DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TNS1 and Tns1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_024308847.1 Gene:TNS1 / 7145 HGNCID:11973 Length:2005 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038939258.1 Gene:Tns1 / 301509 RGDID:68427 Length:1937 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2017 Identity:1645/2017 - (81%)
Similarity:1720/2017 - (85%) Gaps:149/2017 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     9 MLWPEDLEAPKTHRFKVKTFKKVKPCGICRQVITQEGCTCKVCSFSCHRKCQAKVAAPCVPPSNH 73
            :|.||||||||||.||||.||||||||:|||.||:|||.||||||||||||||||||||||||:|
  Rat    50 LLQPEDLEAPKTHHFKVKAFKKVKPCGVCRQAITREGCICKVCSFSCHRKCQAKVAAPCVPPSSH 114

Human    74 ELVPITTENAPKNVVDKGEGASRGGNTRKSLEDNGSTRVTPSVQPHLQP-------IRNMSVSRT 131
            |||||.||:.||||||.|||..|||:|.|:||:.||.||:||:||..||       .||:||||.
  Rat   115 ELVPIATESVPKNVVDVGEGDCRGGSTPKNLEEAGSMRVSPSIQPQPQPQPQPISLSRNLSVSRA 179

Human   132 MEDSCELDLVYVTERIIAVSFPSTANEENFRSNLREVAQMLKSKHGGNYLLFNLSERRPDITKLH 196
            |||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||
  Rat   180 MEDSCELDLVYITERIIAVSFPSTANEENFRSNLREVAQMLKSKHGGNYLLFNLSEQRPDITKLH 244

Human   197 AKVLEFGWPDLHTPALEKICSICKAMDTWLNADPHNVVVLHNKGNRGRIGVVIAAYMHYSNISAS 261
            |||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   245 AKVLEFGWPDLHTPALEKICSVCKAMDTWLNADPHNVVVLHNKGNRGRIGVVIAAYMHYSNISAS 309

Human   262 ADQALDRFAMKRFYEDKIVPIGQPSQRRYVHYFSGLLSGSIKMNNKPLFLHHVIMHGIPNFESKG 326
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   310 ADQALDRFAMKRFYEDKIVPIGQPSQRRYVHYFSGLLSGSIKMNNKPLFLHHVIMHGIPNFESKG 374

Human   327 GCRPFLRIYQAMQPVYTSGIYNIPGDSQTSVCITIEPGLLLKGDILLKCYHKKFRSPARDVIFRV 391
            ||||||||||||||||||||||||||||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   375 GCRPFLRIYQAMQPVYTSGIYNIPGDSQASICITIEPGLLLKGDILLKCYHKKFRSPARDVIFRV 439

Human   392 QFHTCAIHDLGVVFGKEDLDDAFKDDRFPEYGKVEFVFSYGPEKIQGMEHLENGPSVSVDYNTSD 456
            ||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   440 QFHTCAIHDLGVVFGKEDLDEAFKDDRFPDYGKVEFVFSYGPEKIQGMEHLENGPSVSVDYNTSD 504

Human   457 PLIRWDSYDNFSGHRDDGMEGAVRSDFDMKAQSFSALSFFPAFLSLSAHCLRTFEKQMGAPHVMQ 521
            |||||||||||:|||:||||                                             
  Rat   505 PLIRWDSYDNFNGHREDGME--------------------------------------------- 524

Human   522 RQKGPRVVPWLLSAMQACASWFGGLCIKVVGHTQGPLDGSLYAKVKKKDSLHGSTGAVNATRPTL 586
                                       :|||||||||||||||||||||||:||:|.:...||.|
  Rat   525 ---------------------------EVVGHTQGPLDGSLYAKVKKKDSLNGSSGPITTARPAL 562

Human   587 SATPNHVEHTLSVSSDSGNSTASTKTDKTDEPVPGASSATAALSPQEKRELDRLLSGFGLEREKQ 651
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||:.|.||||||||:||||||||||::||||
  Rat   563 SATPNHVEHTLSVSSDSGNSTASTKTDKTDEPVSGAAIAPAALSPQEKKELDRLLSGFGVDREKQ 627

Human   652 GAMYHTQHLRSRPAGGSAVPSSGRHVVPAQVHVNGGALASERETDILDDELPNQDGHSAGSMGTL 716
            ||||..|.|||.|.||..|.|.|||:||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||
  Rat   628 GAMYRAQQLRSHPGGGPTVSSPGRHIVPAQVHVNGGALASERETDILDDELPIQDGQSGGSMGTL 692

