DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mast3 and dop

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_038950759.1 Gene:Mast3 / 688540 RGDID:1587639 Length:1337 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_001261884.1 Gene:dop / 39686 FlyBaseID:FBgn0267390 Length:2139 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1748 Identity:654/1748 - (37%)
Similarity:849/1748 - (48%) Gaps:505/1748 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     5 SLLRR----------RGLQKELSLPRRGRGLSPSSQSPCLLS---------------PGSPCSPC 44
            :|||:          |.:..|.|...|.|..|....:|||..               ||...|| 
  Fly   202 ALLRKISYQQHTNSLRAVSGETSNLLRMRHSSLGKSAPCLTGNYFRHELTAPLPVQPPGFGASP- 265

  Rat    45 SPSLG---LQQPWSC---------------------------------RSG---NRKSLVVGTPS 70
               ||   :.:..||                                 .||   :|.|||..:.:
  Fly   266 ---LGGHNISRSGSCAGIGLAKHHHHHHLHGVVMRGSAGGGAGSGGGSSSGVAHHRLSLVTNSAA 327

  Rat    71 PTL---SRPLSPLSVPTAGNSPLDSPRNFSAAAAINFPFARRQLSHSDRADGRRWSLASLPSSGY 132
            ...   ||..||.|.     ||:||||..|.......|..|........|||||||:||||||||
  Fly   328 VAAAGGSRTHSPYSA-----SPVDSPRLNSPMPFAFAPIKRIASCRGVVADGRRWSVASLPSSGY 387

  Rat   133 GTNTPSSTVSSSSSSRERLHQL-----PFQPTADE---------LRFLSKH-------------- 169
            ||...||.:||..||:|.|:||     |....||.         ...|.:|              
  Fly   388 GTTPGSSNLSSQCSSQEGLNQLAHNIPPGVQEADAAAVAAGACCAEHLKQHCPKHCALLLAVSQK 452

  Rat   170 ------------------------------------------------FRSSESVVDEDGGR-SP 185
                                                            ..||.|...:.||| ||
  Fly   453 QLTPQPPKPTQLQPQKSMTAACVNCCAELSVTCGGQQAGGGAANGGSSANSSGSSAMQVGGRMSP 517

  Rat   186 RLRPRSRSLSPGRTSGTFDNEIVMMNHVYRERFPKATAQMEGRLQDFLAAFAPGDRLALADG--V 248
            ..||||||||....|...||||.:||.:|:|||||||.|||.||:.|:.........:..|.  :
  Fly   518 YFRPRSRSLSSPSRSPIVDNEIAVMNTLYKERFPKATQQMEERLKLFINENKSAACNSFRDSQPI 582

  Rat   249 LGFIHHQIVELARDCLAKSGEALVTSRYFLEMQDKLERLLQDAHERSD--SAEVGFIVQLVRKLL 311
            :.|:|||::|:|||||.||...|:||:||.|:.:.|||||.:..|:|.  :||:..:   ::|||
  Fly   583 VRFVHHQVLEMARDCLHKSEAKLITSQYFYELSENLERLLVETKEKSPEAAAELNGV---IKKLL 644

  Rat   312 IIISRPARLLECLEFDPEEFYHLLEAAEGQAREDQGVKTDLPRYIIRQLGLAKDPLEEIQ----- 371
            :||||||||||||||||:|||.|||||||.|:....:|.|:|:|||.:|||.:||:.|:|     
  Fly   645 LIISRPARLLECLEFDPQEFYELLEAAEGHAKAMPVIKADIPQYIIHKLGLNRDPIAELQQELRE 709

  Rat   372 --------------------------PLND--------------LDEG-------QPP------- 382
                                      ||..              :|.|       |||       
  Fly   710 TQQMCSEQVTVDADPLHPGGSLLLNSPLTSAAKQLSSLALDAIAMDSGSGTATPQQPPQTPVATC 774

  Rat   383 --AP--------------GSPESRGLG----------------------GPSRRQPCESDFETIK 409
              ||              ||..:.|.|                      |..:..|.|:||:.:|
  Fly   775 DTAPSFALAISQMNEEKGGSSSAVGGGSSSKVAGAEGITGGSAATATGSGAQQPSPQENDFDIVK 839

