Protein Alignment Ir94d and Ekar

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001138099.1
• Gene: Ir94d / 7354412
• FlyBaseID: FBgn0259193
• Length: 593
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001036250.1
• Gene: Ekar / 43806
• FlyBaseID: FBgn0039916
• Length: 899
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 727
• Identity: 137/727 - (18%)
• Similarity: 257/727 - (35%)
• Gaps: 191/727 - (26%)

  Fly     2 GQLHLLLVALVLLSPGGDSFYHSLIHHLNRELKIEYVLLLGNF------------DTTWLDILWQ 54
            |.||.....::.|.....||:..:  |:.:..:..||..|..|            ::..:.||.:
  Fly   150 GILHEKENGIINLHQLSRSFHGEV--HMRQVSRDSYVSALNEFKGKEIHNIIIDTNSNGISILLK 212

  Fly    55 --LPVSVLQIKEH------SRETYSLLENPSHNVLTIA---FVNDSPEDILEIL----------- 97
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  Fly   213 NILQQQMNEYKYHYLFTSFDLETYD-LEDFKYNFVNITSFRLVDTADVGVKQILKDIGLYSHHIF 276

  Fly    98 ---YRNLR-----MLNTQPVLLVIRKSTIRVNSL----LEWCWHHQLLKVVAIAQDFME---SLI 147
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  Fly   277 KKPYLNLHIKKSTILESEPALMF---DSVYVFAIGLQTLEQSHSLTLLNISCEEENSWDGGLSLI 338

  Fly   148 VYSYNPFPVLQFIERR--------LDNSTVIFEKRLENL-------------HGY------EVPI 185
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  Fly   339 NY-------LNAVEWKGLTGPIQFKDGQRVQFKLDLIKLKQHSIVKVGEWTPHGHLNITEPSMFF 396

  Fly   186 ALGGSSPRLIVYRDLE-------------GKLIFSGPVGNFMKSFEQR----YNCRLV--QPYPF 231
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  Fly   397 DAGSMNVTLVVITILETPYVMMHYGKNFTGNERFYGFCVDILETISREVGFDYILDLVPDRKYGA 461

  Fly   232 DESAISPARDLIASVQNGSVQIALGAI---YPQVPYTGYSYPIELMSWCLMMPVPEEVPHSQLYS 293
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  Fly   462 KDPETGEWNGMVAQLMKYKADLAVGSMTITYARESVIDFTKPFMNLGISILFKVPTSEP-TRLFS 525

  Fly   294 MVFSPMAFGITIVAMVLISLTLSMALRLHGYRVSFSEYFLHDSC-LRGV-------LSQSFYEVL 350
            .: :|:|..|.|..::...| :|:.:.:.| ::|..|:...::| |..:       |:.||:..:
  Fly   526 FM-NPLAIEIWIYVLIAYFL-VSLCIYIVG-KLSPIEWKCINACDLENISIGNQFSLTDSFWFTI 587

  Fly   351 -----RAPALI-KAMYLVIC-----LLGLLITSWYNSYFSTFVTSAPRFPQLTSYESI-RHSNIK 403
                 ::|.:. :||...|.     ...|:|.:.|.:..:.|:|:......:.:.|.: ..:.|.
  Fly   588 GTFMQQSPDIYPRAMSTRIISSTWGFFSLIIVASYTANLAAFLTTERMINPIENAEDLASQTEIS 652

  Fly   404 IVIWKPEYEMLLFFSENMEKYSSIFQLQEDYKEFLHLRDSFDTRY----------GYMMPMEKWS 458
            .........|..|....:|.|..|::..::.|.     .:|.|.|          .|...||...
  Fly   653 YGTLDSGSTMTFFRDSVIETYKKIWRSMDNKKP-----SAFTTTYEDGIKRVNQGNYAFLMESTM 712

  Fly   459 LMKEQQRVFS-SPLFSLQDDLCVFHTVPIVFPMVKNSIFKEPFDRLILDVTATG----LLSRW-- 516
            |....||..: :.:..|.|........|      |.|.:::.....||::...|    |..:|
  Fly   713 LDYIVQRDCNLTQIGGLLDTKGYGIATP------KGSPWRDKISLAILELQERGDIQMLYDKWWK 771

  Fly   517 -RDMSFT-----EMIKAGQLGLEDRGHPKEFRAMKVGDLIQIWRFVGWMLGLATIVFLLELICFW 575
             .|.:.|     :..||..||||..|                    |..:.|...:.:..::.|:
  Fly   772 NTDETCTRKNTSKQSKANSLGLESIG--------------------GVFVVLIAGIIVAAVVAFF 816

  Fly   576 RHKMWQNMKYMF 587
              :.|.|.:|.:
  Fly   817 --EFWYNFRYNY 826

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ir94d	NP_001138099.1	None
Ekar	NP_001036250.1	PBP1_iGluR_Kainate	24..390	CDD:380605	50/252 (20%)
		PBP2_iGluR_Kainate	402..771	CDD:270432	71/383 (19%)
		Lig_chan	532..806	CDD:459656	59/306 (19%)