DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment UVRAG and Uvrag

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001373600.1 Gene:UVRAG / 7405 HGNCID:12640 Length:725 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001388471.1 Gene:Uvrag / 308846 RGDID:1589754 Length:698 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:725 Identity:620/725 - (85%)
Similarity:644/725 - (88%) Gaps:27/725 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSASASVGGPVPQPPPGPAAALPPGSAARALHVELPSQQRRLRHLRNIAARNIVNRNGHQLLDTY 65
            ||:.||:|||||.|||||:|||.||:..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MSSCASLGGPVPLPPPGPSAALTPGAPTRALHVELPSQQRRLRHLRNIAARNIVNRNGHQLLDTY 65

Human    66 FTLHLCSTEKIYKEFYRSEVIKNSLNPTWRSLDFGIMPDRLDTSVSCFVVKIWGGKENIYQLLIE 130
            ||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
  Rat    66 FTLHLCDNEKICKEFYRSEVIKNSLNPTWRSLDFGIMPDRLDTSVSCFVVKIWGGKEEAYQLLIE 130

Human   131 WKVCLDGLKYLGQQIHARNQNEIIFGLNDGYYGAPFEHKGYSNAQKTILLQVDQNCVRNSYDVFS 195
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.:.||||. |||||||||||||||||
  Rat   131 WKVYLDGLKYLGQQIHARNQNEIIFGLNDGYYGAPFEHKAHPNAQKN-LLQVDQNCVRNSYDVFS 194

Human   196 LLRLHRAQCAIKQTQVTVQKIGKEIEEKLRLTSTSNELKKKSECLQLKILVLQNELERQKKALGR 260
            |||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||:||||:||||||:||||||||||||
  Rat   195 LLRLHRAQCAIKQTQVTVQRIGKEIEEKLRLTSTSNELKKESECLRLKILVLRNELERQKKALGR 259

Human   261 EVALLHKQQIALQDKGSAFSAEHLKLQLQKESLNELRKECTAKRELFLKTNAQLTIRCRQLLSEL 325
            |||.|||||:|||||||||:|||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   260 EVAFLHKQQMALQDKGSAFAAEHAKLQLQKESLRELRKECTAKRELFLKTNAQLTIRCRQLLSEL 324

Human   326 SYIYPIDLNEHKDYFVCGVKLPNSEDFQAKDDGSIAVALGYTAHLVSMISFFLQVPLRYPIIHKG 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   325 SYIYPIDLNEHKDYFVCGVKLPNSEDFQAKDDGSIAVALGYTAHLVSMISFFLQVPLRYPIIHKG 389

Human   391 SRSTIKDNINDKLTEKEREFPLYPKGGEKLQFDYGVYLLNKNIAQLRYQHGLGTPDLRQTLPNLK 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   390 SRSTIKDNINDKLTEKEREFPLYPKGGEKLQFDYGVYLLNKNIAQLRYQHGLGTPDLRQTLPNLK 454

Human   456 NFMEHGLMVRCIKPQMSCFQFGAKPSWKRQPLTGNGCDRHHTSSAIPVPKRQSSIFGGADVGFSG 520
            ||||||||||                          |||||.||||||||||||.|.|||||.|.
  Rat   455 NFMEHGLMVR--------------------------CDRHHISSAIPVPKRQSSTFRGADVGLST 493

Human   521 GIPSPDKGHRKRASSENERLQYKTPPPSYNSALAQPVTTVPSMGETERKITSLSSSLDTSLDFSK 585
            |:||||..|||||||||||||||||||||||||.|....:|::|::|||:|.|||||||||||||
  Rat   494 GVPSPDNVHRKRASSENERLQYKTPPPSYNSALTQHGVAMPTLGDSERKVTPLSSSLDTSLDFSK 558

Human   586 ENKKKGEDLVGSLNGGHANVHPSQEQGEALSGHRATVNGTLLPSEQAGSASVQLPGEFHPVSEAE 650
            |:||.|.||..|::|.|.||..||||||||.||.||:|||.|||||.|.|...|||..||...||
  Rat   559 ESKKTGVDLGNSVSGDHRNVDSSQEQGEALPGHLATINGTALPSEQPGPAGTLLPGLCHPAPSAE 623

Human   651 LCCTVEQAEEIIGLEATGFASGDQLEAFNCIPVDSAVAVECDEQVLGEFEEFSRRIYALNENVSS 715
            |||.|||||||||||||||.|||||||.:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
  Rat   624 LCCAVEQAEEIIGLEATGFTSGDQLEALSCIPVDSAVAVECDEQVLGEFEEFSRRIYALSENVSS 688

Human   716 FRRPRRSSDK 725
            ||||||||||
  Rat   689 FRRPRRSSDK 698

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
UVRAGNP_001373600.1 VPS38 39..437 CDD:435943 377/397 (95%)
UvragNP_001388471.1 VPS38 39..436 CDD:435943 377/397 (95%)

Return to query results.
Submit another query.