DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TSC2 and Tsc2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011520938.1 Gene:TSC2 / 7249 HGNCID:12363 Length:1825 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_036812.3 Gene:Tsc2 / 24855 RGDID:3908 Length:1809 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1830 Identity:1650/1830 - (90%)
Similarity:1703/1830 - (93%) Gaps:26/1830 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPNPRSAEGKQTEFIITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQIC 65
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
  Rat     1 MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTSRPNPRCAEGKQTEFIITAEILRELSGECGLNNRIRMIGQIC 65

Human    66 EVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDY 130
            :||||||.||||||||||||:||||||||.||||||||||||||||||:||||||||||||||||
  Rat    66 DVAKTKKLEEHAVEALWKAVSDLLQPERPPEARHAVLALLKAIVQGQGDRLGVLRALFFKVIKDY 130

Human   131 PSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYI 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 PSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELAEFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYI 195

Human   196 ARMVQMICLLCVRTASSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKLM 260
            |.||.||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||
  Rat   196 APMVHMICLLCIRTVSSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIITLCRTVNVKELCEPCWKLM 260

Human   261 RNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSPTSVLPSFYQ 325
            |||||||||||||||||.:||:|:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:
  Rat   261 RNLLGTHLGHSAIYNMCRIMENRSYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLKNSPTSVLPSFYE 325

Human   326 AMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWDILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTIVHDLLTT 390
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||:||||||||||.||||||||||||||||
  Rat   326 AMTCPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQAVTWDILLDIIERLLQQLQNLDSPELRTIVHDLLTT 390

Human   391 VEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIQNLQALMERFFRS 455
            |||||||||||||||||:||||..|||||||||||||:||||||||||||||||||.|||||||:
  Rat   391 VEELCDQNEFHGSQERYYELVESYADQRPESSLLNLITYRAQSIHPAKDGWIQNLQLLMERFFRN 455

Human   456 ESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGCH 520
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 ECRSAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGCH 520

Human   521 THHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHATR 585
            ||||||||||||||||||||||.||||||:|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 THHFNSLLDIIEKVMARSLSPPLELEERDLAVYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHATR 585

Human   586 VYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYME 650
            |||.|:|||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||..|
  Rat   586 VYETLISHIQLHYKHGYSLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCLCDCAE 650

Human   651 PERGSEKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLGRLPE 715
            .:|.||||.|||||||||||.|.|.|||||||.:||||||||||||||||:|||||||||.:|||
  Rat   651 LDRASEKKASGPLSPPTGPPSPVPTGPAVRLGHLPYSLLFRVLLQCLKQETDWKVLKLVLSKLPE 715

Human   716 SLRYKVLIFTSPCSVDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYL 780
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
  Rat   716 SLRYKVLIFTSPCSVDQLSSALCSMLSAPKTLERLRGTPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYL 780

Human   781 DKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQCVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPLLE 845
            |||:|||||||||||||:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   781 DKTRQREMVYCLEQGLIYRCASQCVVALAICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAIPLLE 845

Human   846 FLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVP 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   846 FLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVP 910

Human   911 FITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIARPPKQGLNNSPPVKEFKESSAAEAF 975
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
  Rat   911 YITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIARAPKQGLNNSPPVKEFKESCAAEAF 975

Human   976 RCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSVAQADDSLKNLHLELTETCLDMMARYVFSNFTA 1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||
  Rat   976 RCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSMAQADDNLKNLHLELTETCLDMMARYVFSNFTA 1040

Human  1041 VPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGELQSGPESSSSPGVHVRQT 1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|..|||.||.|||||
  Rat  1041 VPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGDLQGGSASSSDPGTHVRQT 1105

Human  1106 KEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGALDVPASQFLGSATSPGPRTAPAAKPEKAS 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|....|...|.|.:.||||:|||..
  Rat  1106 KEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGVLDTSAPYTPGGPASLGAQAAPAARPEKPC 1170

Human  1171 AGTRVPVQEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNAL 1235
            ||.::|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1171 AGAQLPAAEKANLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNAL 1235

Human  1236 MAAERFKEHRDTALYKSLSVPAASTAKPPPLPRSNTVASFSSLYQSSCQGQLHRSVSWAGIASQR 1300
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||      
  Rat  1236 MAAERFKEHRDTALYKSLSVPAAGTAKPPTLPRSNTVASFSSLYQPSCQGQLHRSVSWA------ 1294

Human  1301 EAVGCRAPLCLIDSAVVMEEGSPGEVPVLVEPPGLEDVEAALGMDR---RTDAYSRSSSVSSQEE 1362
                        |||||:|||||||..|.||||.|||.|||||.||   |.||||||||.|||||
  Rat  1295 ------------DSAVVLEEGSPGEAHVPVEPPELEDFEAALGTDRHCQRPDAYSRSSSASSQEE 1347

Human  1363 KSLHAEELVGRGIPIERVVSSEGGRPSVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDPGDKADVGR 1427
            || |.|||...||||||.:||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|:||
  Rat  1348 KS-HLEELAAGGIPIERAISSEGARPTVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDLGDKTDIGR 1411

Human  1428 LSPEVKARSQSGTLDGESAAWSASGEDSR--GQPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRG 1490
            ||||.|.|||||.||||:|.|||.||:||  ..||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1412 LSPEAKVRSQSGILDGEAATWSAPGEESRITVPPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRG 1476

Human  1491 KRVERDALKSRATASNAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQI 1555
            ||||||..|||..||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
  Rat  1477 KRVERDNFKSRTAASSAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNE--SFERSVQLLDQI 1539

Human  1556 PSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGE 1620
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1540 PSYDTHKIAVLYVGEGQSSSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGE 1604

Human  1621 DGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFN 1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
  Rat  1605 DGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIIYNDSGEDFKLGTIKGQFN 1669

Human  1686 FVHVIVTPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQMALHANMASQVHHSRSNP 1750
            |||||:|||||:|||::||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
  Rat  1670 FVHVIITPLDYKCNLLTLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLSFVARQMALHANMASQVHHSRSNP 1734

Human  1751 TDIYPSKWIARLRHIKRLRQRICEEAAYSNPSLPLVHPPSHSKAPAQTPAEPTPGYEVGQRKRLI 1815
            ||||||||||||||||||||||.||..||||||||:|||:|:|.|||.|.|.||.||.|||||||
  Rat  1735 TDIYPSKWIARLRHIKRLRQRIREEVHYSNPSLPLMHPPAHTKVPAQAPTEATPTYETGQRKRLI 1799

Human  1816 SSVEDFTEFV 1825
            |||:||||||
  Rat  1800 SSVDDFTEFV 1809

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TSC2XP_011520938.1 DUF3384 54..419 CDD:463376 338/364 (93%)
Tuberin 555..903 CDD:460965 321/347 (93%)
Rap_GAP 1580..1766 CDD:460463 179/185 (97%)
Tsc2NP_036812.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1078..1136 51/57 (89%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1330..1359 20/29 (69%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1373..1392 17/18 (94%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1405..1492 69/86 (80%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1764..1793 20/28 (71%)

Return to query results.
Submit another query.