DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TIAM1 and Tiam1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_003244.2 Gene:TIAM1 / 7074 HGNCID:11805 Length:1591 Species:Homo sapiens
Sequence 2:XP_038944357.1 Gene:Tiam1 / 304109 RGDID:1307455 Length:1609 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1591 Identity:1513/1591 - (95%)
Similarity:1544/1591 - (97%) Gaps:1/1591 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


Human     1 MGNAESQHVEHEFYGEKHASLGRKHTSRSLRLSHKTRRTRHASSGKVIHRNSEVSTRSSSTPSIP 65
            |||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
  Rat    20 MGNAESQNVDHEFYGEKHASLGRKHTSRSLRLSHKTRRTRHASSGKAIHRNSEVSTRSSSTPSIP 84

Human    66 QSLAENGLEPFSQDGTLEDFGSPIWVDRVDMGLRPVSYTDSSVTPSVDSSIVLTAASVQSMPDTE 130
            |||||||||||||:|.|:|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:|
  Rat    85 QSLAENGLEPFSQEGALDDFGDPIWVDRVDMGLRPVSYTDSSVTPSVDGSIVLTAASVQSMPDSE 149

Human   131 ESRLYGDDATYLAEGGRRQHSYTSNGPTFMETASFKKKRSKSADIWREDSLEFSLSDLSQEHLTS 195
            |||||||||.|||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   150 ESRLYGDDAAYLAEGGRRQRPYTSNGPTFMETASFKKKRSKSADIWREDSLEFSLSDLSQEHLTS 214

Human   196 NEEILGSAEEKDCEEARGMETRASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKNSGVTANGGPGSKFAGYCRNL 260
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.::|:.|||||
  Rat   215 NEEILGSAEEKDCEEARGMETGASPRQLSTCQRANSLGDLYAQKNSGVKANGGPRNRFSSYCRNL 279

Human   261 VSDIPNLANHKMPPAAAEETPPYSNYNTLPCRKSHCLSEGATNPQISHSNSMQGRRAKTTQDVNA 325
            |||||:||.|||||||. |||.|||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.
  Rat   280 VSDIPDLAKHKMPPAAV-ETPTYSNYNTLPCRKSHCLSEGATNPQISLSKSMQGRRAKTTQDVNT 343

Human   326 GEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPTTGRAFVGSDSGSSSTGDAARQGVYENFRRE 390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   344 GEGSEFADSGIEGATTDTDLLSRRSNATNSSYSPPTGRAFVGSDSGSSSTGDAARQGVYENFRRE 408

Human   391 LEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSPGQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNKKVE 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   409 LEMSTTNSESLEEAGSAHSDEQSSGTLSSPGQSDILLTAAQGTVRKAGALAVKNFLVHKKNKKVE 473

Human   456 SATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESDGRSGIDHNSIPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCLSNS 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   474 SATRRKWKHYWVSLKGCTLFFYESDGRSGIDHNSVPKHAVWVENSIVQAVPEHPKKDFVFCLSNS 538

Human   521 LGDAFLFQTTSQTELENWITAIHSACATAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGE 585
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   539 LGDAFLFQTTSQTELENWITAIHSACAAAVARHHHKEDTLRLLKSEIKKLEQKIDMDEKMKKMGE 603

Human   586 MQLSSVTDSKKKKTILDQIFVWEQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLAFASRPTKVA 650
            ||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
  Rat   604 MQLSSVTDAKKKKTILDQIFVWEQNLEQFQMDLFRFRCYLASLQGGELPNPKRLLGFASRPTKVA 668

Human   651 MGRLGIFSVSSFHALVAARTGETGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKKKQGRPSINQV 715
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||
  Rat   669 MGRLGIFSVSSFHALVAARTGEIGVRRRTQAMSRSASKRRSRFSSLWGLDTTSKKKQGRPTINQV 733

Human   716 FGEGTEAVKKSLEGIFDDIVPDGKREKEVVLPNVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPALTV 780
            |||||:|||:||||||||.|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   734 FGEGTDAVKRSLEGIFDDSVPDGKREKEVVLPSVHQHNPDCDIWVHEYFTPSWFCLPNNQPALTV 798

Human   781 VRPGDTARDTLELICKTHQLDHSAHYLRLKFLIENKMQLYVPQPEEDIYELLYKEIEICPKVTQS 845
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||:|||||.|||||||||||||||||||||||||:
  Rat   799 VRPGDTARDTLELICKAHQLDHSAHYLRLKFLMENKMQFYVPQPEEDIYELLYKEIEICPKVTQN 863

Human   846 IHIEKSDTAADTYGFSLSSVEEDGIRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILEINNRAADALNSSM 910
            |||||||.|||.|||.||||:|||:||||||||||||||||||||||||||:||||||..|||||
  Rat   864 IHIEKSDAAADNYGFLLSSVDEDGVRRLYVNSVKETGLASKKGLKAGDEILQINNRAAGTLNSSM 928

