DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TLN1 and tln1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_006280.3 Gene:TLN1 / 7094 HGNCID:11845 Length:2541 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_031750909.1 Gene:tln1 / 733752 XenbaseID:XB-GENE-6039297 Length:2558 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2558 Identity:2186/2558 - (85%)
Similarity:2368/2558 - (92%) Gaps:20/2558 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMVYDACRIIRERIPEAPAGPPSDFGLFLSDDDPKKGIWLEAG 65
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||..|.|:||||||||:|||||||||||
 Frog     1 MVALSLKISIGNVVKTMQFEPSTMIYDACRIIRERVPEAQIGQPNDFGLFLSDEDPKKGIWLEAG 65

Human    66 KALDYYMLRNGDTMEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTIMVDDSKTVTDMLMTICARIGITNHDEYSLV 130
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||:|||||||::|:||||||||||||:||||||
 Frog    66 KALDYYMLRNGDTLEYRKKQRPLKIRMLDGTVKTVMVDDSKTMSDLLMTICARIGITNYDEYSLV 130

Human   131 RELMEEKKEEITGTLRKDKTLLRDEKKMEKLKQKLHTDDELNWLDHGRTLREQGVEEHETLLLRR 195
            ||:||||||||||||::|||||||:||||||||||||||||||||.|||||||||:|:|||||||
 Frog   131 REIMEEKKEEITGTLKRDKTLLRDDKKMEKLKQKLHTDDELNWLDPGRTLREQGVDENETLLLRR 195

Human   196 KFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGFQCQIQFGPHNEQKHKAGFL 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:|||||||.|||.|||
 Frog   196 KFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFDKACEFAGYQCQVQFGPHNEVKHKPGFL 260

Human   261 DLKDFLPKEYVKQKGERKIFQAHKNCGQMSEIEAKVRYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKL 325
            :|||||||||:|||||||||.||:.||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   261 ELKDFLPKEYIKQKGERKIFLAHRQCGNMSEIEAKARYVKLARSLKTYGVSFFLVKEKMKGKNKL 325

Human   326 VPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQ 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   326 VPRLLGITKECVMRVDEKTKEVIQEWNLTNIKRWAASPKSFTLDFGDYQDGYYSVQTTEGEQIAQ 390

Human   391 LIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTVLQQQYNRVGKVEHGSVALPAIMRS 455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||:|:|||||||||||||||||
 Frog   391 LIAGYIDIILKKKKSKDHFGLEGDEESTMLEDSVSPKKSTLLQQQFNQVGKVEHGSVALPAIMRS 455

Human   456 GASGPENFQVGSMPPAQQQITSGQMHRGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAVQAAQATLDDFDTLP 520
            ||||||||||||||.||||..|||||.|||||||||||||||||||||||:.|||||||||||||
 Frog   456 GASGPENFQVGSMPQAQQQTVSGQMHLGHMPPLTSAQQALTGTINSSMQAINAAQATLDDFDTLP 520

Human   521 PLGQDAASKAWRKNKMDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGDPAETDYTAVGCAVTTISSNLT 585
            |||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||:||:||||||||||||||||||
 Frog   521 PLGDDAASKAWRKNKMDNSKHEIHSQVDAITAGTASVVNLTAGNPADTDYTAVGCAVTTISSNLT 585

Human   586 EMSRGVKLLAALLEDEGGSGRPLLQAAKGLAGAVSELLRSAQPASAEPRQNLLQAAGNVGQASGE 650
            ||||||||||||:|||||:||.||.|||.||||||:||::|||||.||||.|:|||||||.||||
 Frog   586 EMSRGVKLLAALMEDEGGNGRQLLHAAKNLAGAVSDLLKTAQPASTEPRQVLMQAAGNVGMASGE 650

Human   651 LLQQIGESDTDPHFQ------------------DALMQLAKAVASAAAALVLKAKSVAQRTEDSG 697
            ||:||||.|||..||                  |.|:||||||||||||||||||:||:||:|..
 Frog   651 LLKQIGECDTDSQFQISAARATRGLTPLAEQKTDMLVQLAKAVASAAAALVLKAKNVAERTDDGA 715

Human   698 LQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLVEAGRLVAKAVEGCVSASQAATEDGQ 762
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:.|||:|||||.||:||.:|.:
 Frog   716 QQTQVIAAATQCALSTSQLVACTKVVAPTISSPVCQEQLLEAGKQVAKSVEGCVEASEAAVQDPE 780

