Protein Alignment VCP and Vcp

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_009057.1
• Gene: VCP / 7415
• HGNCID: 12666
• Length: 806
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_446316.1
• Gene: Vcp / 116643
• RGDID: 621595
• Length: 806
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 806
• Identity: 805/806 - (99%)
• Similarity: 806/806 - (100%)
• Gaps: 0/806 - (0%)

Human     1 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRR 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRR 65

Human    66 EAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNL 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 EAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNL 130

Human   131 FEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEE 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 FEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEE 195

Human   196 ESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVAN 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 ESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVAN 260

Human   261 ETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIV 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 ETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIV 325

Human   326 SQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 SQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKL 390

Human   391 ADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 ADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWA 455

Human   456 LSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPP 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 LSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPP 520

Human   521 GCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKA 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 GCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKA 585

Human   586 RGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDE 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 RGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDE 650

Human   651 KSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQT 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   651 KSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQT 715

Human   716 NPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGG 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 NPSAMEVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGG 780

Human   781 AGPSQGSGGGTGGSVYTEDNDDDLYG 806
            |||||||||||||:||||||||||||
  Rat   781 AGPSQGSGGGTGGNVYTEDNDDDLYG 806

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
VCP	NP_009057.1	CDC48	25..764	CDD:273521	738/738 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	708..727		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	768..806		36/37 (97%)
		Interaction with UBXN6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18656546	797..806		8/8 (100%)
		PIM motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24726327	802..806		3/3 (100%)
Vcp	NP_446316.1	CDC48	25..764	CDD:273521	738/738 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	708..727		18/18 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	768..806		36/37 (97%)
		Interaction with UBXN6. /evidence=ECO:0000250	797..806		8/8 (100%)
		PIM motif. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P55072	802..806		3/3 (100%)