Protein Alignment VCP and vcp

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_009057.1
• Gene: VCP / 7415
• HGNCID: 12666
• Length: 806
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_958889.1
• Gene: vcp / 327197
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-5408
• Length: 806
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 806
• Identity: 780/806 - (96%)
• Similarity: 796/806 - (98%)
• Gaps: 0/806 - (0%)

Human     1 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRR 65
            ||||.:||.|||||||||||||||||||||:||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Zfish     1 MASGGESKNDDLSTAILKQKNRPNRLIVDESINEDNSVVSLSQAKMDELQLFRGDTVLLKGKKRR 65

Human    66 EAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNL 130
            |.||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 ETVCIVLSDDTCSDEKVRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNL 130

Human   131 FEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   131 FEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEE 195

Human   196 ESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVAN 260
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   196 ESLNEVGYDDIGGVRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVAN 260

Human   261 ETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIV 325
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Zfish   261 ETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIV 325

Human   326 SQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   326 SQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL 390

Human   391 ADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWA 455
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Zfish   391 ADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWA 455

Human   456 LSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPP 520
            |||||||||||||||||.:||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   456 LSQSNPSALRETVVEVPNITWEDIGGLDDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPP 520

Human   521 GCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKA 585
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Zfish   521 GCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKA 585

Human   586 RGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDE 650
            ||||:||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   586 RGGNVGDGGGAADRVINQILTEMDGMSSKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDE 650

Human   651 KSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQT 715
            |||:|||||||||||::|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||
Zfish   651 KSRIAILKANLRKSPISKDVDLDFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIENEIRRERERQT 715

Human   716 NPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGG 780
            |||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Zfish   716 NPSAMEVEEDDPVPEIRKDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSSNQGG 780

Human   781 AGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG 806
            :||||||.||.||:|:.|||||||||
Zfish   781 SGPSQGSSGGGGGNVFNEDNDDDLYG 806

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
VCP	NP_009057.1	CDC48	25..764	CDD:273521	722/738 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	708..727		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	768..806		30/37 (81%)
		Interaction with UBXN6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18656546	797..806		7/8 (88%)
		PIM motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24726327	802..806		3/3 (100%)
vcp	NP_958889.1	CDC48	25..764	CDD:273521	722/738 (98%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	708..727		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	768..806		30/37 (81%)