DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TRPC4 and Trpc4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003297.1 Gene:TRPC4 / 7223 HGNCID:12336 Length:982 Species:Homo sapiens
Sequence 2:NP_536321.1 Gene:Trpc4 / 84494 RGDID:621276 Length:977 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:983 Identity:949/983 - (96%)
Similarity:962/983 - (97%) Gaps:7/983 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFKININC 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat     1 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFKININC 65

Human    66 IDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQVPPI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 IDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKKPSGEKQVPPI 130

Human   131 LLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRS 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   131 LLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRS 195

Human   196 RLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTR 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   196 RLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTR 260

Human   261 SSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRH 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   261 SSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRH 325

Human   326 WAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRS 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   326 WAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRS 390

Human   391 DLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVA 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   391 DLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVA 455

Human   456 FVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   456 FVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFL 520

Human   521 FIYCLVLLAFANGLNQLYFYYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTN 585
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   521 FIYCLVLLAFANGLNQLYFYYEETKGLSCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTN 585

Human   586 VKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEG 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   586 VKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEG 650

Human   651 GTLPTPFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGVRTQHRRAADNLRRHHQYQEVM 715
            |||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||
  Rat   651 GTLPTPFNVIPSPKSLWYLVKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIG-----RRAADNLRRHHQYQEVM 710

Human   716 RNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSA 780
            |||||||||||||:|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||: .|::||
  Rat   711 RNLVKRYVAAMIREAKTEEGLTEENVKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANAA-SSASSA 774

Human   781 DSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVT 845
            ||||||.||||.|||:||.||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||||||||||.
  Rat   775 DSDEKSHSEGNGKDKRKNLSLFDLTTLIHPRSAVIASERHNLSNGSALVVQEPPREKQRKVNFVA 839

Human   846 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIPGLSEQ 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||.|||||||||:|||||||.|||||:||
  Rat   840 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEITRQQAAGALERNIQLESQGLASRGDRSIPGLNEQ 904

Human   911 CVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVC-PFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYDLNLPDTVTH 974
            ||||||||||||||||||||||| .|||||||||||||||||||||:||||||||||:..|||.|
  Rat   905 CVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCSSFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAQEEDSSIDYDLSPTDTVAH 969

Human   975 EDYVTTRL 982
            ||||||||
  Rat   970 EDYVTTRL 977

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TRPC4NP_003297.1 trp 17..754 CDD:273311 727/736 (99%)
ANK 1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM, ECO:0007744|PDB:8WPN 29..60 30/30 (100%)
ANK 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM, ECO:0007744|PDB:8WPN 71..93 21/21 (100%)
ANK 3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM, ECO:0007744|PDB:8WPN 96..118 21/21 (100%)
ANK repeat 122..167 CDD:293786 44/44 (100%)
ANK 4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM, ECO:0007744|PDB:8WPN 141..165 23/23 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 767..795 20/27 (74%)
PDZ-binding domain. /evidence=ECO:0000269|PubMed:12154080 980..982 1/1 (100%)
Trpc4NP_536321.1 trp 17..749 CDD:273311 727/736 (99%)
ANK 1. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 29..60 30/30 (100%)
ANK 2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 71..93 21/21 (100%)
ANK 3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 96..118 21/21 (100%)
ANK repeat 122..167 CDD:293786 44/44 (100%)
ANK 4. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 141..165 23/23 (100%)
Interaction with ITPR1, ITPR2 and ITPR3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 615..977 334/367 (91%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 767..790 16/23 (70%)
PDZ-binding domain. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UBN4 975..977 1/1 (100%)

Return to query results.
Submit another query.