Human   763 LLRGVGAAATAVTQALNELLQHVKAHATGAGPAGRYDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVRQAR 827
            ||:.||.||:|||||||:||||:|.||:|..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||
 Frog   781 LLKAVGVAASAVTQALNDLLQHIKKHASGGPPTGRYDQATDTILNVTENIFSSMGDAGEMVRQAR 845

Human   828 ILAQATSDLVNAIKADAEGESDLENSRKLLSAAKILADATAKMVEAAKGAAAHPDSEEQQQRLRE 892
            ||||||||||.|||||||.|||||||||||||||:||||||:|||||||||||||||||||:|||
 Frog   846 ILAQATSDLVGAIKADAERESDLENSRKLLSAAKLLADATARMVEAAKGAAAHPDSEEQQQKLRE 910

Human   893 AAEGLRMATNAAAQNAIKKKLVQRLEHAAKQAAASATQTIAAAQHAASTPKASAGPQPLLVQSCK 957
            ||||||||||||||||||||||.:||.|||||||||||||||||:|||:.|..|..|. ||||||
 Frog   911 AAEGLRMATNAAAQNAIKKKLVHKLEQAAKQAAASATQTIAAAQNAASSNKNPAAQQQ-LVQSCK 974

Human   958 AVAEQIPLLVQGVRGSQAQPDSPSAQLALIAASQSFLQPGGKMVAAAKASVPTIQDQASAMQLSQ 1022
            .||:|||:|||||||||:|||||||||:||:|||:|||||.|:|||.||:|||:.|.||||||.|
 Frog   975 VVADQIPMLVQGVRGSQSQPDSPSAQLSLISASQNFLQPGAKLVAAGKAAVPTVSDPASAMQLGQ 1039

Human  1023 CAKNLGTALAELRTAAQKAQEACGPLEMDSALSVVQNLEKDLQEVKAAARDGKLKPLPGETMEKC 1087
            |.|||.:||||||||||||.|||||||:||||::|::||:||||.:||||:|||:||||||||||
 Frog  1040 CTKNLASALAELRTAAQKAHEACGPLEIDSALNLVRSLEQDLQEARAAAREGKLQPLPGETMEKC 1104

Human  1088 TQDLGNSTKAVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAARDVAGGLRSLAQAARGVAALTSDPAVQAIVL 1152
            .||||:|||||||:|||||||:..|||||.|.||||||..|||||||:|||||.::|||||..:|
 Frog  1105 AQDLGSSTKAVSSSIAQLLGEIVHGNENYTGRAARDVAQALRSLAQASRGVAANSTDPAVQNAML 1169

Human  1153 DTASDVLDKASSLIEEAKKAAGHPGDPESQQRLAQVAKAVTQALNRCVSCLPGQRDVDNALRAVG 1217
            :.|.||:|||.:||||||:|.|.|.|||.|||||||||||:|||:|||:|||||||||.|::::|
 Frog  1170 ECAEDVMDKAGNLIEEAKRAVGKPTDPEGQQRLAQVAKAVSQALSRCVNCLPGQRDVDAAIKSIG 1234

Human  1218 DASKRLLSDSLPPSTGTFQEAQSRLNEAAAGLNQAATELVQASRGTPQDLARASGRFGQDFSTFL 1282
            :|||.||:.|.||.|..|||||.:||:|||||||:|.||||||||||||||:|||::..||:.||
 Frog  1235 EASKILLASSFPPGTKNFQEAQGQLNQAAAGLNQSANELVQASRGTPQDLAKASGKYSHDFNEFL 1299

Human  1283 EAGVEMAGQAPSQEDRAQVVSNLKGISMSSSKLLLAAKALSTDPAAPNLKSQLAAAARAVTDSIN 1347
            :||||||||:.::||:||||||||.||:|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
 Frog  1300 QAGVEMAGQSQNKEDQAQVVSNLKSISLSSSKLLLAAKALSADPAAPNLKSQLAAAARAVTDSIN 1364

Human  1348 QLITMCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLENPVQPINDMSYFGCLDSVMENSKVLGEAMTGISQ 1412
            ||||:|||||||||||||||||||||||||:||.:|:||.|||.||||||||||||||:|.||||
 Frog  1365 QLITVCTQQAPGQKECDNALRELETVRELLQNPTEPVNDQSYFHCLDSVMENSKVLGESMAGISQ 1429

Human  1413 NAKNGNLPEFGDAISTASKALCGFTEAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFARANQAIQMA 1477
            |||..||||||:::|.|||||||.||||||||||||||||||.|||||||:||||||||||||||
 Frog  1430 NAKTCNLPEFGESVSAASKALCGLTEAAAQAAYLVGVSDPNSHAGQQGLVDPTQFARANQAIQMA 1494