Human   911 LKDFLSQPSLGLLVRTYPELEEGVELLESPPHRVDGPADLGESPLAFLTSNPGHSLCSEQGSSAE 975
            |||||||||||||||||||.|.||||||:||||||||.|||||||.||||||||||.||||||||
  Rat   929 LKDFLSQPSLGLLVRTYPEPEGGVELLENPPHRVDGPVDLGESPLTFLTSNPGHSLSSEQGSSAE 993

Human   976 TAPEETEGPDLESSDETDHSSKSTEQVAAFCRSLHEMNPSDQSPSPQDSTGPQLATMRQLSDADK 1040
            |||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||:|||.||||||:|.|||||.||||||||
  Rat   994 TAPEEGEGPDLESSDETDHSSKSTEQVTAFCRSLHEMSPSDSSPSPQDATSPQLATTRQLSDADK 1058

Human  1041 LRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDG 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1059 LRKVICELLETERTYVKDLNCLMERYLKPLQKETFLTQDELDVLFGNLTEMVEFQVEFLKTLEDG 1123

Human  1106 VRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKAFLD 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1124 VRLVPDLEKLEKVDQFKKVLFSLGGSFLYYADRFKLYSAFCASHTKVPKVLVKAKTDTAFKAFLD 1188

Human  1171 AQNPKQQHSSTLESYLIKPIQRILKYPLLLRELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQ 1235
            ||||:|||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1189 AQNPRQQHSSTLESYLIKPIQRVLKYPLLLRELFALTDAESEEHYHLDVAIKTMNKVASHINEMQ 1253

Human  1236 KIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTTVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFKTAV 1300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1254 KIHEEFGAVFDQLIAEQTGEKKEVADLSMGDLLLHTSVIWLNPPASLGKWKKEPELAAFVFKTAV 1318

Human  1301 VLVYKDGSKQKKKLVGSHRLSIYEDWDPFRFRHMIPTEALQVRALASADAEANAVCEIVHVKSES 1365
            ||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
  Rat  1319 VLVYKDGSKQKKKLVGSHRLSIYEEWDPFRFRHMIPTEALQVRALPSADAEANAVCEIVHVKSES 1383

Human  1366 EGRPERVFHLCCSSPESRKDFLKAVHSILRDKHRRQLLKTESLPSSQQYVPFGGKRLCALKGARP 1430
            |||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
  Rat  1384 EGRPERVFHLCCSSPESRKDFLKSVHSILRDKHRRQLLKTESLPSAQQYVPFGGKRLCALKGARP 1448

Human  1431 AMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFTIDSDAVSASSPEKESQQPPGGGDTDRWVEEQFDLAQYEE 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||||||||||||
  Rat  1449 AMSRAVSAPSKSLGRRRRRLARNRFTIDSDAISASSPEKEPQQPPGGGDTDRWVEEQFDLAQYEE 1513

Human  1496 QDDIKETDILSDDDEFCESVKGASVDRDLQERLQATSISQRERGRKTLDSHASRMAQLKKQAALS 1560
            |||||||||||||||||||.||||||.||||:|||.|||||.|||||||||||||.|||||||||
  Rat  1514 QDDIKETDILSDDDEFCESAKGASVDIDLQEQLQAASISQRARGRKTLDSHASRMTQLKKQAALS 1578

Human  1561 GINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI 1591
            |||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat  1579 GINGGLESASEEVIWVRREDFAPSRKLNTEI 1609

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TIAM1NP_003244.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..78 73/76 (96%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 298..379 76/80 (95%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 393..422 28/28 (100%)
PH1_Tiam1_2 432..558 CDD:269937 123/125 (98%)
Tiam_CC_Ex 572..669 CDD:408184 94/96 (98%)
Ubl1_cv_Nsp3_N-like 766..832 CDD:475130 62/65 (95%)
PDZ 858..>901 CDD:214570 38/42 (90%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 939..1034 83/94 (88%)
RhoGEF 1044..1233 CDD:214619 186/188 (99%)
PH2_Tiam1_2 1235..1406 CDD:269957 166/170 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1456..1482 23/25 (92%)
Tiam1XP_038944357.1 PH1_Tiam1_2 450..576 CDD:269937 123/125 (98%)
Tiam_CC_Ex 590..687 CDD:408184 94/96 (98%)
Ubl1_cv_Nsp3_N-like 784..850 CDD:475130 62/65 (95%)
PDZ 860..>919 CDD:214570 51/58 (88%)
RhoGEF 1062..1251 CDD:214619 186/188 (99%)
PH2_Tiam1_2 1253..1424 CDD:269957 166/170 (98%)

Return to query results.
Submit another query.