DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TSC2 and tsc2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011520938.1 Gene:TSC2 / 7249 HGNCID:12363 Length:1825 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_021331278.2 Gene:tsc2 / 567524 ZFINID:ZDB-GENE-030131-2702 Length:1841 Species:Danio rerio


Alignment Length:1879 Identity:1170/1879 - (62%)
Similarity:1420/1879 - (75%) Gaps:92/1879 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPNPRSAEGKQTEFIITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQIC 65
            |.|..||:| |::|||.:.|||..||:.:.|:.|.:|:|||.:||.||:.|..||:||||:..:|
Zfish     1 MNKQPSKES-LRDKFKGIFGLGPTRPHHKQADNKPSEYIITLDILMELTSEYSLNHRIRMVNHVC 64

Human    66 EVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDY 130
            |:||||:||||||||:||||.||.|||:|.|||||||.||:||:|||||.||.|||.|||||.||
Zfish    65 ELAKTKRFEEHAVEAIWKAVEDLTQPEQPPEARHAVLVLLRAIIQGQGEWLGPLRAYFFKVILDY 129

Human   131 -PSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEY 194
             ||||:|.||||||||||:||:.|||||||:|.|||.||:.||||:||.|||||||||||||||.
Zfish   130 QPSNEELPERLEVFKALTENGKDITYLEEEIARFVLLWMENGLSSDFLHVLVNLVKFNSCYLDEN 194

Human   195 IARMVQMICLLCVRTASSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKL 259
            ::.|||.|||||.||.||.||||:||||||||||||||::||.:||:|||||:||||.||.||||
Zfish   195 VSLMVQKICLLCNRTTSSTDIEVALQVLDAVVCYNCLPSDSLTVFIITLCRTVNVKEFCESCWKL 259

Human   260 MRNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSPTSVLPSFY 324
            ||.:|||||||||||.||.:||:|.|.|||.|||||||||||||||||||.:|:|:||.||||||
Zfish   260 MRKVLGTHLGHSAIYTMCRIMEERVYSEDAALLRGAVFFVGMALWGAHRLPALKNTPTLVLPSFY 324

Human   325 QAMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWDILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTIVHDLLT 389
            :||:|.|||||||||||||||||||.:|||||.|||||:||:|||||:||:.||:|:.||::||:
Zfish   325 KAMSCANEVVSYEIVLSITRLIKKYGRELQVVTWDILLSIIDRLLQQIQTMGSPDLKVIVYELLS 389

Human   390 TVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIQNLQALMERFFR 454
            |:|||.:||:||||..|:|.|||:|||:||::|:|.|:|||||:|.||||||:|||..||::|||
Zfish   390 TIEELYEQNDFHGSSARFFSLVEKCADKRPDASVLTLVSYRAQAIQPAKDGWLQNLLKLMDKFFR 454

Human   455 SESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGC 519
            :|||..:|||||.:|||||..|||.||||||..|||.||..|.||:|..|||.||||||||||||
Zfish   455 NESRTMIRIKVLHILSFVLSTNRQLYEEELIEVVVIPQLGQIAEDRDPSVRKQATQLLVDLAEGC 519

Human   520 HTHHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHAT 584
            .||||:|||||||||.:|.||...| .:|::...| .||||:||:||||.|||:|||:||||||:
Zfish   520 STHHFSSLLDIIEKVASRPLSCSVE-GDRELCVES-PLEDVRTAILGLLDILQSKLYSLPASHAS 582

Human   585 RVYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYM 649
            ||||:|:||:|||||:.|...|:.:|||:.||||||:|||||||||:|||||.:||||||.||..
Zfish   583 RVYELLISHLQLHYKNKYCSAISGAIRLKVFDFLLLMRADSLHRLGVPNKDGALRFSPYCHCDPG 647

Human   650 EPE-RGSEKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLGRL 713
            |.| |.||||.:|.:|||.|.|.||....::|...:||||.|.|||||||.|:|||||||||.::
Zfish   648 ESEKRVSEKKPTGSVSPPAGSPTPAAPPSSIRTAYLPYSLAFSVLLQCLKTETDWKVLKLVLDKM 712

Human   714 PESLRYKVLIFTSPCSVDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHN 778
            ..:::|||||.||||::|.||:.||||::....||||:..|:|||.||:.|||||||||:.|||:
Zfish   713 SCTIQYKVLILTSPCNIDNLCATLCSMVTDRIILERLKKTPDGFSLTDVQLAVVPVLTAITSYHS 777

Human   779 YLDKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQCVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPL 843
            |||:.:||::|.|||:|||:|||.||||||::|:||||||:||.||.|:|||||||||.:||.|:
Zfish   778 YLDQLRQRDLVQCLEKGLIYRCAKQCVVALTMCTVEMPDIMIKLLPALIVKLTHISATVAMASPM 842

Human   844 LEFLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDF 908
            |||||||.||||||.||.||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Zfish   843 LEFLSTLVRLPHLYANFVAEQYVSVFAISLPYTNPSKFNQYIVSLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDF 907

Human   909 VPFITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIARPPKQGLNNSPPVKEFKESSAAE 973
            |.:||||||||.||.||||.|:.|||||||||||||||||..:..|||.:.:.|||:.|:.||.:
Zfish   908 VQYITKGLRSNALLPFDDTHEQSSFRARSTSLNERPKSLRTTKVAKQGPSANSPVKDLKDLSAMD 972

Human   974 AFRCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSVAQADDSLKNLHLELTETCLDMMARYVFSNF 1038
            |||.||||||||.|| |:|||.|:.||||||||:|.||||:||.:||||||||||||||||||||
Zfish   973 AFRSRSISVSEHAVR-RMQTSSTTCSLGSADENAVMQADDALKTVHLELTETCLDMMARYVFSNF 1036

