DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TRPC6 and Trpc6

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_004612.2 Gene:TRPC6 / 7225 HGNCID:12338 Length:931 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_446011.1 Gene:Trpc6 / 89823 RGDID:619788 Length:930 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:931 Identity:874/931 - (93%)
Similarity:894/931 - (96%) Gaps:1/931 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MSQSPAFGPRRGSSPRGAAGAAARRNESQDYLLMDSELGEDGCPQAPLPCYGYYPCFRGSDNRLA 65
            |||||.|..|||.||:.|.||.||||||||||||| |||:||.||...|.|||||.|||::|||.
  Rat     1 MSQSPGFVTRRGGSPKAAPGAGARRNESQDYLLMD-ELGDDGYPQLQQPPYGYYPSFRGNENRLT 64

Human    66 HRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFSDRSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECHSLNVNCVD 130
            |||||||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
  Rat    65 HRRQTVLREKGRRLANRGPAYMFNDHSTSLSIEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEECLSLNVNCVD 129

Human   131 YMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILSHPAFAEGKRLATS 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
  Rat   130 YMGQNALQLAVANEHLEITELLLKKENLSRVGDALLLAISKGYVRIVEAILNHPAFAEGKRLATS 194

Human   196 PSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCNDCNQ 260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|:|
  Rat   195 PSQSELQQDDFYAYDEDGTRFSHDVTPIILAAHCQEYEIVHTLLRKGARIERPHDYFCKCTECSQ 259

Human   261 KQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYKKLSMQC 325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
  Rat   260 KQKHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVMTALELSNELAVLANIEKEFKNDYRKLSMQC 324

Human   326 KDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDVETLQSGDHGRPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSI 390
            ||||||||||||||||||||||||.||.|.||..|||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   325 KDFVVGLLDLCRNTEEVEAILNGDAETRQPGDLARPNLSRLKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLSI 389

Human   391 WYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWFAPCSKMGKIMRGPFMKFVAHAASFTIFLG 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat   390 WYENLSGLRQQTMAVKFLVVLAVAIGLPFLALIYWCAPCSKMGKILRGPFMKFVAHAASFTIFLG 454

Human   456 LLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNAKQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKE 520
            |||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   455 LLVMNAADRFEGTKLLPNETSTDNARQLFRMKTSCFSWMEMLIISWVIGMIWAECKEIWTQGPKE 519

Human   521 YLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIK 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   520 YLFELWNMLDFGMLAIFAASFIARFMAFWHASKAQSIIDANDTLKDLTKVTLGDNVKYYNLARIK 584

Human   586 WDPSDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMI 650
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   585 WDPTDPQIISEGLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVIFIMVFVAFMI 649

Human   651 GMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTM 715
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   650 GMFNLYSYYIGAKQNEAFTTVEESFKTLFWAIFGLSEVKSVVINYNHKFIENIGYVLYGVYNVTM 714

Human   716 VIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLFYLLLKL 780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
  Rat   715 VIVLLNMLIAMINSSFQEIEDDADVEWKFARAKLWFSYFEEGRTLPVPFNLVPSPKSLLYLLLKF 779

Human   781 KKWISELFQGHKKGFQEDAEMNKINEEKKLGILGSHEDLSKLSLDKKQVGHNKQPSIRSSEDFHL 845
            |||:|||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||:.|:.||||.|.||||||||
  Rat   780 KKWMSELIQGHKKGFQEDAEMNKRNEEKKFGILGSHEDLSKFSLDRNQLAHNKQSSTRSSEDFHL 844

Human   846 NSFNNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLA 910
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   845 NSFSNPPRQYQKIMKRLIKRYVLQAQIDKESDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEEKSQNTEDLA 909

Human   911 ELIRELGEKLSMEPNQEETNR 931
            ||||:|||:||:|..|||:.|
  Rat   910 ELIRKLGERLSLESKQEESRR 930

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TRPC6NP_004612.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..26 16/24 (67%)
trp 82..897 CDD:273311 783/814 (96%)
ANK 1 97..126 27/28 (96%)
ANK 2 132..161 28/28 (100%)
ANK repeat 132..159 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK repeat 161..185 CDD:293786 22/23 (96%)
ANK 3 163..189 24/25 (96%)
ANK repeat 212..247 CDD:293786 34/34 (100%)
ANK 4 218..247 28/28 (100%)
Trpc6NP_446011.1 TRPV 81..896 CDD:454755 783/814 (96%)
ANK repeat 131..158 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK repeat 160..184 CDD:293786 22/23 (96%)
ANK repeat 211..246 CDD:293786 34/34 (100%)

Return to query results.
Submit another query.