DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TSC2 and Tsc2

DIOPT Version :10

Sequence 1:XP_011520938.1 Gene:TSC2 / 7249 HGNCID:12363 Length:1825 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_001273649.1 Gene:Tsc2 / 22084 MGIID:102548 Length:1814 Species:Mus musculus


Alignment Length:1840 Identity:1629/1840 - (88%)
Similarity:1688/1840 - (91%) Gaps:41/1840 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTPRPNPRSAEGKQTEFIITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQIC 65
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||:|||||||.|||||||||||||||
Mouse     1 MAKPTSKDSGLKEKFKILLGLGTSRPNPRCAEGKQTEFIITSEILRELSGECGLNNRIRMIGQIC 65

Human    66 EVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDY 130
            :||||||.||||||||||||:||||||||.|||||||.||||||||||:||||||||||||||||
Mouse    66 DVAKTKKLEEHAVEALWKAVSDLLQPERPPEARHAVLTLLKAIVQGQGDRLGVLRALFFKVIKDY 130

Human   131 PSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYI 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 PSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELAEFVLQWMDVGLSSEFLLVLVNLVKFNSCYLDEYI 195

Human   196 ARMVQMICLLCVRTASSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKLM 260
            |.||.||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
Mouse   196 ASMVHMICLLCIRTVSSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIITLCRTINVKELCEPCWKLM 260

Human   261 RNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSPTSVLPSFYQ 325
            |||||||||||||||||.:||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:
Mouse   261 RNLLGTHLGHSAIYNMCRIMEDRSYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLKNSPTSVLPSFYE 325

Human   326 AMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWDILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTIVHDLLTT 390
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||:||||||||||.||||||:|||||||||
Mouse   326 AMTCPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQAVTWDILLDIIERLLQQLQNLDSPELKTIVHDLLTT 390

Human   391 VEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIQNLQALMERFFRS 455
            |||||||||||||||||:||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||:
Mouse   391 VEELCDQNEFHGSQERYYELVESYADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIQNLQLLMERFFRN 455

Human   456 ESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGCH 520
            |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   456 ECRSAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGCH 520

Human   521 THHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHATR 585
            |||||||||||||||||||||||||||||:|.:||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   521 THHFNSLLDIIEKVMARSLSPPPELEERDLAMHSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHATR 585

Human   586 VYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYME 650
            |||.|:|||||||||.|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||
Mouse   586 VYESLISHIQLHYKHGYSLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCLCDCME 650

Human   651 PERGSEKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLGRLPE 715
            .:|.||||.|||||||||||.|.|.|||||||.:||||||||||||||||||||||||||.||||
Mouse   651 LDRASEKKASGPLSPPTGPPSPVPMGPAVRLGYLPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLSRLPE 715

Human   716 SLRYKVLIFTSPCSVDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYL 780
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 SLRYKVLIFTSPCSVDQLSSALCSMLSAPKTLERLRGTPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYL 780

Human   781 DKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQCVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPLLE 845
            |||:|||||||||||||:||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||:||||
Mouse   781 DKTRQREMVYCLEQGLIYRCASQCVVALAICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAIPLLE 845

Human   846 FLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVP 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   846 FLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVP 910

Human   911 FITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIARPPKQGLNNSPPVKEFKESSAAEAF 975
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Mouse   911 YITKGLRSNVLLSFDDTPEKDSFRARSTSLNERPKSLRIARAPKQGLNNSPPVKEFKESCAAEAF 975

Human   976 RCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSVAQADDSLKNLHLELTETCLDMMARYVFSNFTA 1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 RCRSISVSEHVVRSRIQTSLTSASLGSADENSMAQADDNLKNLHLELTETCLDMMARYVFSNFTA 1040

Human  1041 VPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGELQSGPESSSSPGVHVRQT 1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.|.:|||.|..|||||
Mouse  1041 VPKRSPVGEFLLAGGRTKTWLVGNKLVTVTTSVGTGTRSLLGLDSGDLQGGSDSSSDPSTHVRQT 1105

