Protein Alignment VCL and Vcl

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_054706.1
• Gene: VCL / 7414
• HGNCID: 12665
• Length: 1134
• Species: Homo sapiens
• Sequence 2: NP_001418328.1
• Gene: Vcl / 305679
• RGDID: 1311217
• Length: 1134
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 1134
• Identity: 1115/1134 - (98%)
• Similarity: 1125/1134 - (99%)
• Gaps: 0/1134 - (0%)

Human     1 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTT 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTT 65

Human    66 EDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAE 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 EDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAE 130

Human   131 VRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSM 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 VRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSM 195

Human   196 NTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWAS 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 NTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVGKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWAS 260

Human   261 KDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTC 325
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 KDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPNASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELCAGKERREILGTC 325

Human   326 KMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDA 390
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 KMLGQMTDQVADLRARGQGASPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDA 390

Human   391 AQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGD 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||.|||||||||
  Rat   391 AQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEIAALTSKLGDLRRQGKGD 455

Human   456 SPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIR 520
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  Rat   456 SPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIR 520

Human   521 GLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKA 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
  Rat   521 GLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLAAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKT 585

Human   586 RMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAV 650
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   586 QMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGRLGATAEKAAAV 650

Human   651 GTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDE 715
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  Rat   651 GAANKSTVEGIQASVKTARELTPQVISAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDE 715

Human   716 AIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR 780
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  Rat   716 AIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR 780

Human   781 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPP 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   781 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPP 845

Human   846 PPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEAR 910
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  Rat   846 PPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEAR 910

Human   911 KWSSKPGIPAAEVGIGVVAEADAADAAGFPVPPDMEDDYEPELLLMPSNQPVNQPILAAAQSLHR 975
            |||||||:|||:||||||||||||||.|||.|.|||||.||||||:|:|||||||||||||||||
  Rat   911 KWSSKPGLPAAQVGIGVVAEADAADAVGFPFPSDMEDDSEPELLLVPANQPVNQPILAAAQSLHR 975

Human   976 EATKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQC 1040
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  Rat   976 EATKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQC 1040

Human  1041 TDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKET 1105
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  Rat  1041 TDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKET 1105

Human  1106 VREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ 1134
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  Rat  1106 VREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ 1134

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
VCL	NP_054706.1	N-terminal globular head. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20484056	1..835		822/833 (99%)
		Vinculin	3..1134	CDD:460040	1111/1130 (98%)
		Talin-interaction. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P12003	168..208		39/39 (100%)
		3 X 112 AA tandem repeats. /evidence=ECO:0000255	259..589		322/329 (98%)
		Interaction with ACTN4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:15988023, ECO:0007744|PDB:1YDI	741..764		22/22 (100%)
		Linker (Pro-rich). /evidence=ECO:0000269|PubMed:20484056	836..878		41/41 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	857..887		29/29 (100%)
		C-terminal tail. /evidence=ECO:0000269|PubMed:20484056	879..1134		246/254 (97%)
		Facilitates phospholipid membrane insertion. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q64727	1003..1046		42/42 (100%)
		Facilitates phospholipid membrane insertion. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q64727	1120..1134		13/13 (100%)
Vcl	NP_001418328.1	Vinculin	3..1134	CDD:460040	1111/1130 (98%)