Human  1478 CQSLGEPGCTQAQVLSAATIVAKHTSALCNSCRLASARTTNPTAKRQFVQSAKEVANSTANLVKT 1542
            ||:||:|.|||:||||||||||||||||||:||:||..|:||.||||||||||||||||||||||
 Frog  1495 CQNLGDPACTQSQVLSAATIVAKHTSALCNACRVASTHTSNPVAKRQFVQSAKEVANSTANLVKT 1559

Human  1543 IKALDGAFTEENRAQCRAATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGRAAMEPIVISAKTML 1607
            ||||||||.::||.:||.||.||::||:||:||||||||:|:||||||||..||||||.:||.||
 Frog  1560 IKALDGAFNDDNRVKCRNATVPLIQAVENLTAFASNPEFASVPAQISPEGLRAMEPIVTAAKLML 1624

Human  1608 ESAGGLIQTARALAVNPRDPPSWSVLAGHSRTVSDSIKKLITSMRDKAPGQLECETAIAALNSCL 1672
            ||:.|||||||:||.||:|||.||||||||||||||||||||:||||||||.||:.||..||..:
 Frog  1625 ESSSGLIQTARSLAANPKDPPQWSVLAGHSRTVSDSIKKLITNMRDKAPGQRECDQAIELLNQSV 1689

Human  1673 RDLDQASLAAVSQQLAPREGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAARAEASQLGHKVSQMAQY 1737
            ||||||||.|:|||||||||||||||||||.|:|||||:||||:|.||||::|||||||||||||
 Frog  1690 RDLDQASLEAISQQLAPREGISQEALHTQMQTSVQEISNLIEPMAAAARADSSQLGHKVSQMAQY 1754

Human  1738 FEPLTLAAVGAASKTLSHPQQMALLDQTKTLAESALQLLYTAKEAGGNPKQAAHTQEALEEAVQM 1802
            |||||.||:||||||::|.|||.||||||||||||||:|||:||||||||.||||||||:||.||
 Frog  1755 FEPLTHAAIGAASKTINHQQQMNLLDQTKTLAESALQMLYTSKEAGGNPKVAAHTQEALDEAAQM 1819

Human  1803 MTEAVEDLTTTLNEAASAAGVVGGMVDSITQAINQLDEGPMGEPEGSFVDYQTTMVRTAKAIAVT 1867
            |.|||||||.||||||||||.|||||||||||||:|||.|.|||||||||||||||:||||||||
 Frog  1820 MHEAVEDLTVTLNEAASAAGAVGGMVDSITQAINKLDEEPAGEPEGSFVDYQTTMVKTAKAIAVT 1884

Human  1868 VQEMVTKSNTSPEELGPLANQLTSDYGRLASEAKPAAVAAENEEIGSHIKHRVQELGHGCAALVT 1932
            ||||||||.|:|:|||.||||||::||:||.||||||:.|||||||||||.|||||||.|:.|||
 Frog  1885 VQEMVTKSTTNPDELGTLANQLTNEYGQLAQEAKPAAMTAENEEIGSHIKQRVQELGHNCSLLVT 1949

Human  1933 KAGALQCSPSDAYTKKELIECARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIM 1997
            |||||||||:|:||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1950 KAGALQCSPNDSYTKKELIESARRVSEKVSHVLAALQAGNRGTQACITAASAVSGIIADLDTTIM 2014

Human  1998 FATAGTLNREGTETFADHREGILKTAKVLVEDTKVLVQNAAGSQEKLAQAAQSSVATITRLADVV 2062
            ||||||||||..|||||||||||||||.||||||||||||..|||||||||||||.||||||:.|
 Frog  2015 FATAGTLNRENAETFADHREGILKTAKALVEDTKVLVQNATSSQEKLAQAAQSSVTTITRLAETV 2079

Human  2063 KLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKVGDDPAVWQLKNSAKVMVTNVTS 2127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||:|:|||||||||||||||
 Frog  2080 KLGAASLGAEDPETQVVLINAVKDVAKALGDLISATKAAAGKSSDDPSVYQLKNSAKVMVTNVTS 2144

Human  2128 LLKTVKAVEDEATKGTRALEATTEHIRQELAVFCSPEPPAKTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAA 2192
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.:||||||||||||||||||||||||
 Frog  2145 LLKTVKAVEDEATKGTRALEATIEHIRQELAVFSSPEPPPQTSTPEDFIRMTKGITMATAKAVAA 2209