Human   717 SSLDGVTNTSEGGYPEALSPLTNGLDKSYPMEPMVNGGGYPYESASRAGPAHAGHTAPMRPSYSA 781
            ||||||||||||||||.||||||||||.||.||::||||||||||:|..|.|:.|:||:||||||
  Rat   693 SSLDGVTNTSEGGYPETLSPLTNGLDKPYPTEPILNGGGYPYESANRVVPVHSSHSAPIRPSYSA 757

Human   782 QEGLAGYQREGPHPAWPQPVTTSHYAHDPSGMFRSQSFSEAEPQLPPAPVRGGSSREAVQRGLNS 846
            ||||.|||||||||||.:.||::|..:||||:||||||.:.|||||.||.|||||||||||||||
  Rat   758 QEGLGGYQREGPHPAWSKQVTSAHRGYDPSGLFRSQSFPDVEPQLPQAPARGGSSREAVQRGLNS 822

Human   847 W------------QQQQQQQQQPRPPPRQQERAHLESLVASRPSPQPLAETPIPSLPEFPRAASQ 899
            |            ||||||||||.||||||||:.|:||..|:|||...||||||:||||||||||
  Rat   823 WQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPHPPPRQQERSPLQSLACSKPSPHLSAETPIPALPEFPRAASQ 887

Human   900 QEIEQSIETLNMLMLDLEPASAAAPLHKSQSVPGAWPGASPLSSQPLSGSSRQSHPLTQSRSGYI 964
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
  Rat   888 QEIEQSIETLNMLMLDLEPASAAAPLHKSQSVPGAWPGASPLSSQPLLGSSCQSHPLTQSRSGYI 952

Human   965 PSGHSLGTPEPAPRASLESVPPGRSYSPYDYQPCLAGPNQDFHSKSPASSSLPAFLPTTHSPPGP 1029
            |||.:||.|        |.:..||||||||||...|..||.|..||||||:   |||:.||..||
  Rat   953 PSGDTLGAP--------ELLSSGRSYSPYDYQLHPAASNQSFRPKSPASST---FLPSPHSSAGP 1006

Human  1030 QQPPASLPGLTAQPLLSPKEATSDPSRTPEEEPLNLEGLVAHRVAAYNARLQGIGHSGSFPPPPL 1094
            |:||||||||.|:|.|..||.|||.||||||||||||||||||||.||||||.:..|.| ..|.|
  Rat  1007 QEPPASLPGLIAEPQLPLKETTSDTSRTPEEEPLNLEGLVAHRVAVYNARLQSLRQSSS-SRPSL 1070

Human  1095 HRLQSSSLSGVQAREKQPAEPPAPLRRRAASDGQYENQSPEATSPRSPGVRSPVQCVSPELALTI 1159
            |||:|:|||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1071 HRLRSASLSRVQARERQPAEPPAPLRRRAASDGQYENQSPEATSPRSPGVRSPVQCVSPELALTI 1135

Human  1160 ALNPGGRPKEPHLHSYKEAFEEMEGTSPSSPPPSGVRSPPGLAKTPLSALGLKPHNPADILLHPT 1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1136 ALNPGGRPKEPHLHSYKEAFEEMEGTSPSSPPPSVARSPPGLAKTPLSALGLKPHNPADILLHPT 1200

Human  1225 GVTRRRIQPDSLSQEIIPVNLFLSFSFFALPHLHHLPFFPASPSSHLSSRLPSEEDEGKVVVRLS 1289
            ||.||.|||                                            |||||:.|.:..
  Rat  1201 GVARRLIQP--------------------------------------------EEDEGEEVAKPP 1221

Human  1290 EEPRSYVESVARTAVAGPRAQDSEPKSFSAPATQAYGHEIPLRNGTLGGSFVSPSPLSTSSPILS 1354
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||
  Rat  1222 EEPRSYVESVARTAVAGPRAQDVEPKSFSAPATHAYGHETPLRNGTPGGSFVSPSPLSTSSPILS 1286

Human  1355 ADSTSVGSFPSGESSDQGPRTPTQPLLESGFRSGSLGQPSPSAQRNYQSSSPLPTVGSSYSSPDY 1419
            |||||||||||..|||||||||.||:|:|..||||||||||:| .:||||||:|..|||||||||
  Rat  1287 ADSTSVGSFPSAGSSDQGPRTPIQPMLDSSIRSGSLGQPSPAA-LSYQSSSPVPVGGSSYSSPDY 1350

