPWHHC 1318
            .|||.::||.|.:||:||||.||||.|||:||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
 Frog  1165 PKKKQKKRRTKTDGKKQSEDYCFRCNDGGELVLCDRKFCTKAYHLSCLSLTKRPFGKWECPWHHC 1229

Human  1319 DVCGKPSTSFCHLCPNSFCKEHQDGTAFSCTPDGRSYCCEHDLGAASVRSTKTEKPPPEPGKPKG 1383
            |||||.|.|.|.||||||||.|.|.:.|:.|.:|:..|.||| ...||.....:..|    |.|.
 Frog  1230 DVCGKASVSCCSLCPNSFCKGHYDDSQFTRTAEGQLCCPEHD-PEESVECEVVKNLP----KKKA 1289

Human  1384 KRRRRRGWR 1392
            |:|:.:..|
 Frog  1290 KQRKNKKTR 1298

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
NSD2NP_001427822.1 None
nsd2XP_002936809.1 PWWP_NSD2_rpt1 190..317 CDD:438990 93/126 (74%)
HMG-box_NSD2 408..469 CDD:438807 45/60 (75%)
TNG2 <484..654 CDD:227367 104/181 (57%)
PHD1_NSD1_2 613..655 CDD:277118 27/41 (66%)
PHD2_NSD2 660..706 CDD:277121 35/45 (78%)
PHD3_NSD2 707..760 CDD:277124 32/52 (62%)
PHD4_NSD2 777..817 CDD:277127 38/39 (97%)
PWWP_NSD2_rpt2 823..918 CDD:438993 82/94 (87%)
AWS 967..1004 CDD:465559 31/36 (86%)
SET_NSD2 1006..1147 CDD:380988 125/140 (89%)
PHD5_NSD2 1185..1227 CDD:277130 36/41 (88%)
C5HCH 1226..1273 CDD:465605 29/47 (62%)

Return to query results.
Submit another query.