Human  2193 GNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRACKEAAYHPEVAPDVRLRALHYGRECANGYLELLDHVLLT 2257
            |||||||||||||||||||||||||:||||.|||||..|||:||..:|:|||.|||:||:||||.
 Frog  2210 GNSCRQEDVIATANLSRRAIADMLRSCKEAVYHPEVNADVRMRATRFGKECAIGYLQLLEHVLLI 2274

Human  2258 LQKPSPELKQQLTGHSKRVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKK 2322
            ||||||||||||..|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2275 LQKPSPELKQQLATHSKQVAGSVTELIQAAEAMKGTEWVDPEDPTVIAENELLGAAAAIEAAAKK 2339

Human  2323 LEQLKPRAKPKEADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANALDDG 2387
            |||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
 Frog  2340 LEQLKPRAKPKQADESLNFEEQILEAAKSIAAATSALVKAASAAQRELVAQGKVGAIPANADDDG 2404

Human  2388 QWSQGLISAARMVAAATNNLCEAANAAVQGHASQEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEA 2452
            |||||||||||||||||:|||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||.||||
 Frog  2405 QWSQGLISAARMVAAATSNLCEAANSAVQGHASEEKLISSAKQVAASTAQLLVACKVKADHDSEA 2469

Human  2453 MKRLQAAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFEEQENETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEE 2517
            |:|||.||||||||||||||||||||||::.: ||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2470 MRRLQVAGNAVKRASDNLVKAAQKAAAFQDHD-ETVVVKEKMVGGIAQIIAAQEEMLRKERELEE 2533

Human  2518 ARKKLAQIRQQQYKFLPSELRDE 2540
            ||||||.||||||||||||||::
 Frog  2534 ARKKLAMIRQQQYKFLPSELRED 2556

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TLN1NP_006280.3 FERM_F0_TLN1 2..85 CDD:340691 74/82 (90%)
FERM_F1_TLN1 86..197 CDD:340693 98/110 (89%)
B41 88..313 CDD:214604 201/224 (90%)
Interaction with LAYN. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P54939 280..435 148/154 (96%)
FERM_C_Talin 309..400 CDD:269973 90/90 (100%)
Helical bundle R1. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 482..655 152/172 (88%)
Talin_middle 491..652 CDD:462691 142/160 (89%)
ILWEQ 607..>759 CDD:214607 123/169 (73%)
Helical bundle R2. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 656..786 103/147 (70%)
Helical bundle R3. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 787..911 112/123 (91%)
Helical bundle R4. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 913..1044 99/130 (76%)
talin-RS 1043..1197 CDD:213393 114/153 (75%)
Helical bundle R5. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1046..1206 118/159 (74%)
talin-RS 1204..1351 CDD:213393 112/146 (77%)
Helical bundle R6. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1207..1357 114/149 (77%)
Interaction with SYNM. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18342854 1327..1948 516/620 (83%)
Helical bundle R7A. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1358..1453 79/94 (84%)
Interaction with VCL and F-actin. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1359..1659 247/299 (83%)
Helical bundle R8. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1461..1580 96/118 (81%)
Helical bundle R7B. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1581..1653 57/71 (80%)
talin-RS 1654..1826 CDD:213393 140/171 (82%)
Helical bundle R9. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1655..1822 136/166 (82%)
Helical bundle R10. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1823..1973 127/149 (85%)
VBS 1849..1973 CDD:430312 105/123 (85%)
Helical bundle R11. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 1974..2140 153/165 (93%)
Helical bundle R12. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 2141..2294 132/152 (87%)
Helical bundle R13. /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:P26039 2300..2482 173/181 (96%)
ILWEQ 2336..2532 CDD:214607 182/195 (93%)
tln1XP_031750909.1 FERM_F0_TLN1 2..85 CDD:340691 74/82 (90%)
FERM_F1_TLN1 86..197 CDD:340693 98/110 (89%)
FERM_M 201..313 CDD:459788 100/111 (90%)
FERM_C_Talin 309..400 CDD:269973 90/90 (100%)
Talin_middle 491..652 CDD:462691 142/160 (89%)
ILWEQ 607..>775 CDD:214607 121/167 (72%)
talin-RS 1671..1833 CDD:213393 131/161 (81%)
VBS 1866..1990 CDD:430312 105/123 (85%)
VBS 2028..2151 CDD:430312 112/122 (92%)
ILWEQ 2353..2548 CDD:214607 182/195 (93%)

Return to query results.
Submit another query.