DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TIAM1 and tiam1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003244.2 Gene:TIAM1 / 7074 HGNCID:11805 Length:1591 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_002938487.1 Gene:tiam1 / 734013 XenbaseID:XB-GENE-1006478 Length:1590 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:1606 Identity:1244/1606 - (77%)
Similarity:1383/1606 - (86%) Gaps:31/1606 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGNAESQHVEHEFYGEKHASLGRKHTSRSLRLSHK-TRRTRHASSGKVIHRNSEVSTRSSSTPSI 64
            |||||||:||...||::|.:|||||||||||:|:| :||||||||||.:|||||||.||||||||
 Frog     1 MGNAESQNVEQALYGKEHGTLGRKHTSRSLRISNKNSRRTRHASSGKPVHRNSEVSNRSSSTPSI 65

Human    65 PQSLAENGLEPFSQDGTLEDFGSPIWVDRVDMGLRPVSY-TDSSVTPSVDSSIVLTAASVQSMPD 128
            ||||||||:||:|||..|:||.|..|   |||||||||| ||||||||::||.||||||:|||.|
 Frog    66 PQSLAENGMEPYSQDANLDDFDSRDW---VDMGLRPVSYHTDSSVTPSLNSSTVLTAASMQSMQD 127

Human   129 TEESRLYGDDATYLAEGGRRQHSYTSNGPTFMETASFKKKRSKSADIWREDSLEFSLSDLSQEHL 193
            .|||||||:|.:|..:|..|...||:|||..::.|||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   128 CEESRLYGEDHSYFQDGNGRSQIYTTNGPNLLDAASFKKKRSKSADIWREDSLEFSLSDLSQEHL 192

Human   194 TSNEEILGSAEEKDCEEARGMETRASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKNSGVTANGGPGSKFAGYCR 258
            ||.||||.|.|||||||....|. .:..:|::.||||||.|||.|.|...:.||.|.|||..|||
 Frog   193 TSTEEILCSTEEKDCEETIIAEA-GNNAKLNSSQRANSLTDLYPQINPHASVNGAPRSKFMVYCR 256

Human   259 NLVSDIPNLANHKMPPAAAEETPPYSNYNTLPCRKSHCLSEGATNPQISHSNSMQGRRAKTTQDV 323
            ||||..|...|:||.|.:||||||||||:||||||||||||||.|.::||:|||.||||||||||
 Frog   257 NLVSHSPESENYKMDPTSAEETPPYSNYSTLPCRKSHCLSEGAANLKLSHTNSMHGRRAKTTQDV 321

Human   324 N-AGEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPTTGRAFVGSDSGSSSTGDAARQGVYENF 387
            | .||||||.|||||.||||||::|||||.|.||||||..|.|:|||||||||||..||||||||
 Frog   322 NTGGEGSEFTDSGIEAATTDTDIISRRSNITTSSYSPTASRVFIGSDSGSSSTGDVLRQGVYENF 386

Human   388 RRELEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSPGQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNK 452
            |||||||..:.|:||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   387 RRELEMSRASRENLEEASSALSDEQSSGTLSSPGQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNK 451

Human   453 KVESATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESDGRSGIDHNSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCL 517
            |||.|||||||.||||||||||||||:|||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   452 KVEPATRRKWKQYWVSLKGCTLFFYETDGRSGIDNNSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCL 516

Human   518 SNSLGDAFLFQTTSQTELENWITAIHSACATAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKK 582
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||::|||||||||||||||||||||
 Frog   517 SNSLGDAFLFQTTSQTELENWITAIHSACATTVARQHHKEDTVKLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKK 581

Human   583 MGEMQLSSVTDSKKKKTILDQIFVWEQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLAFASRPT 647
            |||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||
 Frog   582 MGEMQISSVTDAKKKKTILDQIFVWEQNLEQFQMDLFRYRCYLSSLQGGELPNPKRLLAFASRPT 646

Human   648 KVAMGRLGIFSVSSFHALVAARTGETGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKKKQGRPSI 712
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|:
 Frog   647 KVAMGRLGIFSVSSFHALVAARTGESGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTSSKKKQGRTSV 711

Human   713 NQVFGEGTEAVKKSLEGIFDDIVPDGKREKEVVLPNVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPA 777
            .|||.:|:|:||||||||||:.:.:.|:||||.|..||.||||.|||||:|.||||.||||:||.
 Frog   712 TQVFSDGSESVKKSLEGIFDETMSEEKKEKEVALSTVHPHNPDTDIWVHDYLTPSWVCLPNDQPV 776

Human   778 LTVVRPGDTARDTLELICKTHQLDHSAHYLRLKFLIENKMQLYVPQPEEDIYELLYKEIEICPKV 842
            |.|:.|.|.|:|.||:||||||||::::|||||||::|:.|:|:|:|||:|||||||||||||||
 Frog   777 LIVIHPDDMAKDALEIICKTHQLDYTSYYLRLKFLMDNQTQIYIPKPEEEIYELLYKEIEICPKV 841