Human  1106 KEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGALDVPASQFLGSATSPGPRTAPAAKPEKAS 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|....|.:.|.||:||.||||||..
Mouse  1106 KEAPAKLESQAGQQVSRGARDRVRSMSGGHGLRVGVLDTSAPYSPGGSASLGPQTAVAAKPEKPP 1170

Human  1171 AGTRVPVQEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNAL 1235
            ||.::|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1171 AGAQLPTAEKTNLAAYVPLLTQGWAEILVRRPTGNTSWLMSLENPLSPFSSDINNMPLQELSNAL 1235

Human  1236 MAAERFKEHRDTALYKSLSVPAASTAKPPPLPRSNTVASFSSLYQSSCQGQLHRSVSWAGIASQR 1300
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||      
Mouse  1236 MAAERFKEHRDTALYKSLSVPAAGTAKPPTLPRSNTVASFSSLYQPSCQGQLHRSVSWA------ 1294

Human  1301 EAVGCRAPLCLIDSAVVMEEGSPGEVPVLVEPPGLEDVEAALGMDR---RTDAYSRSSSVSSQEE 1362
                        |||:|:|||||||..|.||||.|||.|||||.||   |.|.||||||.|||||
Mouse  1295 ------------DSAMVLEEGSPGETQVPVEPPELEDFEAALGTDRHCQRPDTYSRSSSASSQEE 1347

Human  1363 KSLHAEELVGRGIPIERVVSSEGGRPSVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDPGDKADVGR 1427
            || |.|||...||||||.:||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|:||
Mouse  1348 KS-HLEELAAGGIPIERAISSEGARPAVDLSFQPSQPLSKSSSSPELQTLQDILGDLGDKIDIGR 1411

Human  1428 LSPEVKARSQSGTLDGESAAWSASGEDSR--GQPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRG 1490
            ||||.|.|||||.||||:|.|||:||:||  ..||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1412 LSPEAKVRSQSGILDGEAATWSATGEESRITVPPEGPLPSSSPRSPSGLRPRGYTISDSAPSRRG 1476

Human  1491 KRVERDALKSRATASNAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQI 1555
            ||||||..||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
Mouse  1477 KRVERDNFKSRAAASSAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNE--SFERSVQLLDQI 1539

Human  1556 PSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGE 1620
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1540 PSYDTHKIAVLYVGEGQSSSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGE 1604

Human  1621 DGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFN 1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
Mouse  1605 DGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIIYNDSGEDFKLGTIKGQFN 1669

Human  1686 FVHVIVTPLDYECNLVSLQCRKD----------MEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQMALHANMA 1740
            |||||:|||||:|||::||||||          ..|.:......:|.:..:..    :..|..||
Mouse  1670 FVHVIITPLDYKCNLLTLQCRKDGPACKCEWWRQPGEIVVWALPVVMELTVTI----LLCHLQMA 1730

Human  1741 SQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQRICEEAAYSNPSLPLVHPPSHSKAPAQTPAEPTPG 1805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||:|||:|:|||||.| |.||.
Mouse  1731 SQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQRIREEVHYSNPSLPLMHPPAHTKAPAQAP-EATPT 1794

Human  1806 YEVGQRKRLISSVEDFTEFV 1825
            ||.||||||||||:||||||
Mouse  1795 YETGQRKRLISSVDDFTEFV 1814

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TSC2XP_011520938.1 DUF3384 54..419 CDD:463376 338/364 (93%)
Tuberin 555..903 CDD:460965 324/347 (93%)
Rap_GAP 1580..1766 CDD:460463 153/195 (78%)
Tsc2NP_001273649.1 DUF3384 54..419 CDD:463376 338/364 (93%)
Tuberin 555..903 CDD:460965 324/347 (93%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1078..1174 73/95 (77%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1326..1357 21/31 (68%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1429..1491 50/61 (82%)
Rap_GAP 1564..1756 CDD:460463 153/195 (78%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1772..1798 19/26 (73%)

Return to query results.
Submit another query.