  Rat   410 LISNGAYGAVYLVRHRDTRQRFAIKKINKQNLILRNQIQQVFVERDILTFAENPFVVGMFCSFET 474
            |||||||||||||:|:.||||||:|||||.|||||||::|||.|||||:||:|||||.|:|||||
  Fly   840 LISNGAYGAVYLVKHKTTRQRFAMKKINKNNLILRNQVEQVFAERDILSFADNPFVVSMYCSFET 904

  Rat   475 RRHLCMVMEYVEGGDCATLLKNMGPLPVDMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSL 539
            ::|||:||||||||||.|||||:||||.||||.||||||||:||||:||||||||||||||||:|
  Fly   905 KKHLCLVMEYVEGGDCGTLLKNIGPLPADMARFYFAETVLAVEYLHSYGIVHRDLKPDNLLITAL 969

  Rat   540 GHIKLTDFGLSKIGLMSMATNLYEGHIEKDAREFVDKQVCGTPEYIAPEVIFRQGYGKPVDWWAM 604
            ||||||||||||:||||:|||||||:|:.:.|:|.||||.|||||||||||.|||||||||||:|
  Fly   970 GHIKLTDFGLSKMGLMSLATNLYEGYIDSETRQFSDKQVYGTPEYIAPEVILRQGYGKPVDWWSM 1034

  Rat   605 GVILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVVSDEIMWPEGDE-ALPPDAQDLITRLLRQSPMDRLGT-G 667
            |:||||||:|||||||:|.||||...|:|:|.||:.:: .:..:|:|:|::||:|:|.||||| .
  Fly  1035 GIILYEFLIGCVPFFGETTEELFAHTVNDDIEWPDSEDWPVQAEAKDIISQLLQQNPRDRLGTQS 1099

  Rat   668 GTHEVKQHPFFLALDWAGLLRHKAEFVPQLEAEDDTSYFDTRSERYRH-LGSEGDETNDEESSTE 731
            |..|:|:|.:||.:||..|||.||||||||..:|||||||||.:||.| ||  |::|:|.:.:..
  Fly  1100 GALEMKEHEYFLGMDWNSLLRQKAEFVPQLSHDDDTSYFDTRMDRYNHDLG--GEDTDDTDDTPV 1162

  Rat   732 IPQFSSCSHRFSKV-YSSSEFLA---------VQPNPTFAERSFSEDR----------------E 770
            ...|:|.:.::.|. ||.|....         ..|.|..:..|.:::.                :
  Fly  1163 FGSFNSYTPQYRKQHYSWSRHATPTSTDGAKPTGPPPLSSLPSRAQETPAATVGATSTGALPKLK 1227

  Rat   771 EGW---EQSGEGDGGRRLSTD---------LRLRSWTPASSCQPSSCQSDRGPSPSLLSTIS--- 820
            .|.   ..||.|.|....|.|         .:||....:|||.......|....|.||..::   
  Fly  1228 SGMGSGSGSGSGSGSGSASHDGVVNKFLNTPQLRKLDLSSSCLKVPSTPDADYLPELLHNVTIGN 1292

  Rat   821 ---LDMPKFAFSSEDEGA-------GSGPADTRKPVFILGEPDPPPPT--------TPVTPKPCN 867
               |.|.|......:.||       .|.|.:|   ..|:..|..||||        ||.|....:
  Fly  1293 DAELRMLKHYLQQPNPGATQRMQQRHSMPPNT---TTIISTPATPPPTQTQATMAATPPTATVGS 1354

  Rat   868 LSADTAVLSHA-------RLRSNSTG--ARHSTPR--------PLDAGRG--RRLGSSRDPGP-- 911
            .|..|...|..       ::.....|  ||...||        .:.||..  ..:...|:..|  
  Fly  1355 FSRSTPESSQTDSDDFSPQINRKRKGVCARDILPRFSISIEDETISAGSSSTENMNLPREQSPLA 1419