Human   843 TQSIHIEKSDTAADTYGFSLSSVEEDGIRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILEINNRAADALN 907
            |:.|.:||...|::::||:||||||||...||||:|||:|||.|||||.|||::|||.:.|..||
 Frog   842 TKHIQLEKGGGASESFGFALSSVEEDGRHHLYVNNVKESGLAYKKGLKVGDEVMEINAKPARELN 906

Human   908 SSMLKDFLSQPSLGLLVRTYPELEEGVELLESPPHRVDGPADLGESPLAFLTSNPGHSLCSEQGS 972
            ||:||:.|.:.||.|.|||.|  :.|...||:.|.|.|  .|..:   ..|.||..   |||..|
 Frog   907 SSVLKNILCKSSLYLTVRTCP--DAGDCPLEALPRRSD--TDCND---FLLLSNRD---CSETDS 961

Human   973 SAETAPEETEGPDLESSDETDHSSKSTEQVAAFCRSLHEMNPSDQSPSPQDSTGPQLATMRQLSD 1037
            .:||||||.| ..|::.:|.|..:||||||||..||.||||..|...||.:..||.|||||||:|
 Frog   962 CSETAPEEIE-VQLDAPEEADSINKSTEQVAALRRSPHEMNSPDSCLSPSEFAGPALATMRQLTD 1025

Human  1038 ADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTL 1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1026 ADKLRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKEPFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTL 1090

Human  1103 EDGVRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKA 1167
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.|||
 Frog  1091 EDGVRLVPDLEKLEKVEQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDSNFKA 1155

Human  1168 FLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLRELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHIN 1232
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||::|||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1156 FLDAQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLKELYSLTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHIN 1220

Human  1233 EMQKIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFK 1297
            ||||||||:||||||||:||:||.||||||||||||||.||.|||||||||||||:||||.||||
 Frog  1221 EMQKIHEEYGAVFDQLISEQSGEVKEVADLSMGDLLLHNTVTWLNPPASLGKWKKDPELATFVFK 1285

Human  1298 TAVVLVYKDGSKQKKKLVGSHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVK 1362
            |||||||||.|||||||.||||.|::||.|||||||||||||||||.:.::|||.|:||||||||
 Frog  1286 TAVVLVYKDSSKQKKKLGGSHRASMFEDRDPFRFRHMIPTEALQVRTMTTSDAETNSVCEIVHVK 1350

Human  1363 SESEGRPERVFHLCCSSPESRKDFLKAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKG 1427
            |||||||||.||||||:|..:|:||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||
 Frog  1351 SESEGRPERAFHLCCSNPGRKKEFLRAVHSILRDKHRRQLLKTESLPNSQQYVPFGGKRLCALKG 1415

Human  1428 ARPAMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSASSPEKESQQ-----PP----GGGDTDRW 1483
            |||.|:|||||||:||. |||||.|||||||||::.::.|||:|.|     ||    ..||||||
 Frog  1416 ARPTMNRAVSAPSRSLA-RRRRLVRNRFTIDSDSIFSNDPEKDSDQETEPSPPQQSSNSGDTDRW 1479

Human  1484 VEEQFDLAQYEEQDDIKETDILSDDDEFCESVKGASVDRDLQERLQATSISQRERGRK---TLDS 1545
            |||||||||||||||:|||||||.|||:|||:||.|:::||.|:|:|||:|....|.|   |:::
 Frog  1480 VEEQFDLAQYEEQDDVKETDILSSDDEYCESIKGGSMEKDLSEQLEATSLSSNPMGTKVQNTMNT 1544

Human  1546 HASRMAQLKKQAALSGINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI 1591
            |||||||||||.|.||:||.:||.::|||||:||||.|.|||||||
 Frog  1545 HASRMAQLKKQTAFSGMNGSIESNTDEVIWVKREDFVPVRKLNTEI 1590

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TIAM1NP_003244.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..78 60/77 (78%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 298..379 63/81 (78%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 393..422 21/28 (75%)
PH1_Tiam1_2 432..558 CDD:269937 119/125 (95%)
Tiam_CC_Ex 572..669 CDD:408184 92/96 (96%)
Ubl1_cv_Nsp3_N-like 766..832 CDD:475130 42/65 (65%)
PDZ 858..>901 CDD:214570 31/42 (74%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 939..1034 44/94 (47%)
RhoGEF 1044..1233 CDD:214619 181/188 (96%)
PH2_Tiam1_2 1235..1406 CDD:269957 142/170 (84%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1456..1482 15/34 (44%)
tiam1XP_002938487.1 PH1_Tiam1_2 431..557 CDD:269937 119/125 (95%)
Tiam_CC_Ex 571..668 CDD:408184 92/96 (96%)
RBD 765..838 CDD:460485 49/72 (68%)
PDZ 841..924 CDD:214570 48/82 (59%)
RhoGEF 1032..1221 CDD:214619 181/188 (96%)
PH2_Tiam1_2 1223..1394 CDD:269957 142/170 (84%)

Return to query results.
Submit another query.