DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TRPC1 and trpc1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001238774.1 Gene:TRPC1 / 7220 HGNCID:12333 Length:793 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002937145.3 Gene:trpc1 / 100497011 XenbaseID:XB-GENE-1004978 Length:896 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:793 Identity:714/793 - (90%)
Similarity:757/793 - (95%) Gaps:14/793 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MMAALYPSTDLSGASSSSLPSSPSSSSPNEVMALKDVREVKEENTLNEKLFLLACDKGDYYMVKK 65
            :|||||.|||              |||||:.:|||||||||||.||:|:||||||:|||||||||
 Frog   118 IMAALYQSTD--------------SSSPNKFLALKDVREVKEETTLDERLFLLACEKGDYYMVKK 168

Human    66 ILEENSSGDLNINCVDVLGRNAVTITIENENLDILQLLLDYGCQSADALLVAIDSEVVGAVDILL 130
            :||||||.:||||.||||||||:||:|||||||||||||:|||||.|||||||||||||||||||
 Frog   169 LLEENSSEELNINSVDVLGRNAITISIENENLDILQLLLNYGCQSTDALLVAIDSEVVGAVDILL 233

Human   131 NHRPKRSSRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCEC 195
            ||:||..:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   234 NHQPKWRTRPTIVKLMERIQNPEYSTTMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQDVSLPKPHAVGCEC 298

Human   196 TLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEE 260
            |||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   299 TLCTAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKELSLVEVEFRNDYEE 363

Human   261 LARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQS 325
            ||::||.|||||||||||||||||||||.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   364 LAQKCKTFAKDLLAQARNSRELEVILNHQSSDEPVDKRGLLEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQS 428

Human   326 NCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIH 390
            ||||||||||||||:|||||.|||||:.||||||||||||:|||:|||||.||||||||||||||
 Frog   429 NCQQFLNTVWFGQMAGYRRKHTCKKILIVLTVGIFWPVLSVCYLLAPKSQVGRIIHTPFMKFIIH 493

Human   391 GASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESR 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|:|||:|||:|||||:||||||||||
 Frog   494 GASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERIDFLLIMWLIGMVWSDVKRLWYDGLEDFLEESR 558

Human   456 NQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTS 520
            ||||||||||||||||||||||||||..|:|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
 Frog   559 NQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHSIAERKDWDAFHPTLVAEGLFAFGNVLSYLRLFFMYTTS 623

Human   521 SILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFH 585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||||||||||||||||.||
 Frog   624 SILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTTNEQKDCVGIFCEQQSNDAFH 688

Human   586 SFIGTCFALFWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQ 650
            ||.|||:|||||||||||||:||||||:.|||||||||:||||||||||||||||||||||||||
 Frog   689 SFTGTCYALFWYIFSLAHVALFVTRFSFSEELQSFVGALIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQ 753

Human   651 LIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQN 715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:.:|:||||||||:.|:|||||
 Frog   754 LIANHEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIVPSPKTICYLFNSISKWICSHTTTGRVKRQN 818

Human   716 SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG 780
            |||||::|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||
 Frog   819 SLKEWKSLRQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEMRDLLG 883

Human   781 FRTSKYAMFYPRN 793
            |||||||||||||
 Frog   884 FRTSKYAMFYPRN 896

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TRPC1NP_001238774.1 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..30 12/28 (43%)
ANK 1. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM 46..75 23/28 (82%)
TRPV 48..774 CDD:454755 668/725 (92%)
ANK 2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM 83..109 22/25 (88%)
ANK 3. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM 111..156 39/44 (89%)
ANK 4. /evidence=ECO:0000269|PubMed:39478185, ECO:0007744|PDB:8WPL, ECO:0007744|PDB:8WPM 158..180 21/21 (100%)
trpc1XP_002937145.3 TRPV 151..877 CDD:454755 668/725 (92%)
ANK repeat 186..213 CDD:293786 23/26 (88%)

Return to query results.
Submit another query.