  Rat   912 --EKPRASPGGSGG---------RVPKSASVSALSLIITADDGSGGP----LMSPLSPRSLSSNP 961
              .:|::..|.:.|         .:.||||...|||:.:.|:.....    :.||....:.||..
  Fly  1420 LQHQPKSMDGSTSGSSVKHHRSRSIVKSASALGLSLMTSLDNSQLAAQLCGIQSPGGGGNGSSTA 1484

  Rat   962 SSRDSSPSRDPSPVCGSLRPPIVIHSSGKKYGFSLRAIRVYMGDSDVYTVHHVVWSVEEGSPAQE 1026
            ||||:||.|:.||:..:|:|||:|....:.:||::..||||.||:|.||:||:|.:|:|||||.|
  Fly  1485 SSRDTSPCRELSPLVTNLKPPIIIRRGPRGFGFTVHTIRVYYGDTDFYTMHHLVMAVDEGSPAFE 1549

  Rat  1027 AGLRAGDLITHINGESVLGLVHMDVVELLLKSGNKISLRTTALENTSIKVGPARKNVAKGRMA-- 1089
            ||||..|||||:|||:|.||.|..|::|||..|..::||.|.||:|||:.|..::::.:.::|  
  Fly  1550 AGLRPADLITHVNGEAVQGLFHTQVLQLLLSGGEHVTLRATPLEHTSIQSGGRKRDLMQSKLAKK 1614

  Rat  1090 ---RRSKRSRRRETQDRRKSLFKRISK-------------------PS--------SVLHTS--R 1122
               |:.|:::|...:.|:.|||:|||.                   ||        |..|:|  :
  Fly  1615 GVNRQKKQTKREHDKKRKTSLFRRISSKRANAEMQQYSAGTSSPTTPSARNLSPLDSSYHSSCCQ 1679

  Rat  1123 SFSSGLQHSLSSSESLPGSPTHS-------------LSPSPTTPCRSPAPDVPTDTASPPSV--- 1171
            |.::....|.|.|.|.|.:||.|             ::||..: .:.|:...||.....|.|   
  Fly  1680 SAANSSSQSTSPSSSSPNTPTGSSGSNHGGNAGSVAVAPSALS-VQLPSAPPPTQLVLLPHVGAV 1743

  Rat  1172 ---SPSS--SSPASPATG-----HTRPSSLHGLAAKL----------GPPRHKSG---------- 1206
               :|:|  :.|.|| ||     :.|||:||||..||          |...:.:|          
  Fly  1744 VGSNPTSVGNVPVSP-TGVVPQLYQRPSTLHGLKHKLHAATAVIAGGGNANNPAGGLKTLHTTNN 1807

  Rat  1207 -----RRKSTSSIPPSPLACPPVPTP----PPRSPSPLP----GHIP--------------IP-- 1242
                 ||||...||.||||..|.|:|    |.||||||.    ||.|              :|  
  Fly  1808 NSLPNRRKSVGHIPLSPLARTPSPSPLPSSPTRSPSPLAFPLVGHQPGASNTTQSYSPGSTLPTL 1872

  Rat  1243 -------------AR-------SPRLRRGQSADKLGLGTSERLDGDGGRRGRGAETEL 1280
                         ||       ||.|||..|.|:|              ..|.|||::
  Fly  1873 QTAVNANTKKAGFARTKSAEPSSPLLRRALSPDRL--------------HPRSAETKI 1916

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mast3XP_038950759.1 DUF1908 89..369 CDD:401031 146/360 (41%)
STKc_MAST 404..683 CDD:270760 206/280 (74%)
PDZ_signaling 987..1064 CDD:238492 42/76 (55%)
dopNP_001261884.1 DUF1908 344..702 CDD:286070 146/360 (41%)
STKc_MAST 834..1115 CDD:270760 206/280 (74%)
S_TKc 835..1110 CDD:214567 203/274 (74%)
PDZ_signaling 1506..1587 CDD:238492 44/80 (55%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166347619
Domainoid 1 1.000 441 1.000 Domainoid score I522
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG0606
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 977 1.000 Inparanoid score I297
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D164781at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001156
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45536
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100724
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24356
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X479
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1211.890

Return to query results.
Submit another query.