Human  1420 SLQHFSSSPESQARAQFSVAGVHTVPGSPQARHRTVGTNTPPSPGFGWRAINPSMAAPSSPSLSH 1484
            |||.||||||||.:..||.|.||.|||||||||||||||||||||||.|||||:||||.||||||
  Rat  1351 SLQPFSSSPESQGQPHFSAASVHMVPGSPQARHRTVGTNTPPSPGFGRRAINPTMAAPGSPSLSH 1415

Human  1485 HQMMGPPGTGFHGSTVSSPQSSAATTPGSPSLCRHPAGVYQVSGLHNKVATTPGSPSLGRHPGAH 1549
            .|:|||.|.||||:.||...:||...||||||.|||.|.:||.|||:.|.|||||||||||||||
  Rat  1416 RQVMGPSGPGFHGNVVSGHPTSATVAPGSPSLGRHPVGSHQVPGLHSGVVTTPGSPSLGRHPGAH 1480

Human  1550 QGNLASGLHSNAIASPGSPSLGRHLGGSGSVVPGSPCLDRHVAYGGYSTPEDRRPTLSRQSSASG 1614
            ||||.|.||.||:.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1481 QGNLVSSLHGNAVISPGSPSLGRHLGGSGSVVPGSPSLDRHVAYGGYSTPEDRRPTLSRQSSASG 1545

Human  1615 YQAPSTPSFPVSPAYYPGLSSPATSPSPDSAAFRQGSPTPALPEKRRMSVGDRAGSLPNYATING 1679
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1546 YQAPSTPSFPVSPAYYPGLSSPATSPSPDSAAFRQGSPTPALPEKRRMSVGDRAGSLPNYATING 1610

Human  1680 KV-SSPVASGMSSPSGGSTVSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPEISREQA 1743
            || |||||:||:||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1611 KVSSSPVANGMASPSGSSTVSFSHTLPDFSKYSMPDNSPETRAKVKFVQDTSKYWYKPEISREQA 1675

Human  1744 IALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTIMQQNKKGDMTHELVRHFLIETGPRGVKL 1808
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
  Rat  1676 IALLKDQEPGAFIIRDSHSFRGAYGLAMKVSSPPPTITQQGKKGDMTHELVRHFLIETGPRGVKL 1740

Human  1809 KGCPNEPNFGSLSALVYQHSIIPLALPCKLVIPNRDPTDESKDSSGPANSTADLLKQGAACNVLF 1873
            ||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||||||||||||||||.|||||||||||||
  Rat  1741 KGCPNEPNFGSLSALVYQHSVIPLALPCKLVIPSRDPTDESKDSSGPANSTTDLLKQGAACNVLF 1805

Human  1874 VNSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATIVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPLNTVTF 1938
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1806 INSVDMESLTGPQAISKATSETLAADPTPAATIVHFKVSAQGITLTDNQRKLFFRRHYPLNTVTF 1870

Human  1939 CDLDPQERKWMKTEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACHLFAELDPNQPASAIVNFVSKVMLNAGQ 2003
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
  Rat  1871 CDLDPQERKWMKTEGGAPAKLFGFVARKQGSTTDNACHLFAELDPNQPASAIVNFVSKVMLSAGQ 1935

Human  2004 KR 2005
            ||
  Rat  1936 KR 1937

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TNS1XP_024308847.1 None
Tns1XP_038939258.1 C1_TNS1_v 57..112 CDD:410438 48/54 (89%)
PTP_DSP_cys 187..345 CDD:421693 154/157 (98%)
PTEN_C2 352..478 CDD:402161 121/125 (97%)
PHA03247 <718..1143 CDD:223021 331/436 (76%)
PHA03247 <1091..1643 CDD:223021 482/596 (81%)
SH2_Tensin_like 1661..1776 CDD:198181 110/114 (96%)
PTB_tensin 1798..1931 CDD:269924 131/132 (99%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83679884
Domainoid 1 1.000 1943 1.000 Domainoid score I294
eggNOG 1 0.900 - - E2759_KOG1930
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H11219
Inparanoid 1 1.050 3094 1.000 Inparanoid score I481
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG46687
OrthoDB 1 1.010 - - D14319at32523
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0011796
OrthoInspector 1 1.000 - - oto142749
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103416
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45734
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1051
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.