Human  1039 TAVPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGELQSGPE-SSSSPGVHV 1102
            :|:|||||:.:|||:||.:.||||||||||:|||.|:.|::|||||..|...|.| :.|.|.:|.
Zfish  1037 SALPKRSPIADFLLSGGPSMTWLVGNKLVTITTSGGSRTQALLGLDMTERHGGGEMTRSDPSLHT 1101

Human  1103 RQTKEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVG-------ALDVPASQFLGSATSPGP-- 1158
            |||||||||||||:.||::...|.||||:||||.||.|       .:..|..::.|....|||  
Zfish  1102 RQTKEAPAKLESQSSQQINTNTRTRVRSISGGHALRAGPAQSLSPLVASPEGEYSGPLPPPGPPL 1166

Human  1159 -----RTAPAAKPEKASAGTRVPVQEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSP 1218
                 :......|..::.....|::.|.:||.:||:||||||||.:|||:|||||||.||||.||
Zfish  1167 DVLSSQRGMEEHPPPSACNPSPPLKHKHSLAEFVPMLTQGWAEIFIRRPSGNTSWLMCLENPPSP 1231

Human  1219 FSSDINNMPLQELSNALMAAERFKE---HRDTALYKSLSVPAASTAKPPPLPRSNTVASFSSLYQ 1280
            |||::.|:||||||:.|||.:..||   .|.|    .:|.|   ..||.|:.|||||||.|||..
Zfish  1232 FSSELGNLPLQELSSVLMAMDGVKEPPAERPT----DVSQP---QGKPAPIQRSNTVASLSSLCS 1289

Human  1281 SSCQGQLHRSVSWAGIASQREAVGCRAPLCLIDSAVVMEEGSPGEVPVLVEPPGLEDVE------ 1339
            |...|:.|||:|||                   .:|||||.  |.....|.|...::||      
Zfish  1290 SESSGRFHRSISWA-------------------DSVVMEES--GRSMASVSPAESKEVEEFEAVP 1333

Human  1340 -AALGMDRRTDA---YSRSSSVSSQEEKSLHAEELVGRGIPIERVVSS--EGGRPSVDLSF---- 1394
             ..:.|:..|.|   .|||||.|||::.....||:...||||::...|  ..|....:|||    
Zfish  1334 SEPIFMNTSTTAPGMMSRSSSTSSQDDDKSTLEEVSEGGIPIDQPPLSLCTPGAQDPELSFTQSS 1398

Human  1395 QPSQPLSKSSSSPELQTLQDILG-------DPGDKADVGRL-----SPEVKARSQSGTLDGESAA 1447
            ..|..|:|||||||||||.:...       ||...:.:..:     :|...|.|.:||....|:.
Zfish  1399 SSSSTLNKSSSSPELQTLPEAFSKASSQSVDPAPTSKIPTVQACVEAPGESAGSTAGTSCSSSSV 1463

Human  1448 WSASGEDSRGQPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRR--GKRVERDALKSRATASNAEKV 1510
            ..:|...||.:.|.|...:.|.||:|.||||:|||.||||.|  .|.:||||   |..|:|.||.
Zfish  1464 SVSSSSTSRMRLEFPPVQTGPLSPTGHRPRGHTISVSAPSSRRDRKTLERDA---RGGATNVEKS 1525

Human  1511 PGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQIPSYDTHKIAVLYVGEGQSNS 1575
            .|::|||||||||||||||:|:|||:||| :||..:|:|::|||:|.||||||.|::||.||:|:
Zfish  1526 SGLSPSFVFLQLYHSPFFGNEANKPLLLP-KSQLIDRAVKVLDQMPPYDTHKIGVVFVGAGQANN 1589

Human  1576 ELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGEDGQFTYCWHDDIMQAVFHIA 1640
            |::|||||:||.||.:||||||:||.||||.||:::|||||..|:||:||||||||||||:||||
Zfish  1590 EVSILSNEYGSKRYAQFLTGLGKLIHLKDCDPDQIFLGGLDQYGDDGEFTYCWHDDIMQAIFHIA 1654

Human  1641 TLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVIVTPLDYECNLVSLQC 1705
            ||||.::.|:..|:||||:|||||.:||||||||:||||||||||||.|::.|||||.|||:|||
Zfish  1655 TLMPNRESDRGCCNKKRHIGNDFVVVVYNDSGEDYKLGTIKGQFNFVEVLIKPLDYESNLVTLQC 1719

Human  1706 RKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQMALHANMASQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQ 1770
            |||:||||||||||||||||||.:.|||||||||||.||..|:||:|.|.|||:||||||||:|.
Zfish  1720 RKDLEGLVDTSVAKIVSDRNLPLLVRQMALHANMASLVHQCRANPSDAYASKWLARLRHIKRIRT 1784

Human  1771 RICEEAAYSNP----SLPLVHPPSHSKAPAQTPAEPTPGYEVGQRKRLISSVEDFTEFV 1825
            | .:|...|.|    ||...|....:| ||..|.......:.||||||:|:|:|||:||
Zfish  1785 R-AQEEIQSRPSHGISLTQGHASMQNK-PAHQPPGAAQNPDAGQRKRLVSTVDDFTDFV 1841

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TSC2XP_011520938.1 DUF3384 54..419 CDD:463376 275/365 (75%)
Tuberin 555..903 CDD:460965 241/348 (69%)
Rap_GAP 1580..1766 CDD:460463 140/185 (76%)
tsc2XP_021331278.2 None

Return to query results.
Submit another query.